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結縷草ZjCSD1和ZjCCS基因的克隆與功能初步研究

發(fā)布時間:2020-07-18 21:57
【摘要】:銅鋅超氧化物歧化酶(CSD)是植物響應逆境脅迫過程中的關鍵酶,其含量和活性與植物抗逆性密切相關。CSD基因已在多種植物中完成了克隆與功能鑒定,而關于結縷草CSD基因的報道很少。本研究以結縷草cDNA為模板,利用同源克隆法,從結縷草轉錄組數據庫中獲得了結縷草ZjCSD1基因,該基因編碼一個含有152個氨基酸的蛋白質。生物信息學分析表明:ZjCSD1基因編碼蛋白為穩(wěn)定的、親水的、酸性、非分泌脂溶蛋白,含有CSD蛋白家族特有的保守結構域,具有典型的Cu2+和Zn2+結合位點;與小米、玉米等禾本科植物具有較高的同源性,親緣關系較近。亞細胞定位表明ZjCSD1蛋白定位于細胞質中。采用實時熒光定量PCR研究該基因在不同組織中、不同脅迫處理下的表達模式,結果表明:ZjCSD1基因在結縷草的根、莖和葉中都有表達,且葉中的表達量最高;干旱脅迫(30%PEG)、鹽脅迫(150 mM NaCl)和Cd2+脅迫(200 mg/l Cd2+)均能誘導ZjCSD1基因表達量上調,Pb2+脅迫(1 g/1 Pb2+)誘導ZyjCSSD1基因表達量下調。因此結縷草ZjCSD1基因響應干旱、鹽和重金屬脅迫。通過農桿菌介導法,在禾本科模式植物水稻中過表達ZjCSD1基因,成功獲得并鑒定了 102個轉基因水稻株系。轉基因子代的表型有待后續(xù)試驗探究。CSD的激活主要依賴于其銅分子伴侶蛋白,銅鋅超氧化物歧化酶銅分子伴侶蛋白(CCS)是一種胞內銅轉運蛋白,其功能是通過蛋白間相互作用,將銅離子運輸給CSD,進而激活CSD。在本實驗室前人研究的基礎上,本文通過RACE擴增得到了ZjCCS基因ORF前的75個堿基序列以及3種不同長度的3'-UTR序列,同時發(fā)現ZjCCS基因可以從兩個不同的轉錄起始位點開始轉錄。亞細胞定位分析表明ZjCCS全長蛋白定位于葉綠體,而去掉轉運肽的ZjCCS蛋白定位于細胞質。采用實時熒光定量PCR研究ZjCCS基因在結縷草不同組織中的表達模式,發(fā)現ZjCCS基因在根、莖和葉中都有表達,且葉中的表達量最高,根中的最低。通過農桿菌介導法,在水稻中過表達ZjCCS基因,成功獲得并鑒定了 30個轉基因水稻株系。轉基因子代的表型有待后續(xù)試驗探究。此外,通過酵母雙雜和BiFC證明了去掉葉綠體轉運肽的結縷草ZjCCS蛋白能夠與ZjCSD1蛋白在細胞質中互作,且ZjCCS第160~286個氨基酸區(qū)段在互作的過程中至關重要。綜上所述,本文對結縷草ZjCSD1和ZjCCS基因進行了克隆與功能初步研究,有利于進一步了解CSD和CCS基因在結縷草應對逆境脅迫過程中的作用,并為后期研究結縷草中CCS激活CSD的分子機制提供理論依據。
【學位授予單位】:北京林業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2017
【分類號】:S688.4
【圖文】:

擬南芥,微量營養(yǎng)素,基因組測序,靶標


完成了基因組測序,因此被廣泛用于遺傳和分子研究。植物是復雜的多細胞生物,在逡逑運輸銅等必需微量營養(yǎng)素的過程中要通過較長的距離,且在到達靶位點之前需要跨越逡逑多個膜系統。如圖1-2所示,COPT1是一種類Ctr轉運蛋白,銅離子在COPT1的作逡逑用下從質外體跨過細胞膜,進入細胞內,再由銅伴侶蛋白螯合或運輸至靶標。COPT1逡逑7逡逑

蛋白,結縷草,理化性質,工具


2.3.2結縷草Zy‘CSZ)7基因編碼蛋白的理化性質與結構特征分析逡逑利用在線工具Protparam預測ZyCST)/基因編碼蛋白的基本理化性質,結果表明逡逑該蛋白相對分子量為15.0836kD,分子式為C644Hu)29N1970216S3,理論等電點5.76。由逡逑18種氨基酸組成,其中Gly占19.7%,比例最高。蛋白質不穩(wěn)定指數為]4.50邋(>40逡逑時不穩(wěn)定),脂溶指數為77.63,總平均疏水指數為-0.257。因此推測該蛋白是穩(wěn)定的、逡逑酸性、親水脂溶蛋白。利用TMHMM2.0在線工具預測ZjCSD]蛋白的跨膜結構域,逡逑結果表明ZjCSDl蛋白無跨膜螺旋,整條肽鏈都位于膜外;利用在線工具SignalP邋4.1逡逑對ZjCSDl蛋白的信號肽進行預測,結果顯示ZjCSDl蛋白N端不含信號肽,為非分逡逑泌蛋白;利用TargetP邋1.1對ZjCSDl蛋白進行亞細胞定位預測,結果表明ZjCSDl蛋逡逑白位于細胞質中。綜上推測ZjCSDl蛋白是位于細胞質中的非分泌蛋白。逡逑2.3.3結縷草Zy_C5D7基因編碼氨基酸序列同源性與系統進化分析逡逑在NCBI中,利用Blast檢索并下載與結縷草ZyCSDY基因編碼的氨基酸序列相逡逑似性較高的序列,在DNAMAN中進行比對。結果表明,ZJCSD/基因編碼的氨基酸逡逑序列與玉米中的相似性達91%,與二穗短柄草、獐茅、歐洲大葉楊等相似性達逡逑85°/。?89%。另外,CSD蛋白的不同氨基酸區(qū)段序列保守程度不同,C端序列較N端逡逑

多重序列,物種,系統進化樹分析,節(jié)點


圖2-5邋ZjCSDl蛋白與其他物種CSD蛋白氨基酸序列的系統進化樹分析;節(jié)點處的數字表示逡逑bootstrap驗證重復1000次該節(jié)點可信度的百分比逡逑Fig.2-5邋Phylogenetic邋tree邋of邋ZjCSDl邋and邋CSD邋from邋other邋species.邋The邋number邋on邋the邋brunch邋represents逡逑the邋reliability邋percent邋of邋bootstrap邋value邋based邋on邋1000邋replications.逡逑22逡逑

【參考文獻】

相關期刊論文 前2條

1 馮勛偉;才宏偉;;結縷草CBF基因的同源克隆及其轉基因擬南芥的抗寒性驗證[J];作物學報;2014年09期

2 張玉秀;金玲;馮珊珊;劉金光;柴團耀;;鎘對鎘超累積植物龍葵抗氧化酶活性及基因表達的影響[J];中國科學院研究生院學報;2013年01期

相關博士學位論文 前3條

1 荊曉姝;秋茄葉綠體抗氧化防御基因KcCSD和KcTrxf的耐鹽性功能分析[D];北京林業(yè)大學;2015年

2 許立新;草地早熟禾適應干旱以及干旱后復水恢復機理研究[D];北京林業(yè)大學;2011年

3 王舟;結縷草(Zoysia japonica)抗寒相關轉錄因子ZjDREB1基因的克隆、表達模式及功能分析[D];南京農業(yè)大學;2010年

相關碩士學位論文 前2條

1 樊波;結縷草中鹽脅迫響應基因的克隆與功能研究[D];北京林業(yè)大學;2016年

2 石鵬;干旱預處理誘導白三葉抗旱性的生理機制與抗氧化酶基因差異表達[D];四川農業(yè)大學;2012年



本文編號:2761481

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