鯉魚鱗被發(fā)育相關(guān)基因EDA、EDAR克隆及表達(dá)定位初步研究
發(fā)布時間:2023-10-19 17:23
作為最重要的鯉科魚類,鯉魚是世界上養(yǎng)殖范圍最廣的淡水魚類之一。鏡鯉和普通鯉魚是鯉魚中常見的兩個品種。在魚類的養(yǎng)殖過程中,鱗被的特征是比較容易發(fā)現(xiàn)的。目前,對鱗被的研究很少,尤其在鯉魚方面。長期的研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),鏡鯉在肉質(zhì)、生長速度等方面都顯著優(yōu)于建鯉,而二者最明顯的性狀在于皮膚表面覆蓋的鱗被,而且鱗被在魚類的抗病性研究中具有不可忽視的作用,并且有研究表明魚類的鱗被與哺乳動物皮膚表面附屬物,如毛發(fā)、汗腺甚至牙齒等有共同的進(jìn)化祖先,因此從鯉魚的鱗被入手。通過差異篩選出鱗被發(fā)育相關(guān)因子,本研究選取其中兩個基因,進(jìn)行克隆測序和功能分析,為應(yīng)用基因工程技術(shù)提高魚類尤其是哺乳動物毛發(fā)、汗腺等的研究,提供了更加豐富的優(yōu)良候選基因。 Ectodysplasin-A(EDA)基因最早是在哺乳動物中發(fā)現(xiàn)的,其在皮膚附屬物的發(fā)育中具有重要的生物學(xué)功能。利用Genfishing差異篩選技術(shù)對普通鯉魚和德國鏡鯉的皮膚轉(zhuǎn)錄表達(dá)產(chǎn)物進(jìn)行了篩選,得到EDA基因的部分片段。然后我們利用實(shí)驗(yàn)室的鯉魚EST數(shù)據(jù)庫設(shè)計包含CDS全長的特異引物。克隆測序后發(fā)現(xiàn),鏡鯉EDA基因全長CDS包含1062個堿基,編碼一個含有354個氨基...
【文章頁數(shù)】:56 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 引言
1 .1 魚類的鱗
1.1 .1 鱗的分類
1.1.2 魚鱗的發(fā)育模式
1.2 鱗被發(fā)育過程研究進(jìn)展
1.2.1 鱗被發(fā)育研究的科學(xué)問題
1.2.2 鱗被發(fā)育的未來趨勢
1.3 鯉魚天然存在鱗被突變且穩(wěn)定遺傳的種群
1.3.1 突變體遺傳學(xué)方法解析鱗被發(fā)育過程
1.3.2 鯉魚中的天然突變體-鏡鯉
1.4 候選基因的研究進(jìn)展
1.4.1 基因 EDA 的研究進(jìn)展
1.4.2 基因 EDAR 的研究進(jìn)展
第二章 材料與方法
2.1 實(shí)驗(yàn)用魚的獲得及喂養(yǎng)管理
2.2 主要的儀器設(shè)備和試劑及其試劑盒
2.2.1 主要的儀器設(shè)備
2.2.2 主要試劑的配制和試劑盒的訂購
2.3 實(shí)驗(yàn)方法
2.3.1 鏡鯉各組織 RNA 的提取并反轉(zhuǎn)錄
2.3.2 基因的克隆分析
第三章 :結(jié)果
3.1 基因在鏡鯉各個組織中的表達(dá)
3.2 基因 5,-UTR 和 3,-UTR 的克隆
3.2.1 EDA 基因 5,端 UTR 區(qū)的克隆
3.2.2 EDAR 基因 5,端 UTR 區(qū)的克隆
3.2.3 EDAR 基因 3,端 UTR 區(qū)的克隆
3.3 多物種 CDS 序列比對
3.3.1 EDA 基因 CDS 的多物種比對
3.3.2 EDAR 基因 CDS 的多物種比對
3.4 構(gòu)建進(jìn)化樹
3.4.1 EDA 基因的氨基酸序列與其他物種構(gòu)建進(jìn)化樹
3.4.2 EDAR 基因的氨基酸序列與其他物種構(gòu)建進(jìn)化樹
3.5 基因在建鯉和鏡鯉皮膚中的表達(dá)
3.5.1 EDA 基因在建鯉和鏡鯉皮膚中的表達(dá)
3.5.2 EDAR 基因在建鯉和鏡鯉皮膚中的表達(dá)
第四章 討論和結(jié)論
4.1 討論
4.1.1 EDA 基因的分析
4.1.2 EDAR 基因的分析
4.2 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
碩士期間發(fā)表論文
致謝
本文編號:3855132
【文章頁數(shù)】:56 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 引言
1 .1 魚類的鱗
1.1 .1 鱗的分類
1.1.2 魚鱗的發(fā)育模式
1.2 鱗被發(fā)育過程研究進(jìn)展
1.2.1 鱗被發(fā)育研究的科學(xué)問題
1.2.2 鱗被發(fā)育的未來趨勢
1.3 鯉魚天然存在鱗被突變且穩(wěn)定遺傳的種群
1.3.1 突變體遺傳學(xué)方法解析鱗被發(fā)育過程
1.3.2 鯉魚中的天然突變體-鏡鯉
1.4 候選基因的研究進(jìn)展
1.4.1 基因 EDA 的研究進(jìn)展
1.4.2 基因 EDAR 的研究進(jìn)展
第二章 材料與方法
2.1 實(shí)驗(yàn)用魚的獲得及喂養(yǎng)管理
2.2 主要的儀器設(shè)備和試劑及其試劑盒
2.2.1 主要的儀器設(shè)備
2.2.2 主要試劑的配制和試劑盒的訂購
2.3 實(shí)驗(yàn)方法
2.3.1 鏡鯉各組織 RNA 的提取并反轉(zhuǎn)錄
2.3.2 基因的克隆分析
第三章 :結(jié)果
3.1 基因在鏡鯉各個組織中的表達(dá)
3.2 基因 5,-UTR 和 3,-UTR 的克隆
3.2.1 EDA 基因 5,端 UTR 區(qū)的克隆
3.2.2 EDAR 基因 5,端 UTR 區(qū)的克隆
3.2.3 EDAR 基因 3,端 UTR 區(qū)的克隆
3.3 多物種 CDS 序列比對
3.3.1 EDA 基因 CDS 的多物種比對
3.3.2 EDAR 基因 CDS 的多物種比對
3.4 構(gòu)建進(jìn)化樹
3.4.1 EDA 基因的氨基酸序列與其他物種構(gòu)建進(jìn)化樹
3.4.2 EDAR 基因的氨基酸序列與其他物種構(gòu)建進(jìn)化樹
3.5 基因在建鯉和鏡鯉皮膚中的表達(dá)
3.5.1 EDA 基因在建鯉和鏡鯉皮膚中的表達(dá)
3.5.2 EDAR 基因在建鯉和鏡鯉皮膚中的表達(dá)
第四章 討論和結(jié)論
4.1 討論
4.1.1 EDA 基因的分析
4.1.2 EDAR 基因的分析
4.2 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
碩士期間發(fā)表論文
致謝
本文編號:3855132
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