為了解辣椒（Capsicum annuum）種質(zhì)資源的遺傳多樣性,以57份辣椒種質(zhì)資源為材料,對(duì)34個(gè)表型性狀進(jìn)行變異度、多樣性及主成分分析,分別基于表型性狀和SSR分子標(biāo)記進(jìn)行聚類分析。結(jié)果表明,種質(zhì)間的34個(gè)表型性狀存在差異,平均變異系數(shù)為40.67%,平均Shannon-Weiner多樣性指數(shù)為1.20;提取的10個(gè)主成分可以代表辣椒種質(zhì)表型性狀75.972%的遺傳信息,其中第1主成分占比22.317%,主要由果實(shí)橫徑、單果重、果肩形狀和果頂性狀所組成;19對(duì)SSR引物的平均Nei’s基因多樣性指數(shù)及香農(nóng)信息指數(shù)分別為0.48和0.80;基于表型性狀和SSR標(biāo)記均將57份辣椒分為4類,但2種聚類結(jié)果間的相關(guān)性不顯著（r=-0.175 9）。這為辣椒育種的親本選配及種質(zhì)資源評(píng)價(jià)提供理論依據(jù)。 

【文章來源】：熱帶亞熱帶植物學(xué)報(bào). 2020,28(04)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：11 頁

【部分圖文】：

基于表型性狀的辣椒種質(zhì)資源聚類圖。1～57見表1。

應(yīng)用NTsys2.10e軟件對(duì)57份辣椒材料的SSR標(biāo)記進(jìn)行聚類分析，采用UPGMA法生成聚類樹狀圖(圖3)，在遺傳相似系數(shù)為0.76處，將57份辣椒材料分成4類，其中材料28、33各為1類，材料45、42、43、27、和26等32份材料聚為1類，材料1、16、54、37、52等23份材料聚為一類。此外，57份辣椒種質(zhì)材料中，材料40和14，以及材料52和37分別聚在一起，遺傳相似系數(shù)達(dá)0.963，且田間性狀調(diào)查兩者相似性也較高，但這4份材料來源地各不相同，可能是由于品種間不斷交流所導(dǎo)致的原因。2.3 相關(guān)性分析

本研究通過表型性狀和SSR分子標(biāo)記分析57份辣椒種質(zhì)材料遺傳多樣性，結(jié)果表明，34個(gè)表型性狀的變異系數(shù)和香農(nóng)多樣性指數(shù)波動(dòng)較大，說明種質(zhì)材料間存在差異，但表型性狀的平均變異系數(shù)和香農(nóng)多樣性指數(shù)以及19對(duì)SSR引物的平均Nei’s基因多樣性指數(shù)和香農(nóng)指數(shù)較低，說明了辣椒種質(zhì)間遺傳背景狹窄。主成分分析從34個(gè)表型性狀中提取了10個(gè)主成分，累計(jì)貢獻(xiàn)率為75.972%，主成分分析可以突出重要性狀，排除重疊和消除意義不大的性狀。依據(jù)表型性狀和SSR分子標(biāo)記均可將57份辣椒種質(zhì)材料劃分為4類，其中部分材料無論在表型層面還是分子層面均劃為一類，如編號(hào)10、25、26和27等材料，但Mantel相關(guān)性分析表明2種聚類結(jié)果間相關(guān)性并不顯著，這與沈梓力等[15]、傅鴻妃等[20]的研究結(jié)果一致。這為辣椒雜種優(yōu)勢(shì)利用時(shí)選擇遺傳關(guān)系較遠(yuǎn)親本配對(duì)以及對(duì)種質(zhì)資源評(píng)價(jià)提供參考的同時(shí)，也提示我們表型數(shù)據(jù)和分子數(shù)據(jù)提供的信息有所不同，育種實(shí)踐中需要兼顧才能提高育種效率。種質(zhì)資源是作物遺傳育種的基礎(chǔ)，植物種質(zhì)資源優(yōu)良性狀的發(fā)現(xiàn)與利用，會(huì)進(jìn)一步推動(dòng)育種工作開展。我國(guó)辣椒種質(zhì)資源豐富，但遺傳基礎(chǔ)狹窄。本研究利用表型性狀和SSR分子標(biāo)記2種方法分析57份辣椒種質(zhì)資源遺傳多樣性，但2種方法的結(jié)果吻合性不高。推測(cè)可能的原因是：首先，本研究用于分析的34個(gè)表型性狀只是辣椒表型性狀的一部分，可能會(huì)導(dǎo)致表型和分子聚類結(jié)果不一致[27]；其次，表型性狀易受人為和環(huán)境因素的影響，導(dǎo)致數(shù)據(jù)有誤差，進(jìn)而使聚類的結(jié)果產(chǎn)生誤差，這與徐豪等[28]的研究結(jié)果一致；第三，表型性狀是由多個(gè)基因決定，分子標(biāo)記檢測(cè)的基因位點(diǎn)可能只是其中的一部分，并不能代表某一性狀的全部信息。本研究篩選出的19對(duì)SSR引物(表2)數(shù)量較少，導(dǎo)致可檢測(cè)的基因位點(diǎn)數(shù)量受到限制且不能覆蓋到整個(gè)基因組，因此不能全部反映DNA遺傳信息。同時(shí),分子標(biāo)記檢測(cè)到的基因位點(diǎn)并不一定能夠在性狀中有所表現(xiàn)�？梢�，表型性狀和分子標(biāo)記兩者不能完全對(duì)應(yīng)，導(dǎo)致不存在必然聯(lián)系。詹永發(fā)等[29]指出農(nóng)藝性狀數(shù)據(jù)是植物分類不可缺少的重要依據(jù)之一,是遺傳多樣性分析的基礎(chǔ)，分子標(biāo)記廣泛應(yīng)用到種質(zhì)資源的分類研究中[30?31]是植物分類和種質(zhì)創(chuàng)新的技術(shù)依據(jù)。所以，為進(jìn)一步提高今后育種工作中親本選配及辣椒種質(zhì)評(píng)價(jià)的準(zhǔn)確性，綜合應(yīng)用表型和分子標(biāo)記兩方面研究，在表型性狀上嚴(yán)格按照表型性狀描述規(guī)范，增加表型性狀數(shù)量，在分子層面增加引物數(shù)量以獲得更多的基因位點(diǎn)，進(jìn)而更加全面、準(zhǔn)確地區(qū)分種質(zhì)資源及描述遺傳多樣性。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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