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洋蔥鱗莖類黃酮類化合物含量及其轉(zhuǎn)錄組分析

發(fā)布時(shí)間:2024-03-30 03:41
  本研究以三種不同顏色的洋蔥品種‘W1201’(紅皮)、‘W470’(黃皮)、‘628’(白皮)的鱗莖為材料,比較了三者之間黃酮、花青素含量及其抗氧化活性之間的差異,并對(duì)黃酮、花青素含量與抗氧化活性之間的相關(guān)性進(jìn)行了分析。此外,以洋蔥品種‘W470’新鮮幼嫩的根、鱗莖、葉片為試驗(yàn)材料,比較了 4種不同RNA提取方法提取洋蔥不同組織總RNA的效果,旨在探討洋蔥不同組織的總RNA提取的最優(yōu)方法。采用IlluminaHiSeqTM2000平臺(tái)對(duì)上述三種顏色洋蔥鱗莖組織進(jìn)行測(cè)序并將測(cè)序結(jié)果進(jìn)行生物信息學(xué)分析,對(duì)其差異表達(dá)基因進(jìn)行挖掘、探討了類黃酮生物合成途徑差異表達(dá)基因的表達(dá)情況。進(jìn)而,基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序所得數(shù)據(jù)開發(fā)SSR、SNP標(biāo)記,以期在后續(xù)的研究中利用SSR、SNP標(biāo)記開展洋蔥種質(zhì)資源遺傳多樣性評(píng)價(jià)以及分子標(biāo)記輔助育種的研究。取得的各項(xiàng)研究結(jié)果如下:1.‘W1201’、‘W470’、‘628’的花青素含量分別為 29.99±1.19,9.64±1.30和 0.75±0.40mg·100g-1 黃酮含量分別為 111.10±5.98,36.64±3.59 和 0mg·100g-1。紫皮和黃皮洋蔥...

【文章頁數(shù)】:73 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

圖2-1本研究中三種不同顏色的洋蔥

圖2-1本研究中三種不同顏色的洋蔥

1.1試驗(yàn)材料與化學(xué)試劑??本研究于2015年5月中旬在南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江浦園藝站選取了‘W470’(黃皮)、??‘628’?(白皮)、‘W1201’?(紫皮)三種不同顏色的洋蔥的洋蔥材料(圖2-1)。??所有化學(xué)試劑均為分析純。??圖2-1本研究中三種不同顏色的洋蔥。從左至右依次為....


圖2-3三種不同顏色洋蔥的TPC和抗氧化活性(mg-100g_1FW)??Fig.?2-3?TPC?and?antioxidant?capacities?(DPPH,?ABTS+?and?FRAP)?of?each?sample?(mean±SE,?n=3)??

圖2-3三種不同顏色洋蔥的TPC和抗氧化活性(mg-100g_1FW)??Fig.?2-3?TPC?and?antioxidant?capacities?(DPPH,?ABTS+?and?FRAP)?of?each?sample?(mean±SE,?n=3)??

圖2-3三種不同顏色洋蔥的TPC和抗氧化活性(mg-100g_1FW)??Fig.?2-3?TPC?and?antioxidant?capacities?(DPPH,?ABTS+?and?FRAP)?of?each?sample?(mean±SE,?n=3)??2.4相關(guān)性分析?....


圖3-2不同方法提取的洋蔥總RNA的RT-PCR檢測(cè)??Fig.?3-2?RT-PCR?of?total?onion?RNA?extracted?with?different?methods??

圖3-2不同方法提取的洋蔥總RNA的RT-PCR檢測(cè)??Fig.?3-2?RT-PCR?of?total?onion?RNA?extracted?with?different?methods??

和的總RNA經(jīng)反轉(zhuǎn)錄后,進(jìn)行RT-PCR試驗(yàn),以驗(yàn)證所提RNA能否滿足后續(xù)試??驗(yàn)。從PCR產(chǎn)物電泳結(jié)果表明,兩種提取方法對(duì)于洋蔥的不同組織提取的RNA能??夠滿足后續(xù)分子試驗(yàn)對(duì)樣品品質(zhì)的需求(圖3-2)。??TaKaRa?葉?pBiozol?法鱗蓮?pBiozol?法根??観議....


圖4-2?NR分類圖??Fi.?4-2?Fiure?of?NR?classification??

圖4-2?NR分類圖??Fi.?4-2?Fiure?of?NR?classification??

對(duì)這些Unigene進(jìn)行E-value,Identity和物種分布統(tǒng)計(jì)。研究結(jié)果顯示,在注釋到??的Unigene?E值分布中,Unigenes序列的E值小于lfm(1時(shí),同源性最高為15.8%,??其他序列的同源性為84.2%?(圖4-2A)。在Unigene序列相似度分布中有....



本文編號(hào):3941756

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