發(fā)布時間：2021-03-23 00:58

　　多聚半乳糖醛酸酶（Polygalacturonases,PGs）是一種果膠水解酶,參與果實成熟、器官脫落、花粉成熟等多個植物發(fā)育過程。采用相似性比對和結(jié)構(gòu)域搜索方法,從蒺藜苜蓿基因組中共鑒定出74個MtPG基因。根據(jù)系統(tǒng)進化關(guān)系將其分為6個亞家族,分別包含9、7、4、11,18和25個MtPG基因家族成員。染色體定位分析發(fā)現(xiàn),MtPG基因在蒺藜苜蓿的8條染色體上呈現(xiàn)不均勻分布,每條染色體上分布有2-16個MtPG基因;同時,基因組復制分析結(jié)果顯示,蒺藜苜蓿的PG基因家族成員之間存在大量的基因復制。最后,通過蒺藜苜蓿的高通量測序數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn),MtPG基因家族廣泛地在根部、結(jié)瘤、葉片、芽,心皮和花等組織中表達。根據(jù)它們在不同組織中表達水平,將31個MtPG基因聚類為4組,分別探討了四組基因在蒺藜苜蓿組織器官分化中表達模式,重點解析了它們在花器官發(fā)育以及根部組織分化中可能的調(diào)控機制,這將為進一步研究蒺藜苜蓿MtPG基因家族成員的基因功能提供了理論基礎(chǔ)。 

【文章來源】：生物信息學. 2020,18(01)

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

蒺藜苜蓿PG基因在染色體定位

蒺藜苜蓿PG基因表達的聚類分析

為了探究蒺藜苜蓿PG基因家族擴增和進化的機制,本研究對蒺藜苜蓿PG基因進行染色體定位分析。通過提取蒺藜苜蓿PG基因的染色體定位信息發(fā)現(xiàn),73個MtPG基因(MtPG50除外)定位在8條染色體上,如圖2所示。圖中結(jié)果顯示,這些MtPG基因在染色體上不是均勻分布,其中,8號和2號染色體上分布成員最多,分別為16個和15個,6號染色體最少,只有2個MtPG基因。此外,這些MtPG基因在單條染色體上也不是均勻分布,呈現(xiàn)明顯的聚集分布,如1號和8號染色體上都形成了MtPG基因簇。通過比對發(fā)現(xiàn),這些MtPG基因簇都是基因復制形成的;同時,染色體之間也存在MtPG基因間的復制事件,這些復制事件可能是MtPG基因家族的主要擴增動力。2.4 蒺藜苜蓿PG基因家族的表達分析


本文編號：3094816