胭脂花和小報(bào)春自交與型間雜交親和性基因的挖掘
發(fā)布時間:2020-07-07 23:52
【摘要】:花柱異型自交不親和(Self-incompatibility,SI)是植物為了促進(jìn)蟲媒授粉進(jìn)化形成的一種重要的繁殖機(jī)制,開花植物中至少28個科存在花柱異型現(xiàn)象,大部分花柱異型植物都是自交不親和的。報(bào)春花科報(bào)春花屬(Primula)植物作為研究花柱異型植物的模式物種一直受到植物學(xué)家的關(guān)注,然而控制花柱異型以及自交不親和性狀的關(guān)鍵基因以及分子調(diào)控機(jī)制仍未知。本研究設(shè)置胭脂花(Primula maximowiczii Regel)和小報(bào)春(Primula forbesii Franch.)不同授粉組合,進(jìn)行授粉后的雌蕊轉(zhuǎn)錄組測序,通過對型間雜交親和與自交不親和反應(yīng)中轉(zhuǎn)錄表達(dá)基因的生物信息學(xué)和表達(dá)分析,挖掘兩種報(bào)春花花柱二型自交與型間雜交親和性的關(guān)鍵基因,為探究胭脂花與小報(bào)春自交不親和的分子調(diào)控機(jī)制奠定基礎(chǔ)。主要結(jié)果如下:1.胭脂花和小報(bào)春都是典型的花柱二型植物,長、短花柱花差異明顯。胭脂花長、短花柱的乳突細(xì)胞長度存在顯著差異,而花柱細(xì)胞大小差異不顯著;小報(bào)春長、短花柱的乳突細(xì)胞長度也存在顯著差異,而長花柱的細(xì)胞顯著比短花柱的長。2.通過胭脂花長花柱不親和(PS)與親和(PT)、短花柱不親和(TS)與親和(TP)處理的比較(PS vs PT、TS vs TP),獲得長花柱花與親和性相關(guān)的差異表達(dá)基因1311個,短花柱花與親和性相關(guān)的差異表達(dá)基因1048個,其中93.68%的差異基因在長、短花柱的中表達(dá)不一致。差異基因分析顯示,應(yīng)激反應(yīng)、能量代謝以及碳水化合物代謝等通路的基因參與了胭脂花親和與不親和反應(yīng)過程,特別是病原菌互作通路與胭脂花的親和性顯著相關(guān)。采用Tunel染色法觀察授粉后花粉管中的程序性細(xì)胞死亡,發(fā)現(xiàn)在長、短花柱的SI反應(yīng)中存在一定程度的程序性細(xì)胞死亡(PCD)。另外,通過長花柱兩個處理組合與短花柱兩個處理組合的兩兩比較,獲得可能與花柱二型特征相關(guān)的差異表達(dá)基因826個,其中554個差異基因在長花柱處理中特異高表達(dá),268個在短花柱處理中特異高表達(dá)。這些基因顯著富集到蛋白酶體與核糖體等相關(guān)通路。3.小報(bào)春轉(zhuǎn)錄組測序組裝得到114 474個unigenes,有29 899個基因注釋到GO庫,有7 775個基因注釋到KEGG庫。獲得小報(bào)春長、短花柱花與親和性相關(guān)的差異表達(dá)基因242個,其中約90%差異基因在在PS vs PT與TS vs TP中表達(dá)不一致,這個結(jié)果與胭脂花一致。差異基因分析表明,長花柱雜交親和與自交不親和特異表達(dá)基因主要富集到碳水化合物代謝過程與超氧化物代謝相關(guān)通路,而短花柱親和性差異基因主要富集到細(xì)胞壁組織與細(xì)胞代謝等相關(guān)通路。另外,獲得小報(bào)春長、短花柱中差異表達(dá)的基因28個,其中長花柱特異高表達(dá)基因有19個,短花柱特異高表達(dá)基因有5個,這些基因富集到碳水化合物、細(xì)胞分化等通路。4.對胭脂花與小報(bào)春的兩個轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行比較分析,胭脂花與小報(bào)春共有的同源基因家族有13664個,其中單拷貝基因家族有7 154個。對胭脂花與小報(bào)春的單拷貝同源基因家族基因進(jìn)行Ka/Ks分析,獲得受正向選擇的同源基因282個。這些基因顯著富集到細(xì)胞過程、植物病原菌通路。另外,獲得胭脂花與小報(bào)春5對與長花柱親和性相關(guān)的同源基因,4對與短花柱親和性相關(guān)的同源基因,以及可能與胭脂花以及小報(bào)春的花柱異型相關(guān)的29對同源基因。5.從胭脂花與小報(bào)春轉(zhuǎn)錄組中分別篩選出17個表達(dá)較穩(wěn)定的候選內(nèi)參基因,對長、短花柱花的花發(fā)育、花部器官、植物器官、授粉雌蕊和耐熱處理等5類植物組織進(jìn)行內(nèi)參基因篩選,其中PmGAPDH在胭脂花的植物器官、授粉雌蕊和耐熱處理中表現(xiàn)最穩(wěn)定,PmATP與PfEF-1α分別在花發(fā)育和花部器官中表達(dá)最穩(wěn)定;PfEIF5A在小報(bào)春植物器官和授粉雌蕊中表達(dá)最穩(wěn)定,PfRPⅡ、PfSAND和PfSKP1分別在花發(fā)育、授粉雌蕊和耐熱處理中表達(dá)最穩(wěn)定。選擇胭脂花和小報(bào)春AG、CHS、CML和HSP70等同源基因?qū)Ψ(wěn)定內(nèi)參進(jìn)行驗(yàn)證,結(jié)果表明它們表達(dá)穩(wěn)定。6.成功克隆胭脂花PmCML19和小報(bào)春PfCML19基因全長,構(gòu)建PmCML19和PfCML19植物表達(dá)載體,瞬時侵染煙草葉片,進(jìn)行亞細(xì)胞定位的觀察,發(fā)現(xiàn)這兩個基因在細(xì)胞核與細(xì)胞膜上都有分布。PmCML19和PfCML19在親和與不親和處理中表達(dá)差異,表明它們與胭脂花和小報(bào)春的親和性相關(guān)。另外,對7對胭脂花和小報(bào)春與親和性相關(guān)的同源基因、15對與花柱二型特征相關(guān)的同源基因在雜交組合以及花部器官組織中的表達(dá)模式分析,結(jié)果表明7對與親和性相關(guān)的同源基因在胭脂花與小報(bào)春型間雜交與自交處理中表達(dá)差異,另外獲得1對在長花柱特異表達(dá)的同源基因。本研究通過分析胭脂花與小報(bào)春型間雜交與自交不親和的轉(zhuǎn)錄組,獲得了大量與報(bào)春花親和性以及花柱二型相關(guān)的差異基因。這些數(shù)據(jù)將為挖掘調(diào)控胭脂花與小報(bào)春自交不親和以及花柱二型特征的重要基因提供基礎(chǔ),為進(jìn)一步研究它們關(guān)于花柱二型自交不親和的分子機(jī)制提供新的數(shù)據(jù)和重要的理論參考。
【學(xué)位授予單位】:北京林業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:S682.15
【圖文】:
逑化,引起辦07似/的降解,最后抑制花粉的萌發(fā),導(dǎo)致了邋SI的發(fā)生(Franklin-Tong,逡逑2008)。對這些結(jié)果進(jìn)行總結(jié)歸納,示意圖如下(圖1-2)。逡逑廣茄科gsi邐r^資栜⑶邐^邋r邋;:;s:i(4ssi邐^逡逑prps邐SP11邋SCR逡逑SLF邋SBF邐丨R%邐|邋iU邋別逡逑i邋u!R%邐Pl]s,,作邐srk逡逑?邐士邐」邐i邐T7f1:逡逑S-RNase邐Ca:+、K+流變化邐MI邋PK逡逑i邋T作邐Actin解聚f邋MAPK激沾、逡逑S-RNase邋以忭作川邐ROS、NO邐Ak|逡逑|邐故^曑邐~||EI』、°逡逑RNA邋降解邐4.邐+邐Wfb逡逑I邐擰丨i.:性細(xì)狍Mil\.邋(PCD)邐Exo70Al逡逑1邐i邐i逡逑花粉的抑|簇、/?逦花粉的抑|從﹀位ǚ鄣囊種品矗鈴義希皺澹叔澹鰣巍懾危澹觶擼擼擼咤澹叔義賢跡保膊煌越徊磺綴拖低車姆腫踴剖疽饌。辶x希疲椋紓澹保插澹櫻耄澹簦悖楨澹恚幔皰澹錚駑澹恚錚歟澹悖酰歟幔蟈澹恚澹悖瑁幔睿椋螅恚簀澹錚駑澹洌椋媯媯澹潁澹睿翦澹螅澹歟媯椋睿悖錚恚穡幔簦椋猓椋歟椋簦澹螅螅簦澹恚螅義希保脖ù夯ɑㄖ妥越徊磺綴脫芯拷瑰義媳ù夯ǹ票ù夯ㄊ糝參鐫諶瀾緋矗埃壩嘀鄭渲性加校梗埃サ謀ù夯ㄎ鎦志咤義嫌謝ㄖ妥越徊磺綴拖低常ǎ祝澹洌洌澹潁猓酰潁鑠澹幔睿溴澹遙椋悖瑁幔潁洌,邋1990)。灾]械幕ㄖ臀镥義現(xiàn)種,两旨埢配类型是窚\2灰謊模欠直鶚淺せㄖǎǎ穡椋睿┖投袒ㄖǎǎ簦瑁潁酰恚,辶x銑せㄖǖ幕ㄖ銑
本文編號:2745796
【學(xué)位授予單位】:北京林業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:S682.15
【圖文】:
逑化,引起辦07似/的降解,最后抑制花粉的萌發(fā),導(dǎo)致了邋SI的發(fā)生(Franklin-Tong,逡逑2008)。對這些結(jié)果進(jìn)行總結(jié)歸納,示意圖如下(圖1-2)。逡逑廣茄科gsi邐r^資栜⑶邐^邋r邋;:;s:i(4ssi邐^逡逑prps邐SP11邋SCR逡逑SLF邋SBF邐丨R%邐|邋iU邋別逡逑i邋u!R%邐Pl]s,,作邐srk逡逑?邐士邐」邐i邐T7f1:逡逑S-RNase邐Ca:+、K+流變化邐MI邋PK逡逑i邋T作邐Actin解聚f邋MAPK激沾、逡逑S-RNase邋以忭作川邐ROS、NO邐Ak|逡逑|邐故^曑邐~||EI』、°逡逑RNA邋降解邐4.邐+邐Wfb逡逑I邐擰丨i.:性細(xì)狍Mil\.邋(PCD)邐Exo70Al逡逑1邐i邐i逡逑花粉的抑|簇、/?逦花粉的抑|從﹀位ǚ鄣囊種品矗鈴義希皺澹叔澹鰣巍懾危澹觶擼擼擼咤澹叔義賢跡保膊煌越徊磺綴拖低車姆腫踴剖疽饌。辶x希疲椋紓澹保插澹櫻耄澹簦悖楨澹恚幔皰澹錚駑澹恚錚歟澹悖酰歟幔蟈澹恚澹悖瑁幔睿椋螅恚簀澹錚駑澹洌椋媯媯澹潁澹睿翦澹螅澹歟媯椋睿悖錚恚穡幔簦椋猓椋歟椋簦澹螅螅簦澹恚螅義希保脖ù夯ɑㄖ妥越徊磺綴脫芯拷瑰義媳ù夯ǹ票ù夯ㄊ糝參鐫諶瀾緋矗埃壩嘀鄭渲性加校梗埃サ謀ù夯ㄎ鎦志咤義嫌謝ㄖ妥越徊磺綴拖低常ǎ祝澹洌洌澹潁猓酰潁鑠澹幔睿溴澹遙椋悖瑁幔潁洌,邋1990)。灾]械幕ㄖ臀镥義現(xiàn)種,两旨埢配类型是窚\2灰謊模欠直鶚淺せㄖǎǎ穡椋睿┖投袒ㄖǎǎ簦瑁潁酰恚,辶x銑せㄖǖ幕ㄖ銑
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