【目的】揭示群體感應淬滅作用與宿主腸道菌群結構間的作用關系,為具有群體感應淬滅作用益生菌及其淬滅酶在水產養(yǎng)殖上的推廣應用提供理論依據�！痉椒ā窟x取30尾規(guī)格為25±1 g/尾的草魚隨機分為對照組和試驗組,試驗組每尾草魚腹腔注射100μL溶解稀釋后的YtnP(25μg/mL),對照組每尾草魚腹腔注射等量的300 mmol/L分子篩緩沖液,分別在注射后24和48 h采集草魚前腸、中腸和后腸的腸道組織及內容物,提取各腸段總DNA及PCR擴增16S rRNA序列V3～V4可變區(qū),然后基于Illumina MiSeq高通量測序技術分析外源添加YtnP對草魚腸道菌群多樣性與豐度的影響。【結果】12份草魚腸道樣品測序共獲得原始序列(Raw reads)660205條,有效序列(Valid reads)416614條;對照組和試驗組樣品的OTU數目分別為142±102和143±67個。在門分類水平上,對照組和試驗組草魚腸道優(yōu)勢菌群均為放線菌門(Actinobacteria)、梭桿菌門(Fusobacteria)、變形菌門(Proteobacteria)和厚壁菌門(Firmicutes);相對于對照組,...

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【文章目錄】：
0 引言
1 材料與方法
    1.1 試驗材料
    1.2 試驗設計
    1.3 腸道樣品采集
    1.4 腸道菌群分析方法及步驟
        1.4.1 樣品基因組DNA提取及PCR擴增
        1.4.2 上機測序與數據統(tǒng)計
        1.4.3 數據分析
2 結果與分析
    2.1 草魚腸道微生物多樣性
    2.2 草魚腸道菌群結構及其相對豐度
    2.3 草魚腸道菌群結構Alpha多樣性分析結果
    2.4 草魚腸道菌群結構Beta多樣性分析結果
3 討論
4 結論



本文編號：3863058