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國外引進(jìn)辣椒種質(zhì)資源多樣性分析

發(fā)布時(shí)間:2020-07-29 09:00
【摘要】:辣椒(Capsicum spp.)為茄科(Solanaceae)辣椒屬(Capsicum)的一年生或多年生草本植物。辣椒資源搜集和遺傳多樣性研究對(duì)辣椒育種工作具有重要意義。國內(nèi)辣椒種質(zhì)資源與國外資源遺傳差異較大、親緣關(guān)系較遠(yuǎn),引入國外種質(zhì)后可豐富遺傳背景、擴(kuò)大資源儲(chǔ)備,為辣椒遺傳育種打下堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。本試驗(yàn)從國外引進(jìn)30份辣椒種質(zhì)材料,結(jié)合形態(tài)學(xué)標(biāo)記、ISSR(inter-simple sequence repeat)分子標(biāo)記和MSAP(methylation sensitive amplification polymorphism)標(biāo)記三種方法,分析其遺傳和表觀遺傳多樣性,為辣椒種質(zhì)收集、遺傳研究與育種實(shí)踐提供了優(yōu)異材料和理論參考。具體研究內(nèi)容和獲得的結(jié)果如下:1、利用39個(gè)表型性狀,采用變異系數(shù)、多樣性指數(shù)和聚類分析等方法,對(duì)國外引進(jìn)的30份辣椒種質(zhì)資源進(jìn)行了遺傳多樣性分析。結(jié)果表明:國外引進(jìn)辣椒種質(zhì)39個(gè)表型性狀的平均變異系數(shù)為42.14%;基于39個(gè)表型性狀,在歐氏距離為13.75時(shí),可以把30份辣椒材料分成三個(gè)類群,第Ⅰ類群包括8個(gè)材料,第Ⅱ類群包括10個(gè)材料,第Ⅲ類群包括12個(gè)材料。30份國外引進(jìn)的辣椒種質(zhì)資源表型性狀的變異程度和多樣性指數(shù)較高,具有豐富的變異程度和多樣性。2、利用ISSR標(biāo)記對(duì)30份國外引進(jìn)的辣椒種質(zhì)資源進(jìn)行遺傳多樣性研究。從96條ISSR引物中篩選出8條多態(tài)性引物對(duì)30份辣椒材料進(jìn)行ISSR-PCR的擴(kuò)增,共擴(kuò)增1781條帶,多態(tài)性條帶數(shù)為1389條,多態(tài)性比率為77.99%。用NTSYS-pc2.10統(tǒng)計(jì)軟件的UPGMA法對(duì)30份國外引進(jìn)的辣椒種質(zhì)材料的ISSR擴(kuò)增結(jié)果進(jìn)行聚類,在遺傳相似系數(shù)GS=0.724(L1)處,可以將30份辣椒種質(zhì)材料分為三大類;第一大類共19份辣椒材料,第二大類共10份辣椒種質(zhì)資源,第三大類:只有編號(hào)為167的一份辣椒資源。主坐標(biāo)分析與聚類分析結(jié)果大體一致,交叉分類結(jié)果更為直觀。3、利用MSAP技術(shù)對(duì)30份國外引進(jìn)辣椒資源的DNA甲基化多樣性研究。從63對(duì)MSAP引物中,篩選出9對(duì)重復(fù)性較好和條帶清晰的引物,對(duì)30份國外引進(jìn)的辣椒材料基因組DNA進(jìn)行MSAP擴(kuò)增。DNA甲基化模式分析表明,辣椒甲基化模式主要以全甲基化為主;但是本研究MSP(Methylation-sensitive polymorphisms)聚類和MISP(Methylation-insensitive polymorphisms)聚類均比較離散,相關(guān)主坐標(biāo)分析與其聚類分析結(jié)果基本一致,DNA甲基化研究并沒有將一年生辣椒聚為一個(gè)類群,由此表明,辣椒表觀遺傳變異相對(duì)于基因組遺傳變異更為豐富。4、通過對(duì)形態(tài)學(xué)性狀和ISSR分子標(biāo)記進(jìn)行的遺傳多樣性分析表明,這兩種分析方法基本上能把一年生辣椒聚為同一類,而DNA甲基化分析時(shí)采用MSP聚類和MISP聚類均不能把一年生辣椒聚為相同類群。由此說明,表觀遺傳多樣性較遺傳多樣性更具有離散性,30份國外引進(jìn)的辣椒種質(zhì)資源表觀遺傳多樣性較遺傳多樣性更為豐富。
【學(xué)位授予單位】:仲愷農(nóng)業(yè)工程學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:S641.3
【圖文】:

辣椒,種質(zhì)資源,農(nóng)藝性狀,種質(zhì)


192 198 199圖 1 國外引進(jìn) 30 份辣椒種質(zhì)資源2.2 研究方法2.2.1 田間設(shè)計(jì)于 2016 年,30 份辣椒種質(zhì)在廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜研究所白云試驗(yàn)基地種植。種子于 7 月 23 日播種,幼苗于 8 月 20 日定植,株行距 30 cm×40 cm,完全隨機(jī)排列,每小區(qū)種植 12 株。每份資源各性狀測(cè)量 3 次,取其平均值。2.2.2 農(nóng)藝性狀測(cè)定描述的方法與標(biāo)準(zhǔn)30 份辣椒種質(zhì)農(nóng)藝性狀描述及賦值標(biāo)準(zhǔn)參照《辣椒種質(zhì)資源描述規(guī)范和數(shù)

聚類樹,亞類,葉面


17圖 2 辣椒資源聚類樹狀圖Ⅲ亞類包括 12 個(gè)材料,由表 6 可知,它們的熟性、主莖的顏色、葉寬、葉面茸毛、葉面特征、首花節(jié)位、單節(jié)葉腋著生花數(shù)、花果面棱溝、果面特征、果肩形狀、果頂形狀、商品果橫徑、果形等性狀值高于第Ⅰ亞類和第Ⅱ亞類,而葉色、葉形、青熟果色、果L1=15.47

電泳圖譜,辣椒,引物,材料


835和886這二條引物的多態(tài)率較低,分別為73%和72.4%。由此可見辣椒種質(zhì)資源存在極為豐富的遺傳多樣性,利用分子標(biāo)記可以檢測(cè)辣椒種質(zhì)間的親緣關(guān)系。圖3~6分別為引物編號(hào)807、808、809、810、835、836、840和886這8條引物在編號(hào)為156、157、158、159、160、162、163、164、165、166、167、168、169、171、172、173、174、175、177、178、180、181、182、183、184、190、191、192、198和199這30個(gè)辣椒材料中的ISSR-PCR擴(kuò)增電泳圖譜。圖右邊第1列為MAKER1000,每個(gè)泳道為一個(gè)辣椒材料。表7 30份辣椒資源8條ISSR引物PCR擴(kuò)增位點(diǎn)的多樣性引物 引物序列(5'-3') 總條帶數(shù) 多樣性條帶數(shù) 多樣性比例(%)807 AGAGAG AGAGAG AGA GT 186 148 79.57808 AGAGAG AGAGAG AGA GC 229 181 79.04809 AGAGAG AGAGAG AGA GG 208 180 86.54810 GAGAGA GAGAGA GAG AT 230 175 76.09835 AGAGAGAGAGAGAGAGYC 263 192 73.00836 AGAGAGAGAGAG AGAGYA 222 175 78.83840 GAGAGAGAGAGAGAG AYT 193 157 81.35886 VDV CTC TCT CTC TCT CT 250 181 72.40合計(jì) 1781 1389平均 222.63 173.63 77.99注:Y = (C,T),V = (A,C,G) (i.e. not T),D = (A,G

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2773741

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