為探究大海馬幼體在高溫和低溫脅迫條件下基因表達(dá)水平的變化規(guī)律,采用Illumina平臺的PE150測序功能對大海馬幼體肝臟進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組測序。對照組、高溫脅迫組和低溫脅迫組測序數(shù)據(jù)組裝后獲得22 513個(gè)單基因簇(Unigene),N50為2 223 bp,平均長度為1 122.71 bp。與對照組相比,高溫脅迫組共獲得14 009個(gè)差異表達(dá)基因,其中5 543個(gè)差異表達(dá)基因上調(diào),8 466個(gè)差異表達(dá)基因下調(diào);低溫脅迫組共獲得20 030個(gè)差異基因,14 016個(gè)差異表達(dá)基因上調(diào),6 014個(gè)差異表達(dá)基因下調(diào)。差異表達(dá)基因經(jīng)KEGG數(shù)據(jù)庫富集發(fā)現(xiàn),高/低溫脅迫均導(dǎo)致大海馬體內(nèi)抗氧化途徑相關(guān)基因表達(dá)(HSP70、HSP90、SOD等)發(fā)生顯著改變;另外,高溫脅迫還造成大海馬免疫系統(tǒng)相關(guān)基因(PIK3R、Akt、IL-10、TLR等)以及細(xì)胞凋亡相關(guān)基因(CYCS、CASP9、CASP3等)表達(dá)顯著改變;低溫脅迫造成DNA損傷修復(fù)(MSH、DDB2、XRCC2、RAD52、Ogg1、PMS2等)、脂肪酸代謝(StARD7、ApoA4、CYP51、Fadsd6等)和細(xì)胞凋亡(P21、P53、B...

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【部分圖文】：

圖6低溫脅迫組RT-qPCR及RNA-Seq的比較分析

圖5高溫脅迫組RT-qPCR及RNA-Seq的比較分析3討論

圖1GO統(tǒng)計(jì)柱狀圖

由圖3可知,H-testvsCK獲得14009個(gè)差異表達(dá)基因,其中顯著上調(diào)5543個(gè),顯著下調(diào)8466個(gè);L-testvsCK獲得20030個(gè)差異表達(dá)基因(14016個(gè)差異基因顯著上調(diào),6014個(gè)差異表達(dá)基因顯著下調(diào))。高溫脅迫組上調(diào)基因數(shù)量低于下調(diào)基因,而低....

圖2KOG功能分類統(tǒng)計(jì)圖

表4各個(gè)數(shù)據(jù)庫的注釋匯總表Table4Summaryofcommentsineachdatabase數(shù)據(jù)庫Database單基因簇?cái)?shù)量Numberofunigenes百分比Percentage/%非冗余蛋白數(shù)據(jù)庫Nr2267153.64核酸序列....

圖3大海馬肝臟轉(zhuǎn)錄組中差異表達(dá)基因個(gè)數(shù)統(tǒng)計(jì)圖

圖2KOG功能分類統(tǒng)計(jì)圖圖4大海馬肝臟轉(zhuǎn)錄組中差異基因韋恩圖

本文編號：3940746