菜心（Brassica campestris L.ssp.chinesis var.utilis Tsen et Lee）是起源于我國(guó)華南地區(qū)的一種重要經(jīng)濟(jì)蔬菜。在盛夏高溫多雨的生長(zhǎng)季節(jié),菜心易遭遇到不同程度的高溫脅迫,導(dǎo)致菜心提前大量死亡和產(chǎn)量失收。近年來(lái),隨著現(xiàn)代農(nóng)業(yè)技術(shù)的發(fā)展,改良菜心品種適應(yīng)高溫生長(zhǎng)環(huán)境成為了市場(chǎng)迫切的需要。目前菜心耐高溫的研究主要集中在農(nóng)藝性狀和生理生化方面,鮮有菜心熱脅迫分子機(jī)制的報(bào)道。據(jù)此,本研究收集大量的菜心種質(zhì)材料,于不同季節(jié)栽種,篩選可行性的耐熱指標(biāo),并把菜心種質(zhì)材料按耐熱性進(jìn)行分類(lèi)�；诓煌蜔岵诵牟牧系霓D(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù),分析耐熱候選基因在不同耐熱菜心材料間的等位變異,篩選出可能導(dǎo)致耐熱性差異的候選SNPs,為菜心的耐熱性分類(lèi)、耐熱基因的挖掘和分子機(jī)理提供理論基礎(chǔ)。研究主要結(jié)果如下:1.高溫夏季,連續(xù)兩年在寧夏栽種200個(gè)菜心種質(zhì)材料,并對(duì)11個(gè)耐熱相關(guān)的農(nóng)藝性狀進(jìn)行測(cè)定,以廣州常溫秋冬季栽種的相同材料的農(nóng)藝性狀作為對(duì)照,篩選出相對(duì)值變異系數(shù)較大（CV≥15%）的9個(gè)農(nóng)藝性狀作為評(píng)價(jià)菜心耐熱強(qiáng)弱的主要指標(biāo)。利用模糊隸屬函數(shù)值評(píng)價(jià)菜心的耐心性,11個(gè)指... 

【文章頁(yè)數(shù)】：105 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1.1 菜心耐熱指標(biāo)的篩選和評(píng)價(jià)
        1.1.1 菜心耐熱農(nóng)藝性狀指標(biāo)的篩選和評(píng)價(jià)
        1.1.2 菜心耐熱的生理特性的篩選和評(píng)價(jià)
    1.2 菜心熱脅迫分子機(jī)制的研究
    1.3 基于RNA-seq技術(shù)的SNP標(biāo)記研究
    1.4 蕓苔屬作物耐熱候選基因的發(fā)掘
    1.5 候選基因生物信息學(xué)分析
        1.5.1 候選基因的基本理化性質(zhì)分析
        1.5.2 候選基因的變異分析
    1.6 本研究的目的意義及內(nèi)容
        1.6.1 目的意義
        1.6.2 研究?jī)?nèi)容
第二章 菜心生長(zhǎng)期耐熱指標(biāo)的篩選及耐熱性評(píng)價(jià)
    2.1 材料與方法
        2.1.1 試驗(yàn)材料
        2.1.2 試驗(yàn)方法
        2.1.3 指標(biāo)測(cè)定與方法
        2.1.4 菜心耐熱指標(biāo)的篩選
        2.1.5 不同來(lái)源的菜心材料耐熱性評(píng)價(jià)
    2.2 結(jié)果與分析
        2.2.1 菜心耐熱性指標(biāo)的篩選
        2.2.2 利用模糊隸屬函數(shù)綜合評(píng)價(jià)菜心材料的耐熱性
        2.2.3 利用主成分綜合評(píng)價(jià)值判斷菜心材料的耐熱性
        2.2.4 菜心種質(zhì)材料的耐熱性聚類(lèi)分析
    2.3 討論
        2.3.1 菜心耐熱指標(biāo)的選擇
        2.3.2 菜心品種耐熱性綜合評(píng)價(jià)方法的建立
        2.3.3 菜心耐熱品種的比較
第三章 不同耐熱菜心材料轉(zhuǎn)錄組SNP位點(diǎn)的挖掘
    3.1 試驗(yàn)材料及方法
        3.1.1 試驗(yàn)材料
        3.1.2 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)來(lái)源
        3.1.3 不同耐熱菜心材料轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)SNP的分析
        3.1.4 含SNP基因功能注釋分析
        3.1.5 耐熱候選基因SNP位點(diǎn)的特征
    3.2 結(jié)果與分析
        3.2.1 菜心熱脅迫轉(zhuǎn)錄組SNP檢測(cè)
        3.2.2 SNP位點(diǎn)在各個(gè)染色體上的分布
        3.2.3 含SNP基因的GO功能和KEGG通路分類(lèi)
        3.2.4 耐熱候選基因的SNP挖掘特征
    3.3 討論
        3.3.1 菜心熱脅迫轉(zhuǎn)錄組SNPs特性
        3.3.2 菜心SNP位點(diǎn)在染色體的分布
        3.3.3 含SNP基因的GO功能和KEGG通路的比較
        3.3.4 候選基因的SNP、GO功能和KEGG通路的比較
第四章 兩個(gè)耐熱候選基因的序列分析
    4.1 實(shí)驗(yàn)材料
    4.2 試驗(yàn)方法
        4.2.1 引物設(shè)計(jì)
        4.2.2 目的片段的擴(kuò)增
        4.2.3 目的片段的回收和純化
        4.2.4 T-載體連接與轉(zhuǎn)化
        4.2.5 轉(zhuǎn)化及測(cè)序
        4.2.6 序列分析
    4.3 結(jié)果與分析
        4.3.1 PP2C77和IDD7 基因的DNA序列特征
        4.3.2 PP2C77蛋白的結(jié)構(gòu)特征及進(jìn)化關(guān)系
        4.3.3 IDD7蛋白的結(jié)構(gòu)特征及進(jìn)化分析
        4.3.4 菜心 PP2C77 和 IDD7 蛋白的功能預(yù)測(cè)
    4.4 討論
        4.4.1 PP2C蛋白的比較
        4.4.2 IDD蛋白的比較
第五章 總結(jié)與展望
    5.1 .總結(jié)
        5.1.1 菜心耐熱性的指標(biāo)篩選及種質(zhì)材料分類(lèi)
        5.1.2 菜心熱脅迫轉(zhuǎn)錄組 SNP 的檢測(cè)及分析
        5.1.3 耐熱候選基因純合 SNP 位點(diǎn)挖掘及 GO 和 KEGG 分析
        5.1.4 候選基因的克隆和功能預(yù)測(cè)
    5.2 展望
參考文獻(xiàn)
碩士研究生期間發(fā)表論文
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]不同菜心品種萌發(fā)期和苗期耐熱性分析及其鑒定指標(biāo)篩選[J]. 龐強(qiáng)強(qiáng),周曼,孫曉東,陳貽誦,蔡興來(lái).  西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2020(02)
[2]菜心耐熱性評(píng)價(jià)及酶促抗氧化系統(tǒng)對(duì)高溫脅迫的響應(yīng)[J]. 龐強(qiáng)強(qiáng),周曼,孫曉東,張文,蔡興來(lái).  浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2020(01)
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[4]紫花苜蓿β-1,3-葡聚糖酶基因同源克隆與序列變異分析[J]. 高建明,桂枝,盧樹(shù)昌.  西部林業(yè)科學(xué). 2019(05)
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[6]熱脅迫下水仙花葉片的轉(zhuǎn)錄組分析[J]. 宋姣敏,徐小萍,陳裕坤,陳桂信,賴鐘雄.  熱帶作物學(xué)報(bào). 2019(10)
[7]白菜PLD基因家族全基因組鑒定及對(duì)高溫脅迫的響應(yīng)[J]. 張藝思,劉高峰,劉路平,侯喜林.  西北植物學(xué)報(bào). 2019(08)
[8]寧夏地區(qū)菜心早春栽培品種比較試驗(yàn)[J]. 李旭霞,王轉(zhuǎn)莉.  安徽農(nóng)學(xué)通報(bào). 2019(14)
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[10]綜合評(píng)價(jià)比較菜心及其近緣亞種蔬菜氨基酸營(yíng)養(yǎng)價(jià)值[J]. 原遠(yuǎn),周賢玉,李光光,鄭巖松,江定,任海龍,雷建軍,張華.  食品與發(fā)酵工業(yè). 2019(14)

博士論文
[1]大豆苗期干旱和高溫脅迫應(yīng)答機(jī)制研究及關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子的篩選[D]. 王利彬.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]甜橙bHLH家族轉(zhuǎn)錄因子發(fā)掘及CsbHLH18抗寒功能鑒定與作用機(jī)制解析[D]. 耿晶晶.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[3]NAC家族轉(zhuǎn)錄因子OsNAC2介導(dǎo)赤霉素信號(hào)通路參與調(diào)控水稻株高和開(kāi)花時(shí)間[D]. 陳旭.復(fù)旦大學(xué) 2013
[4]不結(jié)球白菜抗逆相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子的克隆及耐熱耐寒相關(guān)蛋白的功能鑒定[D]. 朱波.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008

碩士論文
[1]高溫脅迫下玉米葉片的轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組分析[D]. 許小芳.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[2]玉米響應(yīng)高溫脅迫的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及關(guān)鍵調(diào)控基因的鑒定與分析[D]. 蔣玲玉.安徽師范大學(xué) 2019
[3]水稻耐熱脅迫基因的挖掘及其表達(dá)分析[D]. 王少波.福建農(nóng)林大學(xué) 2019
[4]水稻PP2C基因在耐汞性中的功能分析[D]. 孔珍珍.浙江師范大學(xué) 2019
[5]小麥栽培種與野生種的轉(zhuǎn)錄組組裝及差異基因分析[D]. 李南南.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[6]芍藥種子休眠與萌發(fā)相關(guān)基因PlPP2C的克隆及遺傳轉(zhuǎn)化[D]. 麻永磊.沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[7]水稻葉片衰老相關(guān)蛋白磷酸酶編碼基因OsSAPP3功能分析[D]. 崔勝男.沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[8]高溫脅迫下黃瓜基因的表達(dá)變化[D]. 盧俊成.揚(yáng)州大學(xué) 2018
[9]小麥親緣物種二穗短柄草熱脅迫下轉(zhuǎn)錄組分析和MYB基因家族分析[D]. 陳守坤.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2018
[10]GhDRPP1轉(zhuǎn)基因棉花抗旱性及其相關(guān)的生理遺傳分析[D]. 魏寧.華中師范大學(xué) 2018



本文編號(hào)：3705442