灰樹花[Grifola frondosa(Dicks.Fr)S.F.Gray]是一種重要的珍稀食藥用菌,其味道獨特鮮美且具有抗腫瘤、提高免疫力、降血壓及抗病毒等多種藥用價值。本研究對灰樹花菌絲體轉(zhuǎn)錄組進行高通量測序來搜尋SSR位點,并應(yīng)用多態(tài)性EST‐SSR標記對32份灰樹花菌株進行遺傳多樣性評價,取得以下研究結(jié)果:基于不同地域灰樹花的ITS rDNA序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,結(jié)果發(fā)現(xiàn),ITS rDNA構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹可以將來自亞洲和美國的菌株區(qū)分開,說明灰樹花的地理距離和遺傳距離存在一定的相關(guān)性。對灰樹花菌絲體進行高通量轉(zhuǎn)錄組測序,三個生物學(xué)重復(fù)樣本共獲得了13.46 G的數(shù)據(jù)量,DE NOVO拼接14347條Unigenes。共有9433個Unigenes比對上NR蛋白庫,占65.74%;在GO功能分類中,共54個類別包括7366個Unigenes有具體功能注釋;有4347個Unigenes在KOG中獲得具體蛋白功能注釋;2799個Unigenes與KO庫有同源信息,注釋到255個代謝通路。利用MISA軟件,從獲得的Unigenes中進行SSR位點查找,共找到515個SSR位點。利用Pr...

【文章頁數(shù)】：43 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第一篇 文獻綜述
    第一章 灰樹花研究現(xiàn)狀
        1.1 灰樹花概述
        1.2 灰樹花的人工馴化與栽培
        1.3 灰樹花的系統(tǒng)發(fā)育研究
        1.4 灰樹花遺傳多樣性的研究進展
    第二章 RNA-Seq研究進展
        2.1 轉(zhuǎn)錄組學(xué)的發(fā)展
        2.2 RNA-Seq的發(fā)展及優(yōu)勢
        2.3 RNA-Seq的應(yīng)用
    第三章 分子標記在食藥用真菌遺傳多樣性分析中的應(yīng)用
        3.1 RFLP技術(shù)
        3.2 RAPD技術(shù)
        3.3 AFLP技術(shù)
        3.4 SSR微衛(wèi)星標記
第二篇 研究內(nèi)容
    第一章 基于ITS rDNA基因的灰樹花遺傳多樣性分析
        1.1 實驗材料
        1.2 試驗方法
        1.3 序列比對和系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建
        1.4 結(jié)果與分析
        1.5 討論
    第二章 基于RNA-Seq的灰樹花菌絲體轉(zhuǎn)錄組分析
        2.1 實驗材料
        2.2 實驗方法
        2.3 結(jié)果與分析
        2.4 討論
    第三章 灰樹花SSR標記開發(fā)及多態(tài)性分析
        3.1 實驗材料
        3.2 試驗方法
        3.3 結(jié)果與分析
        3.4 討論
結(jié)論
作者簡介
致謝
參考文獻



本文編號：3769220