四種殼色馬氏珠母貝群體遺傳多樣性分析和分子標記研究
發(fā)布時間:2024-03-23 21:53
馬氏珠母貝(Pinctada martensii Dunker)又稱合浦珠母貝,是我國生產(chǎn)海水珍珠的重要經(jīng)濟貝類之一,既可作肉貝又可用于生產(chǎn)海水珍珠,生產(chǎn)的南海珍珠享譽世界。而近年來,由于環(huán)境條件惡化及不科學的養(yǎng)殖繁育方式等導致種質資源嚴重退化,珍珠產(chǎn)量及質量下降,企業(yè)經(jīng)濟受損嚴重,因此迫切需要對馬氏珠母貝進行遺傳多樣性分析,優(yōu)化選育、遺傳改良、分子標記選育及保護其種質資源等方面的研究。本研究采用EST-SSR微衛(wèi)星標記技術、相關序列擴增多態(tài)性標記技術(SRAP-c DNA)、單核苷酸多態(tài)性標記(SNP)技術等分析了四種殼色馬氏珠母貝群體的遺傳多樣性、篩選出殼色相關分子標記和殼色相關基因酪氨酸酶基因的SNP位點及在四種殼色群體中的表達量差異。旨在為經(jīng)過8代的群體繼代選育獲得的四種殼色馬氏珠母貝群體的種質鑒定和殼色選育提供分子理論依據(jù)。主要研究結果如下:1、本研究采用10對微衛(wèi)星引物,對四種殼色馬氏珠母貝群體的遺傳多樣性和群體結構進行了研究,結果顯示:(1)10個位點共檢測到45個等位基因,各位點平均等位基因數(shù)4.5個,四種殼色馬氏珠母貝群體的平均等位基因(Na)為3.54
【文章頁數(shù)】:97 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 文獻綜述
1.1 馬氏珠母貝的研究進展
1.1.1 馬氏珠母貝簡介
1.1.2 馬氏珠母貝的遺傳育種
1.2 微衛(wèi)星分子標記的功能特征和應用
1.2.1 微衛(wèi)星分子標記發(fā)展歷程
1.2.2 微衛(wèi)星在遺傳育種領域的應用
1.3 SRAP分子標記的功能特征和應用
1.3.1 SRAP分子標記的概念及原理
1.3.2 SRAP分子標記的應用
1.4 SNP分子標記的功能特征和應用
1.4.1 SNP分子標記及特點
1.4.2 SNP篩選檢測方法
1.5 酪氨酸酶基因
1.5.1 酪氨酸酶簡介
1.5.2 酪氨酸酶生理功能與活性中心結構
1.5.3 酪氨酸酶的應用及研究進展
1.6 研究內容及意義
2 四種殼色馬氏珠母貝EST-SSR遺傳多樣性分析
2.1 材料與方法
2.1.1 材料
2.1.2 實驗儀器與試劑
2.1.3 實驗方法
2.1.4 數(shù)據(jù)處理與分析
2.2 實驗結果與分析
2.2.1 實驗結果
2.2.2 數(shù)據(jù)結果分析
2.3 討論
2.3.1 四種殼色馬氏珠母貝群體內遺傳多樣性分析
2.3.2 四種殼色馬氏珠母貝群體哈迪溫伯格平衡
2.3.3 四種殼色馬氏珠母貝群體間的遺傳分化
3 四種殼色馬氏珠母貝外套膜基因的SRAP-cDNA差異分析
3.1 材料與方法
3.1.1 材料來源
3.1.2 實驗儀器與試劑
3.1.3 實驗方法
3.2 實驗結果與分析
3.2.1 外套膜組織RNA檢測結果
3.2.2 以cDNA的為模板SRAP-cDNA引物PCR擴增檢測結果
3.2.3 SRAP-cDNA引物篩選
3.2.4 SRAP-cDNA引物驗證
3.2.5 瓊脂糖膠回收
3.2.6 克隆測序結果
3.3 討論
3.3.1 四種殼色馬氏珠母貝群體的SRAP-cDNA表達差異
3.3.2 差異條帶的同源性序列
3.3.3 四種殼色馬氏珠母貝群體的鑒定標記
4 馬氏珠母貝酪氨酸酶基因SNP位點篩選和表達量分析
4.1 材料與方法
4.1.1 實驗材料
4.1.2 主要實驗儀器和試劑
4.1.3 實驗方法
4.1.4 數(shù)據(jù)處理
4.2 實驗結果與分析
4.2.1 酪氨酸酶基因PCR擴增產(chǎn)物瓊脂糖檢測
4.2.2 熒光定量PCR擴增產(chǎn)物
4.2.3 酪氨酸酶基因擴增序列和峰值圖
4.2.4 測序分析
4.2.5 SNP位點基因型分析
4.2.6 SNP位點等位基因頻率分析
4.2.7 多重比較及關聯(lián)性分析
4.2.8 SNP位點多態(tài)性分析
4.2.9 四種殼色馬氏珠母貝群體酪氨酸酶基因相對表達量
4.3 討論
4.3.1 四種殼色馬氏珠母貝群體總體的SNP位點差異分析
4.3.2 四種殼色馬氏珠母貝群體間的SNP位點差異分析
4.3.3 不同殼色馬氏珠母貝群體總體SNP位點基因型分布規(guī)律討論
4.3.4 SNP位點多態(tài)性分析
4.3.5 酪氨酸酶基因表達量分析
5 結論
論文的創(chuàng)新點
有待解決的問題
參考文獻
致謝
作者簡介
導師簡介
本文編號:3936518
【文章頁數(shù)】:97 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 文獻綜述
1.1 馬氏珠母貝的研究進展
1.1.1 馬氏珠母貝簡介
1.1.2 馬氏珠母貝的遺傳育種
1.2 微衛(wèi)星分子標記的功能特征和應用
1.2.1 微衛(wèi)星分子標記發(fā)展歷程
1.2.2 微衛(wèi)星在遺傳育種領域的應用
1.3 SRAP分子標記的功能特征和應用
1.3.1 SRAP分子標記的概念及原理
1.3.2 SRAP分子標記的應用
1.4 SNP分子標記的功能特征和應用
1.4.1 SNP分子標記及特點
1.4.2 SNP篩選檢測方法
1.5 酪氨酸酶基因
1.5.1 酪氨酸酶簡介
1.5.2 酪氨酸酶生理功能與活性中心結構
1.5.3 酪氨酸酶的應用及研究進展
1.6 研究內容及意義
2 四種殼色馬氏珠母貝EST-SSR遺傳多樣性分析
2.1 材料與方法
2.1.1 材料
2.1.2 實驗儀器與試劑
2.1.3 實驗方法
2.1.4 數(shù)據(jù)處理與分析
2.2 實驗結果與分析
2.2.1 實驗結果
2.2.2 數(shù)據(jù)結果分析
2.3 討論
2.3.1 四種殼色馬氏珠母貝群體內遺傳多樣性分析
2.3.2 四種殼色馬氏珠母貝群體哈迪溫伯格平衡
2.3.3 四種殼色馬氏珠母貝群體間的遺傳分化
3 四種殼色馬氏珠母貝外套膜基因的SRAP-cDNA差異分析
3.1 材料與方法
3.1.1 材料來源
3.1.2 實驗儀器與試劑
3.1.3 實驗方法
3.2 實驗結果與分析
3.2.1 外套膜組織RNA檢測結果
3.2.2 以cDNA的為模板SRAP-cDNA引物PCR擴增檢測結果
3.2.3 SRAP-cDNA引物篩選
3.2.4 SRAP-cDNA引物驗證
3.2.5 瓊脂糖膠回收
3.2.6 克隆測序結果
3.3 討論
3.3.1 四種殼色馬氏珠母貝群體的SRAP-cDNA表達差異
3.3.2 差異條帶的同源性序列
3.3.3 四種殼色馬氏珠母貝群體的鑒定標記
4 馬氏珠母貝酪氨酸酶基因SNP位點篩選和表達量分析
4.1 材料與方法
4.1.1 實驗材料
4.1.2 主要實驗儀器和試劑
4.1.3 實驗方法
4.1.4 數(shù)據(jù)處理
4.2 實驗結果與分析
4.2.1 酪氨酸酶基因PCR擴增產(chǎn)物瓊脂糖檢測
4.2.2 熒光定量PCR擴增產(chǎn)物
4.2.3 酪氨酸酶基因擴增序列和峰值圖
4.2.4 測序分析
4.2.5 SNP位點基因型分析
4.2.6 SNP位點等位基因頻率分析
4.2.7 多重比較及關聯(lián)性分析
4.2.8 SNP位點多態(tài)性分析
4.2.9 四種殼色馬氏珠母貝群體酪氨酸酶基因相對表達量
4.3 討論
4.3.1 四種殼色馬氏珠母貝群體總體的SNP位點差異分析
4.3.2 四種殼色馬氏珠母貝群體間的SNP位點差異分析
4.3.3 不同殼色馬氏珠母貝群體總體SNP位點基因型分布規(guī)律討論
4.3.4 SNP位點多態(tài)性分析
4.3.5 酪氨酸酶基因表達量分析
5 結論
論文的創(chuàng)新點
有待解決的問題
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致謝
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本文編號:3936518
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