pH對釀酒酵母轉錄組的影響
發(fā)布時間:2021-03-26 06:15
為研究不同pH對釀酒酵母基因表達的影響,選用了 Pach培養(yǎng)基和麥芽汁培養(yǎng)基,在5L的發(fā)酵罐中分別在pH3.0、4.0、4.5、5.0、5.5、6.0、6.5、7.0、8.0、9.0條件下進行有氧培養(yǎng),通過測序分析了不同pH條件下釀酒酵母的轉錄組。結果表明:在Pach培養(yǎng)基中,pH3.0與其它pH間差異表達的基因有 1416、1363、2026、3324、1925、3025、3159、3626、3104個。在 GO 數(shù)據(jù)庫分別注釋到 1654、1817、1544、1993、2259、2162、1619、2392、2113 個功能。在 KEGG數(shù)據(jù)庫定位到 485、532、712、1217、795、1171、955、899、1111個代謝途徑;在麥芽汁培養(yǎng)基中,pH3.0與其它pH間差異表達的基因有 1658、1824、1547、2003、2268、2169、1621、2405、2118 個。在 GO 數(shù)據(jù)庫分別注釋到 1654、1817、1544、1993、2259、2162、1619、2392、211 3 個功能。在 KEGG 數(shù)據(jù)庫中定位到 612、673、575、695、830、...
【文章來源】:內蒙古農業(yè)大學內蒙古自治區(qū)
【文章頁數(shù)】:48 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1生長曲線??Fig.?1?growth?curve??
?內蒙古農業(yè)大學碩士學位論文?11_??麥芽汁培養(yǎng)基??1400?:?5!差異基因總數(shù)?1注釋到GO的數(shù)目?4注釋到KEGG的數(shù)目??1200?g三??1000?g=?|=?H?二?{二?丨?|?=??<c?800?p?li?P?P?P養(yǎng)三謹至量巨??1?-?It?I?P?A?P?P?P?I?II??:il!llJlfcyll?ill??^?^?^?^?^?^??圖3上調基因數(shù)目??Fig.?3?Number?of?up-regulated?differentially?expressed?genes??3.2.4下調基因數(shù)目統(tǒng)計??將條件為pH3.0的樣品與其它pH條件下的樣品進行差異表達分析,通過篩癬??統(tǒng)計得到下調基因的數(shù)目并將注釋到GO、KEGG數(shù)據(jù)庫中,數(shù)目統(tǒng)計結果如圖4所??示,在Pach培養(yǎng)基中,下調的差異基因總數(shù)是12189個,在GO上注釋到的功能數(shù)??12152個,在KEGG上注釋到的途徑共3521個。在麥芽汁培養(yǎng)基中,下調的差異基??因總數(shù)是8422個,在GO上注釋到的功能數(shù)8402個,在KEGG上注釋到的途徑共??3149?個。??Pach培養(yǎng)基??2500?:?*差異基因總數(shù)=■注釋到GO的數(shù)目注釋到KEGG的數(shù)目??蠢?IS?I—?P?I?P?!?P?P??:I?Jy?11?Jy?11II??/?/■?/■?/■?/■?/??/■?/■??/?/?/?/?/?/?/?/?/??
V2.?pH對釀酒酵母轉錄組的影響???麥芽汁培養(yǎng)基??1600?--?*差異基因總數(shù)?=■注釋到GO的數(shù)目?I注釋到KEGG的數(shù)目??1400?g二??1200?i|i?=??1000?_?i?三?S?二?匿巨?a-??=lliil?111??^?^?^?^?^?^?^??#?#?#?P?<s??4?#??f?f?f?穿?f?f?/_?f?/'??圖4下調基因數(shù)目??Fig.4?Number?of?down-regulated?differentially?expressed?genes??3.3?pH對乙醛酸循環(huán)相關基因表達量的影響??3.3.1?pH對異檸檬酸裂解酶基因表達量的影響??300?50??幾?-??Pach培養(yǎng)基-*麥芽汁培養(yǎng)基??幺?45??250?40??I?200?35?|??S:?30?菡??m?1??f?150?25?I??室?*?*?4?20?£??S?l〇〇?A?*?1c;銖??^?*?4?15?M??50???4?4?10??修奐?I?5??〇?*???????0??2.0?3.0?4.0?5.0?6.0?7.0?8.0?9.0?10.0??培養(yǎng)基pH??圖5不同初始pH條件下異檸檬酸裂解酶基因表達量??Fig.?5?The?ICL?gene?expression?in?different?pH?conditions??
本文編號:3101111
【文章來源】:內蒙古農業(yè)大學內蒙古自治區(qū)
【文章頁數(shù)】:48 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1生長曲線??Fig.?1?growth?curve??
?內蒙古農業(yè)大學碩士學位論文?11_??麥芽汁培養(yǎng)基??1400?:?5!差異基因總數(shù)?1注釋到GO的數(shù)目?4注釋到KEGG的數(shù)目??1200?g三??1000?g=?|=?H?二?{二?丨?|?=??<c?800?p?li?P?P?P養(yǎng)三謹至量巨??1?-?It?I?P?A?P?P?P?I?II??:il!llJlfcyll?ill??^?^?^?^?^?^??圖3上調基因數(shù)目??Fig.?3?Number?of?up-regulated?differentially?expressed?genes??3.2.4下調基因數(shù)目統(tǒng)計??將條件為pH3.0的樣品與其它pH條件下的樣品進行差異表達分析,通過篩癬??統(tǒng)計得到下調基因的數(shù)目并將注釋到GO、KEGG數(shù)據(jù)庫中,數(shù)目統(tǒng)計結果如圖4所??示,在Pach培養(yǎng)基中,下調的差異基因總數(shù)是12189個,在GO上注釋到的功能數(shù)??12152個,在KEGG上注釋到的途徑共3521個。在麥芽汁培養(yǎng)基中,下調的差異基??因總數(shù)是8422個,在GO上注釋到的功能數(shù)8402個,在KEGG上注釋到的途徑共??3149?個。??Pach培養(yǎng)基??2500?:?*差異基因總數(shù)=■注釋到GO的數(shù)目注釋到KEGG的數(shù)目??蠢?IS?I—?P?I?P?!?P?P??:I?Jy?11?Jy?11II??/?/■?/■?/■?/■?/??/■?/■??/?/?/?/?/?/?/?/?/??
V2.?pH對釀酒酵母轉錄組的影響???麥芽汁培養(yǎng)基??1600?--?*差異基因總數(shù)?=■注釋到GO的數(shù)目?I注釋到KEGG的數(shù)目??1400?g二??1200?i|i?=??1000?_?i?三?S?二?匿巨?a-??=lliil?111??^?^?^?^?^?^?^??#?#?#?P?<s??4?#??f?f?f?穿?f?f?/_?f?/'??圖4下調基因數(shù)目??Fig.4?Number?of?down-regulated?differentially?expressed?genes??3.3?pH對乙醛酸循環(huán)相關基因表達量的影響??3.3.1?pH對異檸檬酸裂解酶基因表達量的影響??300?50??幾?-??Pach培養(yǎng)基-*麥芽汁培養(yǎng)基??幺?45??250?40??I?200?35?|??S:?30?菡??m?1??f?150?25?I??室?*?*?4?20?£??S?l〇〇?A?*?1c;銖??^?*?4?15?M??50???4?4?10??修奐?I?5??〇?*???????0??2.0?3.0?4.0?5.0?6.0?7.0?8.0?9.0?10.0??培養(yǎng)基pH??圖5不同初始pH條件下異檸檬酸裂解酶基因表達量??Fig.?5?The?ICL?gene?expression?in?different?pH?conditions??
本文編號:3101111
本文鏈接:http://www.sikaile.net/projectlw/qgylw/3101111.html