大菱鲆生長性狀相關SNP位點的篩選鑒定及生物信息學分析
發(fā)布時間:2024-03-08 21:49
大菱鲆(Scophthalmus maximus L.)是原產于歐洲沿海的一種名貴的比目魚。自我國1992年從英國引進以來,因其生長速度快、肉質鮮美、易馴化以及抗逆性強等特點,迅速成為北方海水養(yǎng)殖的主要經濟魚類。然而,近幾年,隨著工廠化養(yǎng)殖水平的不斷提高,大菱鲆養(yǎng)殖產業(yè)出現一些問題。由于大菱鲆育種工作主要依賴國外引進親本,親本資源有限,加上累代養(yǎng)殖以及近親交配,使得大菱鲆種質資源退化嚴重,嚴重制約了大菱鲆養(yǎng)殖業(yè)的可持續(xù)發(fā)展。因此對大菱鲆進行遺傳改良,選育具有優(yōu)良生長性狀的大菱鲆新品種是發(fā)展大菱鲆養(yǎng)殖業(yè)的當務之急。隨著生物技術的不斷創(chuàng)新與進步,分子標記技術被運用到育種工作中來,利用傳統育種加上分子標記輔助育種的模式已經成為魚類育種的有效手段。單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)是微衛(wèi)星標記之后的第三代的分子標記技術。SNP標記在基因組中密度高,遺傳穩(wěn)定性好并且易于自動化分析,因此被廣泛地應用于動植物的遺傳育種中。本研究以實驗室前期利用數量性狀位點(QTL)定位作圖篩選獲得的100個與大菱鲆生長性狀相關的候選單核苷酸多態(tài)(SNP)位點為基礎...
【文章頁數】:73 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
本文編號:3922433
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圖2-1基因組DNA瓊脂糖凝膠電泳檢測圖
3.1基因組DNA質量及濃度檢測提取的大菱鲆鰭條組織的基因組DNA用1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測,部分樣品的電泳檢測結果見圖2-1。圖中可見基因組DNA條帶明亮且無明顯的拖帶現象,完整性較好,符合SNP位點分型的條件。利用超微量紫外光分光光度計檢測樣品DNA的濃度和....
圖2-2SNP位點變異類型統計圖
圖2-2SNP位點變異類型統計圖Figure2-2DistributionofSNPvariationsSNP位點與生長性狀關聯分析大菱鲆四個家系生長性狀(體重和體長)數據見表2-2。利用一般線性模型LM)對SNP位點的基因型和生長性狀進行關聯分析,結果見....
圖4-1大菱鲆各組織總RNA電泳圖
圖4-1大菱鲆各組織總RNA電泳圖Figure4-1ElectrophorctogramoftotalRNAoftissueinturbot3.2大菱鲆NOTCH1基因cDNA片段克隆取大菱鲆心臟組織的RNA,反轉錄成cDNA,以此為模板,....
圖4-2大菱鲆NOTCH1基因序列比對結果
39圖4-2大菱鲆NOTCH1基因序列比對結果Figure4-2SequencealignmentresultsofNOTCH1geneinturbot表4-3大菱鲆NOTCH1基因序列在NCBI數據庫同源比對結果Table4-3Homo....
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