浙南壇紫菜實(shí)驗(yàn)品系與傳統(tǒng)品系遺傳多樣性的AFLP分析
發(fā)布時(shí)間:2024-05-22 02:04
本研究利用擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性(AFLP)分子標(biāo)記技術(shù)從基因組DNA水平上分析壇紫菜新品系浙南3號(hào)(ZN3)和浙江主要壇紫菜栽培品系(YH)的遺傳差異,從16對(duì)選擇性擴(kuò)增引物中篩選出8對(duì)擴(kuò)增效果好的引物,并用這8對(duì)引物對(duì)YH和ZN3 2個(gè)壇紫菜群體進(jìn)行分析。結(jié)果顯示,60個(gè)壇紫菜個(gè)體中共檢測(cè)到964個(gè)有效位點(diǎn),其中多態(tài)位點(diǎn)955個(gè);壇紫菜2個(gè)群體整體水平上的多態(tài)位點(diǎn)百分率(PPL)為99.1%,2個(gè)群體各自的多態(tài)位點(diǎn)百分率分別是69.0%和81.5%,均值為75.3%。2個(gè)壇紫菜群體的Nei’s遺傳多樣性指數(shù)(H)為0.153 3和0.202 3,Shannon’s信息指數(shù)(I)為0.247 8和0.324 1,2個(gè)壇紫菜群體的總遺傳變異(Ht)和群體內(nèi)遺傳變異(Hs)分別為0.240 2和0.177 8,群體間遺傳分化系數(shù)(Gst)為0.252 6,即群體間遺傳變異占總變異的25.3%,群體內(nèi)遺傳變異占總變異的74.7%,表明不同品系的群體間遺傳分化程度較低。2個(gè)壇紫菜群體間基因流動(dòng)系數(shù)(Nm)為1...
【文章頁(yè)數(shù)】:5 頁(yè)
【部分圖文】:
本文編號(hào):3980238
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圖1壇紫菜部分AFLP選擇性擴(kuò)增結(jié)果
用16對(duì)引物組合對(duì)壇紫菜樣品進(jìn)行擴(kuò)增,共篩選出以下8對(duì)多態(tài)性好的引物組合:E-AAC/M-CAG、E-AAC/M-CTC、E-AAC/M-CTG、E-AAG/M-CAG、E-AAG/M-CTC、E-AAG/M-CTG、E-AGG/M-CAA、E-ACC/M-CTG。用篩選出的8對(duì)....
圖2基于遺傳距離的壇紫菜UPGMA(A)和NJ(B)聚類樹(shù)
表4群體間遺傳相似度和遺傳距離群體ZN3YHZN30.4111YH0.8890注:對(duì)角線上為遺傳相似度;對(duì)角線下為遺傳距離。3討論
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