目的:1.為進(jìn)一步完善實(shí)驗(yàn)紅鯽C1HD系遺傳背景研究,建立實(shí)驗(yàn)紅鯽C1HD系的線粒體分子標(biāo)記,開展了實(shí)驗(yàn)紅鯽C1HD系線粒體DNA條形碼分析。2.為推廣實(shí)驗(yàn)紅鯽在核輻射生物學(xué)效應(yīng)方面的應(yīng)用研究,探討了¹³⁷Cs輻射對實(shí)驗(yàn)紅鯽HSP70表達(dá)的影響。方法:1.設(shè)計引物對驗(yàn)紅鯽C1HD系、金魚、同源二倍體金魚和同源二倍體紅鯽、鯽和白鯽等6種魚類的鯽屬魚類線粒體COI、COIII、Cytb和D-loop基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增,目的條帶經(jīng)回收、轉(zhuǎn)化后進(jìn)行測序,獲得測序結(jié)果。以鯉魚為外類群,結(jié)合NCBI中下載的序列,分別對每個基因的序列特征進(jìn)行分析,并計算種間和種內(nèi)遺傳距離,分析系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系。2.通過測序得到實(shí)驗(yàn)紅鯽、同源二倍體金魚、同源二倍體紅鯽和金魚線粒體基因組全序列,對實(shí)驗(yàn)紅鯽線粒體基因組全序列的結(jié)構(gòu)特征、堿基組成和密碼子使用頻率進(jìn)行分析。最后,結(jié)合NCBI中下載的有關(guān)鯽屬魚類的線粒體基因組全序列構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。3.根據(jù)實(shí)驗(yàn)紅鯽¹³⁷Cs輻射的LD_50/30,設(shè)計4.1Gy、6.1Gy、8.2Gy輻照劑量組與空白對照組,用輻照儀對...

【文章頁數(shù)】：76 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖2-16種鯽屬魚類不同標(biāo)記基因PCR產(chǎn)物電泳檢測圖

V占總序列長度的15.5%，簡約信息位點(diǎn)（PI）為65個，自裔位點(diǎn)（S）80個。從堿基組成來看（見表2-5），COI序列中4種堿基的平均含量分別是T：29.3%、C：26.2%、A：26.9%、G：17.6%，G的所占比例明顯低于其他3種堿基的比例，且G+C的含....

圖3-1線粒體基因組結(jié)構(gòu)圖

22個tRNA中有8個位于L鏈上，其他的結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析顯示，其中21種tRNA基因的結(jié)形狀（圖3-2），只有tRNASer（GCT）因二氫尿嘧完整的三葉草結(jié)構(gòu)(圖3-3)。

圖3一2實(shí)驗(yàn)紅卿CllD〕系tRNA三葉草結(jié)構(gòu)模型

其他密碼子的RSCU值均小于1，使用頻率較低，蛋白編碼基因在密碼子第三位點(diǎn)堿基的使用上也表現(xiàn)為明顯的AT偏向性。圖3-2實(shí)驗(yàn)紅鯽C1HD系tRNA三葉草結(jié)構(gòu)模型Figure3-2TheclassicalcloverleafstructureoftRNAge....

圖3一3實(shí)驗(yàn)紅螂Clll】〕系tRNA加結(jié)構(gòu)模型

其他密碼子的RSCU值均小于1，使用頻率較低，蛋白編碼基因在密碼子第三位點(diǎn)堿基的使用上也表現(xiàn)為明顯的AT偏向性。圖3-2實(shí)驗(yàn)紅鯽C1HD系tRNA三葉草結(jié)構(gòu)模型Figure3-2TheclassicalcloverleafstructureoftRNAge....

本文編號：3987423