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蠟梅花芽分化及發(fā)育過程中的轉錄組特征分析

發(fā)布時間:2020-12-05 17:27
  蠟梅(Chimonanthus praecox(L.)Link),屬于蠟梅科蠟梅屬植物,原產中國,是我國傳統(tǒng)的名貴觀賞花木,在中國有近1000年的栽培歷史。與大多數(shù)木本植物在春夏開花不同,蠟梅盛開于寒冷的冬季,花色淡黃,花香四溢,因此具有極高的觀賞價值和經(jīng)濟價值。但其盛開在冬季的具體的原因暫未有人報導。目前,對蠟梅花期的相關研究僅僅停留在對其花芽發(fā)育不同階段的石蠟切片觀察上,缺少這種變化相關分子機理的研究。本文在前人對蠟梅花芽發(fā)育過程中花芽石蠟切片形態(tài)學研究的基礎上,對蠟梅的花芽連續(xù)采樣并進行轉錄組測序,得到了蠟梅花芽從開始分化直至開花全階段的轉錄組數(shù)據(jù),并結合切片觀察數(shù)據(jù)對發(fā)育重點階段的轉錄組進行差異表達基因分析。獲得的主要結果如下:1、通過對蠟梅花芽樣品的連續(xù)采樣,提取RNA并測序,得到了未分化期,分化過渡期,花被片原基形成期,雄蕊原基形成期,雌蕊原基形成期,花芽發(fā)育期,花芽緩慢發(fā)育期,子房及胚珠發(fā)育期,花粉粒發(fā)育期,初花期等10個時期的轉錄組數(shù)據(jù)庫。結合切片觀察結果,以及測序數(shù)據(jù)的相關性及PCA分析,將這10個階段劃分為3個關鍵過程:花芽分化期(未分化期-雌蕊原基分化期);花器官... 

【文章來源】:華中農業(yè)大學湖北省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:104 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

蠟梅花芽分化及發(fā)育過程中的轉錄組特征分析


蠟梅花芽分化各時期樣品形態(tài)

測序,字母,占比,轉錄組


各時期測序原始數(shù)據(jù)占比Fig.2Class近口tionofraw沈adsineach‘ta譽圖中字母代表時期:幾uD.b.皿衛(wèi)已TPD,

測序,生物學,樣品,數(shù)據(jù)


25圖 3 10 個時期共 30 個樣品測序數(shù)據(jù)之間的相關性比較Fig.3 Correlation between sequence data of 30 samples in all ten stages本次采樣共 10 個時期,每個時期設有 3 個生物學重復,生物學重復間樣品的差異過大會影響到后續(xù)的所有分析。為了奠定可靠的分析基礎,進行生物學重復間的相關性比較十分的有必要。本實驗通過皮爾遜相關系數(shù)來統(tǒng)計各生物學樣品間的差異以及不同時期之間的差異。原則上,相同時期的生物學重復間的相關性應大于80%。通過圖 3 可以發(fā)現(xiàn),所有時期的生物學重復間的相關系數(shù)均大于 90,說明這些生物學重復是可靠的,可以進行后續(xù)分析。通過該圖還能發(fā)現(xiàn), EFP 階段的 3 個生物學重復整體上與其他 9 個時期有較大差異,相關性較低,平均為 60%,這說明該階段相比與開花前的幾個階段,基因表達出現(xiàn)了較大差異。在相關性分析的基礎上,本實驗還對總共 30 個樣品進行了 PCA 主成分分析分

【參考文獻】:
期刊論文
[1]植物WRKY轉錄因子的研究進展[J]. 梁濱,董冬.  生物學通報. 2018(06)
[2]3種木蘭屬植物花芽分化時期及形態(tài)變化[J]. 范李節(jié),陳夢倩,王寧杭,申亞梅,張壽洲.  東北林業(yè)大學學報. 2018(01)
[3]高等植物成花誘導的分子機理研究進展[J]. 周琴,張思思,包滿珠,劉國鋒.  分子植物育種. 2018(11)
[4]桂花花芽分化和花開放研究進展[J]. 王英,張超,付建新,趙宏波.  浙江農林大學學報. 2016(02)
[5]植物芽休眠調控分子機制研究進展[J]. 丁安琪,馮瑩,潘騰飛,郭志雄,潘東明.  分子植物育種. 2015(09)
[6]玉米小分子熱激蛋白ZmHSP17.7基因的克隆與功能分析[J]. 孫愛清,葛淑娟,董偉,單曉笛,董樹亭,張杰道.  作物學報. 2015(03)
[7]梅花成花及其調控研究進展[J]. 江波,方仲相,方佳,何勇清,鄭炳松.  科技通報. 2014(03)
[8]蠟梅花被片表層形態(tài)觀察及其意義[J]. 方子義,趙凱歌,陳龍清.  廣西植物. 2013(04)
[9]花器官發(fā)育的分子機制研究進展[J]. 唐璐璐,宋云澎,李交昆.  西北植物學報. 2013(05)
[10]植物熱激蛋白70的分子作用機理及其利用研究進展[J]. 齊妍,徐兆師,李盼松,陳明,李連城,馬有志.  植物遺傳資源學報. 2013(03)

碩士論文
[1]蠟梅科四種植物花芽分化及花發(fā)育的形態(tài)學比較研究[D]. 李來.華中農業(yè)大學 2018
[2]蠟梅抗寒相關轉錄因子CpICE1a、CpICE1b和CpDREB1的克隆及功能初探[D]. 張倩.華中農業(yè)大學 2017
[3]蠟梅類黃酮3’-羥化酶基因(CpF3’H)及其啟動子功能初探[D]. 俞美麗.華中農業(yè)大學 2017
[4]蠟梅科植物基因組大小預測與核型分析[D]. 董雷.華中農業(yè)大學 2017



本文編號:2899819

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