乳酸乳球菌乳酸亞種（Lactococcus lactissubsp.lactis,L.lactissubsp.lactis）是乳球菌屬的模式種,既是自然發(fā)酵乳中常見乳酸菌,也是生產(chǎn)奶酪和低溫發(fā)酵乳等發(fā)酵乳制品常用的發(fā)酵劑菌種之一。L.lactis subsp.lactis具有廣泛的應用前景和較高的經(jīng)濟價值。系統(tǒng)解析L.lactis subsp.lactis的遺傳背景、進化歷程和功能特征對開發(fā)利用L.lactis subsp.lactis有著極為重要的意義。但從群體基因組水平解析L.lactis subsp.lactis遺傳背景和功能特征的研究鮮有報道。本研究采用Illumina Hiseq高通量測序平臺完成了 227株分離自自然發(fā)酵乳制品中的L.lactis subsp.lactis基因組重測序技術(shù),結(jié)合NCBI已公布的89株全基因組序列,利用群體遺傳學手段解析了L.lactis subsp.lactis群體的遺傳背景、系統(tǒng)發(fā)育關系和種群結(jié)構(gòu),揭示了不同遺傳譜系菌株的功能特征,利用全基因關聯(lián)分析（genome-wide association analysis,GWAS）在基因組中對與... 

【文章來源】：內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學內(nèi)蒙古自治區(qū)

【文章頁數(shù)】：87 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖２?２２７株菌株所有變異位點在基因組上的分布圖??

翻P分布規(guī)律直方圈

圖６?２２７株菌株群體的ｌｇ（Ｋａ／Ｋｓ）值和Ｔａｊｉｍａ’ｓ?Ｄ值在基因組上的分布??Ｆｉｇｕｒｅ．６．?Ｔｈｅ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｌｇ（Ｋａ／Ｋｓ）?ａｎｄ?Ｔａｊｉｍａ＇ｓ?Ｄ?ｖａｌｕｅｓ?ｏｎ?ｔｈｅ?ｇｅｎｏｍｅ?ｏｆ?２２７?ｓｔｒａｉｎｓ??

【參考文獻】：
期刊論文
[1]細菌全基因組關聯(lián)研究的方法與應用[J]. 楊超,楊瑞馥,崔玉軍.  遺傳. 2018(01)
[2]群體基因組學在乳酸菌研究中的應用[J]. 孫志宏.  中國食品學報. 2017(08)
[3]傳統(tǒng)發(fā)酵乳制品中微生物多樣性研究[J]. 李偉程,侯強川,于潔,孫志宏,孫天松.  食品工業(yè)科技. 2018(01)
[4]自然發(fā)酵乳制品中乳酸菌的生物多樣性[J]. 張和平.  生命科學. 2015(07)

博士論文
[1]德氏乳桿菌保加利亞亞種的群體遺傳學和功能基因組學研究[D]. 宋宇琴.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2018
[2]自然發(fā)酵乳中嗜熱鏈球菌群體遺傳學和功能基因組學研究[D]. 趙潔.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2018
[3]高黏附力重組乳酸乳球菌靶向投遞KiSS1蛋白對結(jié)直腸癌細胞的抑制作用研究[D]. 張博.中國農(nóng)業(yè)大學 2017



本文編號：3316285