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荷花遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建及株型相關(guān)性狀QTLs分析

發(fā)布時間:2020-10-24 09:29
   荷花(Nelumbo nucifera Gaertn.)是一種集觀賞、食用和藥用等功能于一身的多年生水生草本植物,具有重要的經(jīng)濟和文化價值。荷花產(chǎn)業(yè)化發(fā)展的關(guān)鍵在于培育具有多種優(yōu)良觀賞性狀的新品種,目前雜交育種依然是荷花新品種選育的常用方式。效率低、周期長,觀賞性狀遺傳機理復雜,直接找到控制這些性狀的關(guān)鍵基因十分困難。為挖掘控制荷花株型相關(guān)性狀的遺傳因子,本研究以小株型品種‘艷陽高照’為父本,大株型品種‘建選-35’為母本,構(gòu)建了135株目標性狀分離良好的F1代作圖群體,利用SSR、InDel分子標記技術(shù),構(gòu)建了荷花遺傳連鎖圖譜。將株型性狀分解為立葉高、花柄高、葉長、葉寬、花徑5組緊密相關(guān)的表型性狀,通過對5組表型性狀進行測量和統(tǒng)計分析,用復合區(qū)間作圖法檢測相關(guān)QTLs位點,主要結(jié)果如下:(1)利用210對多態(tài)性引物(SSR引物150對、InDel引物60對),135株荷花F1代為作圖群體,構(gòu)建了包含145個標記,11個連鎖群的荷花遺傳連鎖圖譜,該圖譜覆蓋基因組長度625.0cM,標記間平均圖距4.31cM。其中LG1遺傳距離為99.1cM,標記數(shù)量最多,為91個;LG11遺傳距離為33.9cM,標記數(shù)量最少,僅有2個。(2)共檢測到14個QTLs位點,可解釋表型變異系數(shù)為6.6%~12.0%。其中控制立葉高性狀的QTLs位點最多為6個,控制花徑的QTLs位點為4個,控制葉長的QTLs位點為2個,控制花柄高、葉寬的QTLs位點各有1個?傊,本研究構(gòu)建的荷花遺傳連鎖圖譜,14個荷花株型相關(guān)性狀QTLs位點,將為荷花其他觀賞性狀的研究奠定理論和實踐的雙重基礎(chǔ),對指導荷花株型相關(guān)性狀的分子標記輔助育種具有重要意義。
【學位單位】:華中農(nóng)業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位年份】:2018
【中圖分類】:S682.32
【部分圖文】:

園藝,親本,西湖,情況


父本-小株型-艷陽高照 母本—大株型—建選 35圖 2-1 親本在華中農(nóng)業(yè)大學花卉基地情況Fig.2-1 Parents' growth at huazhong agricultural university

中農(nóng),親本,情況,園藝


父本-小株型-艷陽高照 母本—大株型—建選 35圖 2-1 親本在華中農(nóng)業(yè)大學花卉基地情況Fig.2-1 Parents' growth at huazhong agricultural university圖 2-2 親本在西湖園藝公司基地情況

遺傳圖譜,中農(nóng),群體,情況


圖 2-3 F1 群體在華中農(nóng)業(yè)大學花卉基地情況Fig.2-3 F1 population growth at huazhong agricultural university2.2.2 分子標記的選擇與開發(fā)2.2.2.1 620 對 SSR 引物的選擇與開發(fā)本研究用于構(gòu)建荷花遺傳圖譜的 SSR 引物有 4 個來源:(1)其中 250 對由美國 Illinois 大學香檳分校 Ray Ming 教授根據(jù)‘中國古代蓮’的全基因組測序信息開發(fā),命名為“SSR+序號”(Ming R et al 2013);(2)50 對來源于已發(fā)表的荷花SSR 引物開發(fā)的文獻中的(Pan et al 2007;Pan et al 2010;Tian et al 2008;Kubo et al2009a; Kubo et al 2009b),被加以前綴“Nelumbo”、“NS”、"NSh"和“PR”的為基因組 SSR 引物,而前綴為“NNEST”和“NSe”的為 EST-SSR 引物;(3)第三部分由武漢大學基于熱帶蓮全基因組測序信息開發(fā),其研究人員隨機選擇 120 對SSR 標記,命名為“NnSSR+序號”,30 對 EST-SSR 用于熱帶蓮與中國蓮的遺傳多
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