不定根發(fā)生是蘋果矮化砧木無性繁育的關(guān)鍵環(huán)節(jié)之一,非編碼RNA在不定根發(fā)生調(diào)控中扮演著重要角色,蘋果中相關(guān)研究較為薄弱。本研究以我國主栽蘋果砧木‘M26’為主要試材,在不定根誘導(dǎo)期取樣建庫,進(jìn)行全轉(zhuǎn)錄組測序,全面鑒定參與不定根發(fā)生調(diào)控的非編碼RNA,并對miRNA160參與不定根發(fā)生的功能進(jìn)行了初步分析,主要結(jié)果如下:1確定了蘋果砧木‘M26’組培苗不定根發(fā)育過程的3個時期:不定根原基誘導(dǎo)期(0-3 d);不定根原基形成期(3-7 d);不定根原基伸長期(7-16 d)。組培苗莖基部內(nèi)源激素測定結(jié)果表明,IBA處理后生長素(IAA),玉米素(ZR)和茉莉酸甲酯(JA-me)在處理第3 d顯著增加隨后降低,赤霉素(GA3)在誘導(dǎo)期(3 d)顯著降低。對蘋果砧木‘M26’組培苗莖基部誘導(dǎo)期進(jìn)行全轉(zhuǎn)錄組測序,共發(fā)現(xiàn)855個長鏈非編碼RNA(lncRNA),其中有63個被鑒定為響應(yīng)IBA的lncRNA。15個響應(yīng)IBA的lncRNAs被預(yù)測與94個miRNA存在靶向關(guān)系。通過軟件匹配,共發(fā)現(xiàn)2014個lncRNA差異表達(dá)靶基因(DEGs),這些DEGs的注釋功能主要與植物激素和蔗糖信號傳導(dǎo)等生物...

【文章頁數(shù)】：157 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1.1 不定根發(fā)育相關(guān)研究進(jìn)展
    1.2 生長素調(diào)控不定根形成的研究
    1.3 非編碼RNA調(diào)控不定根發(fā)生的研究進(jìn)展
    1.4 研究的目的及意義
第二章 蘋果砧木不定根發(fā)生相關(guān)lncRNA全基因組鑒定篩選
    2.1 材料與方法
        2.1.1 試驗(yàn)材料處理
        2.1.2 顯微觀察
        2.1.3 內(nèi)源激素測定
        2.1.4 全轉(zhuǎn)錄組測序與lncRNA鑒定
        2.1.5 lncRNA特征分析、靶基因預(yù)測和通路分析
        2.1.6 相對表達(dá)量驗(yàn)證與統(tǒng)計分析
    2.2 結(jié)果與分析
        2.2.1 蘋果砧木不定根發(fā)生過程形態(tài)學(xué)觀察
        2.2.2 蘋果砧木不定根發(fā)生過程內(nèi)源激素含量分析
        2.2.3 全轉(zhuǎn)錄組鑒定lncRNA及其表達(dá)模式分析
        2.2.4 lncRNA通過與miRNA互作來發(fā)揮作用
        2.2.5 lncRNA靶基因注釋
        2.2.6 響應(yīng)IBA的lncRNAs及其靶基因的表達(dá)模式
        2.2.7 蘋果砧木'M26'中競爭性內(nèi)源RNA(ceRNA)篩選
        2.2.8 參與蘋果砧木不定根發(fā)生調(diào)控的ceRNA篩選
    2.3 討論
        2.3.1 蘋果砧木不定根發(fā)生過程觀察
        2.3.2 內(nèi)源激素水平變化影響不定根發(fā)生
        2.3.3 lncRNA和miRNA的互作調(diào)控不定根發(fā)生
第三章 蘋果miRNA160家族鑒定及參與不定根發(fā)生調(diào)控的研究
    3.1 材料和方法
        3.1.1 試驗(yàn)材料和處理
        3.1.2 試驗(yàn)方法
    3.2 結(jié)果與分析
        3.2.1 mdm-miR160家族鑒定與進(jìn)化模式分析
        3.2.2 外源IBA處理對不同生根能力蘋果砧木組培苗不定根發(fā)生的影響
        3.2.3 mdm-miR160在不同蘋果砧木品種中的克隆及表達(dá)模式分析
        3.2.4 mdm-miR160調(diào)控不定根發(fā)生功能驗(yàn)證
    3.3 討論
        3.3.1 miR160家族在植物中廣泛存在和高度保守
        3.3.2 mdm-miR160及其靶基因的表達(dá)模式
        3.3.3 mdm-miR160對不定根發(fā)生的抑制作用
第四章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
個人簡介



本文編號：3776933