疫苗因其能夠激活免疫系統(tǒng)以預(yù)防或治療感染和一些其他疾病而對(duì)人類健康有著重要的影響,然而預(yù)防性的癌癥疫苗目前僅對(duì)病毒來源的癌癥有效,如人類乳頭瘤病毒介導(dǎo)的宮頸癌。Sipuleucel-T疫苗是美國(guó)食品藥品管理局(FDA)首個(gè)批準(zhǔn)的治療性的癌癥疫苗,對(duì)前列腺癌的治療也并沒有取得預(yù)期的良好效果。與其他的免疫療法相比,例如免疫檢查點(diǎn)抑制(CPB,immune checkpoint blockade)、過繼T細(xì)胞療法(Adoptive cell transfer,ACT)以及抗原嵌合受體療法(Chimeric antigen receptors,CARs)相比,大多數(shù)疫苗都不能引起顯著的臨床效果。腫瘤新抗原疫苗是近年來開發(fā)出的一種有效的癌癥疫苗,也是目前最具前沿性的抗腫瘤疫苗技術(shù)之一,接種新抗原疫苗既可以擴(kuò)大已有的新抗原特異性T細(xì)胞群,又可以在癌癥患者中誘導(dǎo)更廣泛的新型T細(xì)胞特異性,增強(qiáng)腫瘤的抑制。同時(shí)新抗原疫苗與其他免疫療法如PD-1/PD-L1聯(lián)合治療效果更加顯著,使得新抗原疫苗研制成為時(shí)下的抗腫瘤研發(fā)的熱點(diǎn),尤其是篩選腫瘤新抗原肽的技術(shù)成為了疫苗制備的關(guān)鍵。新一代測(cè)序技術(shù)極大推動(dòng)了新抗原疫...

【文章頁數(shù)】：52 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
abstract
第一章 引言
    1.1 研究背景
    1.2 腫瘤抗原及新抗原簡(jiǎn)介
    1.3 抗原的提呈
    1.4 主要組織相容性復(fù)合物與TCR
    1.5 腫瘤新抗原疫苗研究現(xiàn)狀
    1.6 研究目的及意義
    1.7 論文章節(jié)概述
第二章 腫瘤新抗原預(yù)測(cè)常用生物信息學(xué)軟件及展望
    2.1 抗原肽提呈過程研究中常用的一些生物信息學(xué)軟件
    2.2 新抗原肽篩選流程及常用的管道(pipeline)
        2.2.1 基于MHC-多肽結(jié)合預(yù)測(cè)的新抗原篩選流程
        2.2.2 基于MHC-結(jié)合肽的質(zhì)譜新抗原篩選
    2.3 腫瘤新抗原特征及如何進(jìn)一步篩選預(yù)測(cè)的新抗原
    2.4 非編碼區(qū)篩選新抗原—新的希望
    2.5 目前新抗原預(yù)測(cè)存在的問題
    2.6 本章小結(jié)
第三章 T-cell HLA class Ⅰ類抗原表位或新抗原表位免疫原性預(yù)測(cè)新方法(INeo-Epp)
    3.0 人類白細(xì)胞抗原HLA人群頻率分布
    3.1 HLA超型概念
    3.2 陽性陰性數(shù)據(jù)集選取中免疫原性表位與非免疫原性表位界定
    3.3 材料與方法
        3.3.1 數(shù)據(jù)收集:實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證抗原表位,外部驗(yàn)證集抗原表位及新抗原表位的收集
        3.3.2 表位免疫原性預(yù)測(cè)方法構(gòu)建(特征選取+特征過濾+模型構(gòu)建)
    3.4 抗原預(yù)測(cè)與新抗原預(yù)測(cè)模型構(gòu)建歸總
    3.5 結(jié)果
        3.5.1 抗原表位分類預(yù)測(cè)模型
        3.5.2 新抗原表位分類預(yù)測(cè)模型
    3.6 INeo-Epp簡(jiǎn)介及使用流程
        3.6.1 如何使用INeo-Epp
    3.7 本章小結(jié)
第四章 總結(jié)與展望
    4.1 課題小結(jié)
    4.2 課題創(chuàng)新點(diǎn)
    4.3 未來研究拓展
參考文獻(xiàn)
符號(hào)表
科研成果及參加的學(xué)術(shù)會(huì)議
致謝



本文編號(hào)：3906111