大球蓋菇Stropharia rugosoannulata是一種具有較強木質纖維素降解能力以及高營養(yǎng)的重要食用菌。此菌屬于四極性異宗結合擔子菌,但是交配型位點結構仍未被解析。本研究利用基因組數據通過生物信息學方法進行大球蓋菇的A和B交配型位點解析,并與其他大型真菌進行比較。結果顯示大球蓋菇的A交配型位點包含了一對保守的HD1和HD2基因,位點上下游基因的共線性較高,與Galerina patagonica和磚紅韌黑傘Hypholoma sublateritium相似度最高,A位點結構上也較為保守,在上下游具有保守的MIP、Sec61蛋白、甘氨酸脫氫酶和β側翼蛋白。B位點包含5個信息素受體和3個信息素前體基因,與其他真菌相比較發(fā)現,B位點及上下游基因的共線性較差,表明在不同的真菌中B位點變異性較大。本研究所獲得的結果將有助于詮釋大球蓋菇交配型位點結構,為今后的遺傳育種提供了理論依據。 

【文章來源】：菌物學報. 2020,39(06)北大核心CSCD

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【部分圖文】：

大球蓋菇A交配型位點的結構

通過共線性分析發(fā)現，不同真菌B交配型上下游基因的共線性較差，信息素前體和信息素受體橫跨的區(qū)域在大球蓋菇、磚紅韌黑傘、Galerina patagonica和灰蓋鬼傘分別為9 476bp、5 867bp、7 770bp和48 995bp，在草菇基因組中跨度最大，僅僅在同一個scaffold上的PP1-STE3之間就達到了76 748bp。雖然它們之間的共線性相對較差，但是大球蓋菇與磚紅韌黑傘相似度更近，與灰蓋鬼傘相比，結構組成完全不同，可見親緣關系越近，共線性越好。圖3 大球蓋菇信息素前體的多序列比對

大球蓋菇信息素前體的多序列比對


本文編號：3096746