α-淀粉酶是生物獲取能量所需要的重要酶類，在江河生態(tài)系統(tǒng)中，魚類由不同的食性構(gòu)成食物鏈體系，不同魚類的能量獲取途徑不同，但進(jìn)化過程中卻保持著相似的α-淀粉酶基因序列；研究魚類α-淀粉酶基因的表達(dá)調(diào)控序列，對(duì)揭示魚類食性功能群機(jī)制具有意義。 本研究應(yīng)用染色體步移方法，克隆獲得草魚的α-淀粉酶基因5′側(cè)翼序列，長(zhǎng)度為2,063bp。使用網(wǎng)絡(luò)生物信息學(xué)預(yù)測(cè)軟件對(duì)草魚α-淀粉酶基因的5′側(cè)翼序列進(jìn)行分析，預(yù)測(cè)草魚α-淀粉酶基因的啟動(dòng)子區(qū)域位于-252～-2bp處；草魚α-淀粉酶基因轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)（TSS）處于起始密碼子（ATG）上游30bp處；預(yù)測(cè)的草魚α-淀粉酶基因啟動(dòng)子區(qū)域包含有基本的啟動(dòng)子結(jié)構(gòu)元件：TATA盒和CAAT盒。轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)分析顯示，草魚α-淀粉酶基因5′側(cè)翼-385bp位點(diǎn)存在HNF3調(diào)控元件，序列為：“5-TTTTTTTGT-3”；另外，還發(fā)現(xiàn)有5個(gè)GR調(diào)控元件，其中有一個(gè)具有回文結(jié)構(gòu)，序列為“AGTTCTtgttgtTGTTCT”，可能具有應(yīng)答糖皮質(zhì)激素誘導(dǎo)的作用。 采用相同的方法，克隆得到鱤、鯪和廣東魴α-淀粉酶基因5′側(cè)翼序列，長(zhǎng)度分別2,268bp、1,635bp...

【文章頁(yè)數(shù)】：62 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖1-1實(shí)驗(yàn)原理簡(jiǎn)易圖

圖1-1實(shí)驗(yàn)原理簡(jiǎn)易圖1：α-淀粉酶基因5′側(cè)翼區(qū)域；2：α-淀粉酶基因外顯子；“”：未知的序列；“”：獲得的序列。Fig.1-1Thesimplediagramoftheprinciple1:α-amylasegene5′flankingseq....

圖2-2草魚α-淀粉酶基因外顯子部分及推導(dǎo)的氨基酸序列

的α-淀粉酶結(jié)構(gòu)一樣，魚類α-淀粉酶包含有8個(gè)α螺旋和8個(gè)β折疊；魚類α-淀粉酶的氨基酸序列中參與形成二硫鍵的半胱氨酸（Cys）殘基位點(diǎn)在不同物種中高度保守。獲得的草魚α-淀粉酶基因部分外顯子序列推導(dǎo)的氨基酸序列中，包含有2個(gè)α螺旋：α1、α2，和....

圖3-2輪步移PCR產(chǎn)物電泳圖

_v3/promo/promoinit.cgi?dirDlation.com/pub/programs.html）b/programs/alibaba2/index.htmttp://www.urogene.org/cgi-bin/m基因5′側(cè)翼序列的克隆，以草魚基因....

圖4-2α-淀粉酶基因5′側(cè)翼近端序列比對(duì)Figure4-2Sequencealignmentof5′flankingproximalsequencesofα-amylasegene

斑馬魚草魚鳡鯪廣東魴河鲀-1河鲀-2河鲀-3尖吻鱸馬魚1004340444137383935魚10085817135413842鳡100836936403841鯪1006834413842東魴....

本文編號(hào)：3974680