石磺科貝類屬于軟體動物門,肺螺亞綱,縮眼目,石磺超科。在我國主要有5屬6種,目前研究比較多的主要有4種:紫色疣石磺(Peronia verruculata)、里氏擬石磺(Paraoncidium reevesii)、瘤背石磺(Onchidium struma)和平疣桑椹石磺(Platevindex mortoni)。石磺科貝類的幼蟲生活在水中,成體的生活區(qū)域分別從淺海到潮間帶直到潮上帶,呈現(xiàn)出從海洋向陸地擴展的梯度分布狀態(tài),其成體的呼吸方式,肌肉組成,角質(zhì)層形成等的適應性變化逐漸呈現(xiàn)出與兩棲類相似的生活習性,可作為研究海洋無脊椎動物向陸地進化的良好材料。開發(fā)SSR和SNP分子標記將為研究石磺科貝類的進化關(guān)系以及種質(zhì)資源保護提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。本文通過Illumina HiseqTM 2000高通量轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)分別對里氏擬石磺(P.reevesii)和平疣桑椹石磺(P.mortoni)的微衛(wèi)星分子標記進行開發(fā),對兩棲特性明顯的瘤背石磺(O.struma)進行了兩棲性狀特征通路相關(guān)基因的SNP分子標記開發(fā),具體方案和結(jié)果如下:1,基于Illumina HiseqTM 2000高通量轉(zhuǎn)錄組測序的...

【文章頁數(shù)】：65 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
引言
第一章 文獻綜述
    1 石磺科貝類研究進展
        1.1 石磺科貝類簡介
        1.2 石磺科貝類的研究現(xiàn)狀
    2 微衛(wèi)星分子標記開發(fā)與應用
        2.1 微衛(wèi)星標記簡介
        2.2 微衛(wèi)星篩選方法
    3 SNP標記的研究進展
        3.1 SNP標記簡介
        3.2 SNP篩選分型方法
        3.3 SNP分子標記在群體進化研究中的應用
    4 本研究的目的和意義
第二章 里氏擬石磺SSR分子標記的開發(fā)
    1 材料與方法
        1.1 實驗材料
        1.2 實驗儀器及試劑
            1.2.1 實驗儀器
            1.2.2 實驗試劑
        1.3 實驗方法
            1.3.1 微衛(wèi)星序列的來源及篩選
            1.3.2 EST-SSR位點的引物設計
            1.3.3 DNA的提取與檢測
            1.3.4 SSR引物的初步篩選
            1.3.5 PCR擴增
            1.3.6 產(chǎn)物檢測
            1.3.7 數(shù)據(jù)統(tǒng)計與分析
    2 結(jié)果與分析
        2.1 里氏擬石磺轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果
        2.2 EST—SSR的類型和頻率統(tǒng)計
        2.3 引物篩選結(jié)果統(tǒng)計
        2.4 里氏擬石磺湛江群體遺傳多樣性分析
    3 討論
第三章 平疣桑椹石磺SSR分子標記的開發(fā)
    1 材料與方法
        1.1 實驗材料
        1.2 實驗儀器及試劑
        1.3 實驗方法
    2 結(jié)果與分析
        2.1 平疣桑椹石磺轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果
        2.2 EST—SSR的類型和頻率統(tǒng)計
        2.3 引物篩選結(jié)果統(tǒng)計
        2.4 平疣桑椹石磺湛江群體遺傳多樣性分析
    3 討論
第四章 瘤背石磺SNP分子標記的開發(fā)
    1 材料及方法
        1.1 樣品采集
        1.2 實驗材料
        1.3 實驗方法
    2 實驗結(jié)果及分析
        2.1 測序及分析結(jié)果
        2.2 引物篩選結(jié)果
        2.3 SNP位點多態(tài)性統(tǒng)計分析
        2.4 SNP位點基因功能預測
    3 討論
小結(jié)
參考文獻
附錄
致謝



本文編號：3777474