菠菜熱激轉錄因子Hsf家族全基因組分析及SoHsfA1基因功能分析
發(fā)布時間:2024-05-20 02:29
菠菜(Spinacia oleracea L.)是我國重要的綠葉蔬菜之一,耐寒性強,但不耐高溫,溫度高于25℃時,植株出現(xiàn)長勢弱、產量低、品質差、硝酸鹽積累等問題。熱激轉錄因子(Heart shock transcription factors,Hsfs)是熱激反應的主要調節(jié)因子,參與調控熱激損傷下的保護蛋白—熱激蛋白(Heat shock proteins,Hsps)的表達。因此,研究熱激轉錄因子基因家族對研究菠菜熱脅迫響應機制至關重要。以菠菜轉錄組和基因組的測序數(shù)據為基礎,本研究分析并鑒定了菠菜Hsf家族的特性和功能,為全面分析菠菜熱脅迫的響應機制奠定基礎,為菠菜耐熱分子育種的發(fā)展提供理論依據。本研究完成了菠菜全基因組熱激轉錄因子基因家族的鑒定,并克隆了全部SoHsfs的CDS全長;根據其結構域的特征,將SoHsfs家族分為A、B、C三類;構建菠菜、擬南芥(Arabidopsis thaliana)和與菠菜同屬莧科藜亞科的甜菜(Beta vulgaris)Hsfs系統(tǒng)發(fā)育樹,預測分析了SoHsfs亞家族成員和功能;利用qRT-PCR方法分析了該家族耐熱候選基因SoHsfA1高溫脅迫...
【文章頁數(shù)】:77 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
本文編號:3978822
【文章頁數(shù)】:77 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.1植物Hsf基本結構
上海師范大學碩士學位論文1.緒論HsfB(除HsfB5)的NLS包含高度保守的四肽阻遏基序(repressordomain,RD)—LFGV—[50-52]。在植物某些Hsf的C端區(qū)域中還存在一個富含亮氨酸的疏水NES區(qū)域。正是NLS和NES的協(xié)同作....
圖1.2HSF-HSP-HSBP1熱脅迫協(xié)同響應機制[97]
3.植物Hsf基因家族響應熱脅迫的調控機制植物Hsf在參與熱脅迫信號轉導以及耐熱性的產生過程中的作用概括體現(xiàn)在以下幾個方面[36]:(1)植物耐熱基因調控網絡中最有特點的是調控編碼熱激蛋白的熱激轉錄因子,可與熱激蛋白上游的順式作用元件結合,從而啟動下游熱激蛋白和相關基因....
圖2.2菠菜Hsf熱激轉錄因子家族DBD保守結構域多序列比對分析
分析結果顯示,該結構域由94-102個氨基酸組成,包含3個α螺旋和4個β折疊(圖2.2),且除SoHsf12外,其他成員中編碼該結構域的部分氨基酸殘基完全一致,這種進化中高度保守可能是使Hsf能夠識別并與熱激蛋白Hsp(Heartshockprot....
圖2.3菠菜Hsf熱激轉錄因子家族OD保守結構域多序列比對分析
分析表明,并非全部的菠菜Hsf中都具有NES結構域,、SoHsf2、SoHsf3、SoHsf4、SoHsf8、SoHsf10、SoHsf11、SoHsf14其中SoHsf1的NES區(qū)緊鄰HR-A/B區(qū)的羧基末端,而其它SoHsfs的HR-A/B結構域羧....
本文編號:3978822
本文鏈接:http://www.sikaile.net/nykjlw/yylw/3978822.html
最近更新
教材專著