文昌魚(Branchiostoma)是研究脊椎動(dòng)物起源和進(jìn)化的模式動(dòng)物,具有極高的科研價(jià)值。此外,文昌魚還具有很高的營(yíng)養(yǎng)價(jià)值。廈門劉五店曾因是世界上唯一的文昌魚漁場(chǎng)而馳名中外,但由于生境破壞和過度捕撈等原因,文昌魚資源量急劇下降,已被列為國(guó)家二級(jí)保護(hù)動(dòng)物。本研究運(yùn)用微衛(wèi)星分子標(biāo)記、AFLP分子標(biāo)記技術(shù)及線粒體DNA COI基因標(biāo)記技術(shù)對(duì)瀕危物種文昌魚的青島、廈門和北海三個(gè)群體的遺傳多樣性和遺傳分化進(jìn)行了研究,以期提供文昌魚相關(guān)遺傳背景知識(shí),進(jìn)一步完善文昌魚保護(hù)遺傳學(xué)方面的研究,為文昌魚保護(hù)策略的制定提供理論依據(jù)。(1)采用FIASCO法,利用生物素標(biāo)記的(GT)₁₅、(CT)₁₅混合寡核苷酸探針從文昌魚的基因組DNA的MboI酶切片段中篩選出微衛(wèi)星序列,最終獲得了12個(gè)具有多態(tài)性的微衛(wèi)星位點(diǎn)。其中每個(gè)位點(diǎn)的等位基因數(shù)(N_a)為3-7個(gè),多態(tài)信息含量(PIC)為0.309-0.778,觀察雜合度(H_o)為0.1786-0.8571,期望雜合度(H_e)為0.2449-0.7825。...

【文章頁數(shù)】：122 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
abstract
第1章 引言
    1.1 文昌魚生物學(xué)特征及我國(guó)文昌魚研究概況
        1.1.1 文昌魚的生物學(xué)特征
        1.1.2 我國(guó)文昌魚的研究概況
    1.2 群體遺傳學(xué)方法及其在文昌魚中的應(yīng)用
        1.2.1 等位酶技術(shù)
        1.2.2 RAPD技術(shù)
        1.2.3 AFLP技術(shù)
        1.2.4 微衛(wèi)星標(biāo)記技術(shù)
        1.2.5 線粒體DNA標(biāo)記技術(shù)
    1.3 三種海參生物學(xué)特征與研究概況
        1.3.1 玉足海參生物學(xué)特征
        1.3.2 玉足海參研究概況
        1.3.3 糙海參生物學(xué)特征
        1.3.4 糙海參研究概況
        1.3.5 糙刺參生物學(xué)特征
        1.3.6 糙刺參研究概況
    1.4 本研究的目的意義與方案
        1.4.1 文昌魚群體遺傳學(xué)研究的目的意義與方案
        1.4.2 三種海參微衛(wèi)星開發(fā)研究的目的意義與方案
第2章 文昌魚微衛(wèi)星標(biāo)記篩選
    2.1 材料與方法
        2.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        2.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器與試劑
        2.1.3 實(shí)驗(yàn)方法
    2.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        2.2.1 基因組DNA提取結(jié)果
        2.2.2 基因組酶切結(jié)果
        2.2.3 目的片段PCR結(jié)果
        2.2.4 陽性克隆檢測(cè)結(jié)果
        2.2.5 測(cè)序結(jié)果及引物設(shè)計(jì)
        2.2.6 微衛(wèi)星多態(tài)性檢測(cè)
    2.3 討論
第3章 基于微衛(wèi)星標(biāo)記技術(shù)的文昌魚群體遺傳學(xué)研究
    3.1 實(shí)驗(yàn)材料與方法
        3.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        3.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器及試劑
        3.1.3 實(shí)驗(yàn)方法
    3.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        3.2.1 文昌魚微衛(wèi)星的擴(kuò)增
        3.2.2 文昌魚群體的雜合性
        3.2.3 文昌魚群體的遺傳多樣性
        3.2.4 文昌魚群體間的遺傳分化
    3.3 討論
        3.3.1 文昌魚群體雜合性分析
        3.3.2 文昌魚群體遺傳多樣性分析
        3.3.3 文昌魚群體的遺傳分化分析
第4章 基于AFLP技術(shù)的文昌魚群體遺傳學(xué)研究
    4.1 材料與方法
        4.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        4.1.2 主要儀器與試劑
        4.1.3 實(shí)驗(yàn)方法
    4.2 結(jié)果與分析
        4.2.1 文昌魚基因DNA提取結(jié)果
        4.2.2 基因組DNA酶切結(jié)果
        4.2.3 文昌魚AFLP的擴(kuò)增結(jié)果
        4.2.4 文昌魚群體多樣性
        4.2.5 文昌魚群體的遺傳分化
    4.3 討論
        4.3.1 文昌魚群體遺傳多樣性
        4.3.2 文昌魚群體遺傳分化研究
第5章 文昌魚群體線粒體COI基因序列比較研究
    5.1 材料與方法
        5.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        5.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器與試劑
        5.1.3 實(shí)驗(yàn)方法
    5.2 結(jié)果
        5.2.1 擴(kuò)增產(chǎn)物與序列測(cè)定
        5.2.2 序列特征及群體遺傳多樣性
        5.2.3 文昌魚群體間的遺傳變異
        5.2.4 分子中性進(jìn)化檢驗(yàn)
    5.3 討論
        5.3.1 序列特征及群體遺傳多樣性分析
        5.3.2 文昌魚群體間的遺傳變異分析
        5.3.3 分子中性進(jìn)化分析
        5.3.4 3個(gè)群體文昌魚與其它文昌魚系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系
第6章 三種海參微衛(wèi)星開發(fā)的研究
    6.1 材料與方法
        6.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        6.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器與試劑
        6.1.3 實(shí)驗(yàn)方法
    6.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        6.2.1 基因組DNA提取結(jié)果
        6.2.2 基因組DNA酶切結(jié)果
        6.2.3 目的片段PCR擴(kuò)增結(jié)果
        6.2.4 陽性克隆檢測(cè)結(jié)果
        6.2.5 測(cè)序結(jié)果及引物設(shè)計(jì)
        6.2.6 微衛(wèi)星多態(tài)性檢測(cè)結(jié)果
    6.3 討論
第7章 結(jié)論與展望
    7.1 文昌魚遺傳學(xué)研究結(jié)論與展望
    7.2 三種海參微衛(wèi)星位點(diǎn)的開發(fā)研究結(jié)論與展望
致謝
參考文獻(xiàn)
在校期間發(fā)表的論文
在校期間即將發(fā)表的論文



本文編號(hào)：3806980