甘蔗（Saccharum spp.）是世界上最重要糖料、生物燃料作物,是研究C₄光合作用途徑和同源多倍體遺傳的模式植物,具有巨大的經(jīng)濟(jì)和科研價(jià)值。在過去的數(shù)年中,甘蔗的測(cè)序及分析數(shù)據(jù)迅速積累,為本研究的順利開展奠定了基礎(chǔ)。使用Tripal工具構(gòu)建甘蔗割手密基因組數(shù)據(jù)庫(kù)（http://www.sugarcanetf.site/sgd/html/index.html）作為甘蔗研究的中心門戶對(duì)這些數(shù)據(jù)進(jìn)行存儲(chǔ)、挖掘、分析、整合以及共享。研究主要結(jié)果如下:（1）甘蔗割手密基因組數(shù)據(jù)的開發(fā)使用BLAST2GO和EggNOG,對(duì)甘蔗中99,708個(gè)基因進(jìn)行GO項(xiàng)目注釋,65,277個(gè)基因進(jìn)行KEGG生物通路注釋。對(duì)甘蔗割手密預(yù)測(cè)基因中的1,278個(gè)特異性基因家族進(jìn)行GO富集,發(fā)現(xiàn)這些基因的功能大多富集在對(duì)傷口、外部刺激的反應(yīng)。使用MISA軟件對(duì)甘蔗割手密進(jìn)行全基因組SSR開發(fā),共發(fā)現(xiàn)577,299個(gè)SSR位點(diǎn),其中染色體特異性位點(diǎn)有98,271個(gè),約占總數(shù)的17%。將其與其他四種禾本科植物中的基因組SSR進(jìn)行比較,發(fā)現(xiàn)在禾本科植物中,SSR的豐度與其基因組大小成正比,而SSR... 

【文章來源】：福建農(nóng)林大學(xué)福建省

【文章頁(yè)數(shù)】：79 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

甘蔗屬及其近緣屬在禾本科中的分類位置

圖 1-2 玉米和高粱中 NADP-ME 類型的 C4光合代謝[29]Fig. 1-2 The NADP-ME type of C4pathway in maize and sorghum[29]1.2.2 糖轉(zhuǎn)運(yùn)糖是綠色植物光合作用的主要產(chǎn)物，其在植物體內(nèi)有多種存儲(chǔ)形式，如：蔗糖、單糖、糖醇等。糖在植物的生命活動(dòng)中起著重要作用，具體表現(xiàn)在為植物生長(zhǎng)發(fā)育供能、作為信號(hào)分子參與代謝、用于儲(chǔ)存及運(yùn)輸?shù)确矫妗Ｔ趯?duì)高等植物研究中，我們將輸出、接受同化產(chǎn)物的器官稱為植物的“庫(kù)”“源”。每個(gè)能夠進(jìn)行光合作用的綠色植物體內(nèi)都存在著庫(kù)源系統(tǒng)對(duì)糖分進(jìn)行運(yùn)輸和分配，糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白在維持庫(kù)源平衡中起著重要作用[30]。其作用的方式主要有：調(diào)節(jié)蔗糖轉(zhuǎn)運(yùn)[31-33]、降低糖醇含量[34-36]、降低單糖含量[37]以及傳導(dǎo)復(fù)合體的裝運(yùn)等。按照糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白運(yùn)輸產(chǎn)物的不同，研究人員一般將其分為在葡萄糖、己糖等轉(zhuǎn)運(yùn)過程中發(fā)揮作用的單糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白，以及在多元糖等轉(zhuǎn)運(yùn)過程中發(fā)揮作用的多糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白。1989年Sauer等人從小球藻中克隆出歷史上第一個(gè)編碼單糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的基因HUP 1[38]。自第一個(gè)單糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因在低等單細(xì)胞生物中被成功鑒定后，研究者便開始嘗

甘蔗割手密基因組數(shù)據(jù)庫(kù)的搭建溶性多糖形式存儲(chǔ)碳，如淀粉或纖維素。甘蔗的另一個(gè)獨(dú)特之處在于：蔗糖的儲(chǔ)存發(fā)生在莖的薄壁細(xì)胞中，而其他大多數(shù)植物則是發(fā)生在莖、谷粒、肉質(zhì)果實(shí)之類的終端類庫(kù)組織。對(duì)甘蔗中編碼糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的基因從全基因組及演化方面進(jìn)行探究有利于推動(dòng)其代謝機(jī)制的研究，并最終達(dá)到提高產(chǎn)量提升經(jīng)濟(jì)效益的目的。

【參考文獻(xiàn)】：
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碩士論文
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本文編號(hào)：2997279