短絲木犀（Osmanthus serrulatus Rehd.）又名寶興桂花,是木犀科（Oleaceae）少見的春季開花種類之一,為我國特有種,通常分布于海拔1800-2400 m的常綠闊葉林中。由于短絲木犀種子存在隔年萌發(fā)現(xiàn)象,自然野生種群更新緩慢,加之人為破壞嚴(yán)重,野生群體遭受嚴(yán)重威脅,目前僅在四川的東拉山、峨眉山、西嶺雪山等中高海拔山地有零星片狀分布,其中東拉山群體是迄今為止世界上發(fā)現(xiàn)的面積最大的野生桂花群體。目前對短絲木犀的研究較少,掌握短絲木犀的遺傳多樣性信息是了解其瀕危原因、制定有效保護(hù)措施及良種選育的最基本前提。本文在廣泛的野外調(diào)查基礎(chǔ)上,收集了13個短絲木犀群體共330個個體,利用18對SSR引物對短絲木犀的遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性進(jìn)行了分析,為短絲木犀不同群體的遺傳變異與分化提供分子證據(jù),并為實(shí)現(xiàn)該物種的有效保護(hù)以及合理開發(fā)奠定基礎(chǔ)。主要結(jié)論如下:從轉(zhuǎn)錄組測序獲得的2435對短絲木犀引物中隨機(jī)抽取了100對,篩選出了15對多態(tài)性強(qiáng)且穩(wěn)定性好的引物（目的片段長度在110bp-280bp）,用于群體遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性分析,占隨機(jī)引物總數(shù)的15%。結(jié)合15對篩選出的引物及3對... 

【文章頁數(shù)】：53 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
致謝
摘要
abstract
第一章 緒論
    1.1 DNA分子標(biāo)記
        1.1.1 常用分子標(biāo)記
        1.1.2 SSR分子標(biāo)記
    1.2 基于分子標(biāo)記的群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
        1.2.1 基本概念及意義
        1.2.2 群體遺傳結(jié)構(gòu)的影響因素
        1.2.3 群體遺傳結(jié)構(gòu)與保護(hù)策略的制定
    1.3 木犀屬植物的研究進(jìn)展
        1.3.1 木犀屬其他植物研究進(jìn)展
        1.3.2 短絲木犀研究進(jìn)展
    1.4 研究目的及意義
第二章 研究材料與方法
    2.1 實(shí)驗(yàn)材料
        2.1.1 SSR引物
        2.1.2 供試材料
    2.2 研究方法
        2.2.1 總DNA提取及檢測
        2.2.2 SSR-PCR反應(yīng)體系優(yōu)化及引物篩選
        2.2.3 SSR-PCR擴(kuò)增產(chǎn)物檢測
    2.3 數(shù)據(jù)處理及統(tǒng)計(jì)分析
        2.3.1 原始數(shù)據(jù)處理
        2.3.2 遺傳結(jié)構(gòu)分析
        2.3.3 遺傳聚類分析
第三章 結(jié)果與分析
    3.1 短絲木犀的DNA提取及檢測
        3.1.1 1%瓊脂糖凝膠電泳檢測比較
        3.1.2 紫外分光光度計(jì)的檢測比較
    3.2 短絲木犀SSR引物篩選及PCR擴(kuò)增
        3.2.1 正交實(shí)驗(yàn)的直觀分析
        3.2.2 最佳優(yōu)化體系篩選短絲木犀引物
        3.2.3 兩種引物篩選方法的對比分析
        3.2.4 引物的多態(tài)性分析
    3.3 短絲木犀群體的遺傳結(jié)構(gòu)分析
        3.3.1 哈迪-溫伯格平衡檢測
        3.3.2 SSR標(biāo)記在短絲木犀物種水平的遺傳多樣性
        3.3.3 短絲木犀群體水平的遺傳多樣性
        3.3.4 短絲木犀群體間的遺傳分化與基因交流
        3.3.5 瓶頸效應(yīng)分析
    3.4 短絲木犀群體的遺傳距離與聚類分析
        3.4.1 遺傳距離與地理距離相關(guān)性分析
        3.4.2 聚類分析
        3.4.3 Strcture分析
        3.4.4 主成分分析(PCoA)
    3.5 短絲木犀種質(zhì)資源保護(hù)
        3.5.1 短絲木犀的受危因素
        3.5.2 短絲木犀的保護(hù)策略
第四章 結(jié)論與展望
    4.1 短絲木犀基因組DNA的提取
    4.2 SSR反應(yīng)體系的優(yōu)化及引物的篩選
        4.2.1 影響反應(yīng)體系的因素
        4.2.2 傳統(tǒng)篩選與引物快速篩選的對比
    4.3 短絲木犀群體的遺傳結(jié)構(gòu)分析
    4.4 短絲木犀群體的遺傳距離與聚類分析
    4.5 短絲木犀資源的保護(hù)與利用
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
參考文獻(xiàn)



本文編號：3676675