蘿卜鉻吸收累積相關(guān)miRNAs與Nramp家族基因鑒定分析
發(fā)布時(shí)間:2021-12-10 11:59
重金屬污染已經(jīng)嚴(yán)重危及全球生態(tài)環(huán)境和人類(lèi)健康。鉻(Cr)是生物毒性極強(qiáng)的重金屬之一,不僅直接影響作物生長(zhǎng)發(fā)育,而且可通過(guò)水、空氣和土壤循環(huán)系統(tǒng)進(jìn)入食物鏈,威脅人類(lèi)健康。蘿卜(RaphanussatiusL.)是原產(chǎn)于我國(guó)的一種重要十字花科根菜類(lèi)蔬菜作物,具有較高營(yíng)養(yǎng)和藥用價(jià)值。蘿卜以膨大肉質(zhì)直根為產(chǎn)品器官,肉質(zhì)根是首個(gè)遭受重金屬毒害的部位,探索蘿卜重金屬脅迫響應(yīng)分子機(jī)制顯得尤為重要。miRNA介導(dǎo)的基因調(diào)控在植物重金屬脅迫響應(yīng)中有著重要作用。蔬菜作物Cr脅迫下起重要調(diào)控作用的miRNAs分離鑒定工作目前尚未見(jiàn)報(bào)道,極大限制了從分子遺傳學(xué)角度進(jìn)行蔬菜Cr吸收累積特性的遺傳控制;此外,重金屬吸收轉(zhuǎn)運(yùn)關(guān)鍵基因Nramp家族基因部分成員已在擬南芥、水稻等模式作物上成功分離,并通過(guò)轉(zhuǎn)基因手段對(duì)其生物學(xué)功能進(jìn)行了驗(yàn)證,然而蘿卜Nramp家族基因分離鑒定和功能驗(yàn)證工作尚未開(kāi)展,蘿卜Cr吸收累積分子特征與調(diào)控機(jī)制尚未闡明。鑒于此,本研究在基因組水平分離鑒定Cr脅迫下有重要調(diào)控作用的miRNAs;分離克隆到重金屬脅迫響應(yīng)關(guān)鍵基因Nramp家族4個(gè)成員,分析其在不同Cr脅迫時(shí)間、不同重金屬脅迫和不同Cr濃...
【文章來(lái)源】: 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:84 頁(yè)
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略詞表
引言
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 鉻是生物毒性極強(qiáng)的重金屬元素
2 鉻對(duì)植物的毒害效應(yīng)
2.1 鉻影響植物種子萌發(fā)
2.2 鉻影響植物生長(zhǎng)和發(fā)育
2.3 鉻影響植物生理代謝
2.4 鉻影響水分吸收和養(yǎng)分平衡
2.5 鉻誘導(dǎo)產(chǎn)生氧化脅迫
3 植物鉻脅迫響應(yīng)分子機(jī)制
3.1 螯合作用
3.1.1 植物絡(luò)合素(PCs)
3.1.2 金屬硫蛋白(MTs)
3.2 重金屬轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的調(diào)控
3.2.1 Nramp家族轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白
3.2.2 HMA家族轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白
3.3 抗氧化防御系統(tǒng)
4 植物重金屬脅迫響應(yīng)miRNAs分離鑒定與調(diào)控機(jī)制
4.1 重金屬脅迫響應(yīng)miRNAs分離鑒定
4.2 miRNAs介導(dǎo)的重金屬脅迫響應(yīng)調(diào)控機(jī)制
5 本研究目的和意義
第二章 蘿卜Cr脅迫響應(yīng)microRNAS分離鑒定
1 材料與方法
1.1 植物材料與脅迫處理
1.2 試驗(yàn)方法
1.2.1 總RNA提取及檢測(cè)
1.2.2 小分子RNA文庫(kù)構(gòu)建和測(cè)序
1.2.3 測(cè)序數(shù)據(jù)分析
1.2.4 Cr脅迫響應(yīng)miRNAs差異分析
1.2.5 Cr脅迫響應(yīng)miRNAs靶基因分析
1.2.6 RT-qPCR分析驗(yàn)證
2 結(jié)果與分析
2.1 蘿卜肉質(zhì)根小RNA文庫(kù)序列分析
2.2 已知miRNAs分離鑒定
2.3 新型miRNAs分離鑒定
2.4 Cr脅迫響應(yīng)miRNAs分離鑒定
2.5 miRNAs靶基因預(yù)測(cè)與功能注釋
2.6 miRNAs及其靶基因RT-qPCR驗(yàn)證
3 討論
3.1 蘿卜Cr脅迫響應(yīng)的miRNAs分子特征
3.2 蘿卜Cr脅迫響應(yīng)的轉(zhuǎn)錄因子和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)
3.3 蘿卜miRNAs介導(dǎo)的Cr脅迫響應(yīng)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)
第三章 蘿卜Nramp家族基因克隆與功能初步分析
1 材料與方法
1.1 蘿卜Nramp家族基因克隆
1.2 蘿卜Nramp家族基因過(guò)表達(dá)載體構(gòu)建
1.3 轉(zhuǎn)基因煙草遺傳轉(zhuǎn)化及分子鑒定
1.4 蘿卜Nramp家族基因表達(dá)特性分析
2 結(jié)果與分析
2.1 擴(kuò)增和克隆
2.2 蘿卜Nramp家族基因序列克隆及分析
2.3 蘿卜Nramp家族基因過(guò)表達(dá)載體酶切檢測(cè)
2.4 重組質(zhì)粒農(nóng)桿菌工程菌鑒定
2.5 Nramp家族基因轉(zhuǎn)基因煙草功能驗(yàn)證
2.6 蘿卜Nramp家族基因表達(dá)特性分析
3 討論
3.1 蘿卜Nramp家族基因序列特征與表達(dá)特性
3.2 植物Nramp基因調(diào)控的重金屬脅迫響應(yīng)特征
全文結(jié)論
本文創(chuàng)新之處
參考文獻(xiàn)
碩士在讀期間發(fā)表論文
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
博士論文
[1]蘿卜胚發(fā)生相關(guān)基因鑒定及新型SSR標(biāo)記開(kāi)發(fā)[D]. 翟璐璐.南京農(nóng)業(yè)大學(xué). 2014
[2]蘿卜鎘吸收累積性狀QTLs定位與相關(guān)基因鑒定[D]. 徐良.南京農(nóng)業(yè)大學(xué). 2013
碩士論文
[1]土壤鉻對(duì)蔬菜的毒害效應(yīng)及臨界值研究[D]. 沈紅.福建農(nóng)林大學(xué). 2010
本文編號(hào):3532585
【文章來(lái)源】: 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:84 頁(yè)
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摘要
ABSTRACT
縮略詞表
引言
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 鉻是生物毒性極強(qiáng)的重金屬元素
2 鉻對(duì)植物的毒害效應(yīng)
2.1 鉻影響植物種子萌發(fā)
2.2 鉻影響植物生長(zhǎng)和發(fā)育
2.3 鉻影響植物生理代謝
2.4 鉻影響水分吸收和養(yǎng)分平衡
2.5 鉻誘導(dǎo)產(chǎn)生氧化脅迫
3 植物鉻脅迫響應(yīng)分子機(jī)制
3.1 螯合作用
3.1.1 植物絡(luò)合素(PCs)
3.1.2 金屬硫蛋白(MTs)
3.2 重金屬轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的調(diào)控
3.2.1 Nramp家族轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白
3.2.2 HMA家族轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白
3.3 抗氧化防御系統(tǒng)
4 植物重金屬脅迫響應(yīng)miRNAs分離鑒定與調(diào)控機(jī)制
4.1 重金屬脅迫響應(yīng)miRNAs分離鑒定
4.2 miRNAs介導(dǎo)的重金屬脅迫響應(yīng)調(diào)控機(jī)制
5 本研究目的和意義
第二章 蘿卜Cr脅迫響應(yīng)microRNAS分離鑒定
1 材料與方法
1.1 植物材料與脅迫處理
1.2 試驗(yàn)方法
1.2.1 總RNA提取及檢測(cè)
1.2.2 小分子RNA文庫(kù)構(gòu)建和測(cè)序
1.2.3 測(cè)序數(shù)據(jù)分析
1.2.4 Cr脅迫響應(yīng)miRNAs差異分析
1.2.5 Cr脅迫響應(yīng)miRNAs靶基因分析
1.2.6 RT-qPCR分析驗(yàn)證
2 結(jié)果與分析
2.1 蘿卜肉質(zhì)根小RNA文庫(kù)序列分析
2.2 已知miRNAs分離鑒定
2.3 新型miRNAs分離鑒定
2.4 Cr脅迫響應(yīng)miRNAs分離鑒定
2.5 miRNAs靶基因預(yù)測(cè)與功能注釋
2.6 miRNAs及其靶基因RT-qPCR驗(yàn)證
3 討論
3.1 蘿卜Cr脅迫響應(yīng)的miRNAs分子特征
3.2 蘿卜Cr脅迫響應(yīng)的轉(zhuǎn)錄因子和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)
3.3 蘿卜miRNAs介導(dǎo)的Cr脅迫響應(yīng)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)
第三章 蘿卜Nramp家族基因克隆與功能初步分析
1 材料與方法
1.1 蘿卜Nramp家族基因克隆
1.2 蘿卜Nramp家族基因過(guò)表達(dá)載體構(gòu)建
1.3 轉(zhuǎn)基因煙草遺傳轉(zhuǎn)化及分子鑒定
1.4 蘿卜Nramp家族基因表達(dá)特性分析
2 結(jié)果與分析
2.1 擴(kuò)增和克隆
2.2 蘿卜Nramp家族基因序列克隆及分析
2.3 蘿卜Nramp家族基因過(guò)表達(dá)載體酶切檢測(cè)
2.4 重組質(zhì)粒農(nóng)桿菌工程菌鑒定
2.5 Nramp家族基因轉(zhuǎn)基因煙草功能驗(yàn)證
2.6 蘿卜Nramp家族基因表達(dá)特性分析
3 討論
3.1 蘿卜Nramp家族基因序列特征與表達(dá)特性
3.2 植物Nramp基因調(diào)控的重金屬脅迫響應(yīng)特征
全文結(jié)論
本文創(chuàng)新之處
參考文獻(xiàn)
碩士在讀期間發(fā)表論文
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
博士論文
[1]蘿卜胚發(fā)生相關(guān)基因鑒定及新型SSR標(biāo)記開(kāi)發(fā)[D]. 翟璐璐.南京農(nóng)業(yè)大學(xué). 2014
[2]蘿卜鎘吸收累積性狀QTLs定位與相關(guān)基因鑒定[D]. 徐良.南京農(nóng)業(yè)大學(xué). 2013
碩士論文
[1]土壤鉻對(duì)蔬菜的毒害效應(yīng)及臨界值研究[D]. 沈紅.福建農(nóng)林大學(xué). 2010
本文編號(hào):3532585
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