由于三維基因組結(jié)構(gòu)在基因調(diào)控和細(xì)胞功能中起到了關(guān)鍵性作用,因此了解染色質(zhì)是如何在細(xì)胞核內(nèi)組織,以及這種三維結(jié)構(gòu)如何影響基因調(diào)控、決定細(xì)胞命運(yùn)和推動(dòng)物種演變是當(dāng)前生命科學(xué)研究的主要命題之一.本綜述首先描述了與基因組三維結(jié)構(gòu)密切相關(guān)的主要染色質(zhì)構(gòu)象捕獲技術(shù),然后介紹了常用的基因組三維結(jié)構(gòu)重構(gòu)算法和相關(guān)可視化工具,最后結(jié)合應(yīng)用闡述三維基因組研究目前存在的問題和未來的發(fā)展方向. 

【文章來源】：中國(guó)科學(xué):生命科學(xué). 2020,50(05)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：13 頁

【文章目錄】：
1 染色質(zhì)空間構(gòu)象捕獲技術(shù)
2 交互數(shù)據(jù)模擬染色質(zhì)空間構(gòu)建方法
    2.1 基于熱動(dòng)力學(xué)(TB)建模
    2.2 基于約束的(RB)建模
    2.3 混合模型和基于機(jī)器學(xué)習(xí)的模型
3 染色質(zhì)三維空間模型可視化工具
4 染色質(zhì)空間結(jié)構(gòu)的生物學(xué)意義
    4.1 染色質(zhì)空間結(jié)構(gòu)與基因表達(dá)的關(guān)系
    4.2 染色質(zhì)空間結(jié)構(gòu)與進(jìn)化的關(guān)系
5 總結(jié)


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]三維基因組數(shù)據(jù)分析方法進(jìn)展[J]. 張祥林,方歡,汪小我.  生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2018(11)
[2]染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)重建及其生物學(xué)意義[J]. 彭城,李國(guó)亮,張紅雨,阮一駿.  中國(guó)科學(xué):生命科學(xué). 2014(08)
[3]起航三維基因組學(xué)研究[J]. 李國(guó)亮,阮一駿,谷瑞升,杜生明.  科學(xué)通報(bào). 2014(13)



本文編號(hào)：3176560