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大別山特有植物都支杜鵑(Rhododendron shanii)的群體遺傳學(xué)研究

發(fā)布時(shí)間:2020-05-01 22:47
【摘要】:都支杜鵑作為杜鵑屬的一種,主要分布在我國(guó)的安徽與湖北的交界處,其生長(zhǎng)環(huán)境相對(duì)特殊,這也導(dǎo)致了目前我國(guó)自然生長(zhǎng)的都支杜鵑的居群面積較小,不利于都支杜鵑的發(fā)展,對(duì)此應(yīng)當(dāng)加強(qiáng)對(duì)都支杜鵑的研究和培育,這樣才能有效的開(kāi)發(fā)并保護(hù)都支杜鵑。目前對(duì)頻臨滅絕的物種的研究方面很多,最主要的就是對(duì)其遺傳多樣性的研究和分析,這不僅能夠了解瀕危物種的遺傳情況,同時(shí)還能夠提出科學(xué)的保護(hù)建議。本研究選用了 illuminaHiseq測(cè)序平臺(tái)的雙端測(cè)序模式進(jìn)行都支杜鵑cDNA均一化處理的高通量測(cè)序,通過(guò)軟件進(jìn)行大規(guī)模轉(zhuǎn)錄組簡(jiǎn)單重復(fù)序列的標(biāo)記的發(fā)掘,同時(shí)對(duì)其組成、分布及特征進(jìn)行分析。通過(guò)研究,我們一共篩選出了 24個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn),包含291個(gè)等位基因,各個(gè)位點(diǎn)的等位基因數(shù)(Na)的取值為3~21,所得到的多態(tài)性信息含量PIC計(jì)算結(jié)果為(mean ± SD)0.677 ± 0.212,其期望雜合度(HE)的最終計(jì)算結(jié)果為0.705 ±0.206,而觀測(cè)雜合度(Ho)的最終計(jì)算結(jié)果為0.704± 0.273,以上數(shù)據(jù)可以說(shuō)明所篩選的位點(diǎn)具有較高的多態(tài)性,作為研究的分子遺傳標(biāo)記是可靠的。而24個(gè)位點(diǎn)中有9個(gè)明顯偏離哈溫平衡,其他未發(fā)現(xiàn)偏離現(xiàn)象。本研究使用以上篩選的24個(gè)位點(diǎn)對(duì)采集自5個(gè)地理居群的都支杜鵑進(jìn)行群體遺傳學(xué)分析。主要從三個(gè)方面來(lái)分析都支杜鵑的遺傳特性,即其遺傳的多樣性、結(jié)構(gòu)性以及群體動(dòng)態(tài),最終得出如下結(jié)論:1)都支杜鵑大別山區(qū)的5個(gè)自然居群的研究結(jié)果為:期望雜合度取值范圍0.589~0.700、觀測(cè)雜合度取值范圍0.649~0.759,由此可以得出都支杜鵑居群的遺傳多樣性較高。2)對(duì)于都支杜鵑的5個(gè)群體我們分別做了遺傳距離分析、聚類分析,結(jié)果顯示:居群之間具有較大的遺傳差異。3)通過(guò)Msvar居群動(dòng)態(tài)分析發(fā)現(xiàn):各居群保持了一個(gè)相對(duì)比較穩(wěn)定狀態(tài),未經(jīng)歷居群的波動(dòng)。
【學(xué)位授予單位】:安徽大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:S685.21

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本文編號(hào):2647148

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