發(fā)布時間：2023-03-04 19:45

　　長牡蠣(Crassostrea gigas),又稱太平洋牡蠣,分類學隸屬于軟體動物門(Mollusca)、瓣鰓綱(Lanellibranchia)、珍珠目(Pterioida)、牡蠣科(Ostreidae)、巨蠣屬(Crassostrea),是一種廣溫、廣鹽的重要海水經(jīng)濟雙殼貝類,其作為潮間帶這一特殊環(huán)境的典型物種,被當做海洋生物對潮間帶環(huán)境適應性研究的模式生物。由于其獨特的生態(tài)價值和經(jīng)濟價值被廣泛養(yǎng)殖,是世界上最重要的海水養(yǎng)殖物種。我國山東省是長牡蠣的主養(yǎng)區(qū)之一,但是在最近幾年,經(jīng)常有報道長牡蠣存在大規(guī)模死亡的現(xiàn)象,尤其在夏季海水溫度升高時死亡率達到最高,這在一定程度上困擾著長牡蠣產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。有初步研究表明,導致大規(guī)模死亡這一現(xiàn)象發(fā)生可能主要是由于高溫脅迫、個體生理狀態(tài)以及病原微生物所導致,但是并沒有整體系統(tǒng)的研究。針對這一問題,本研究對長牡蠣的夏季大規(guī)模死亡展開了系統(tǒng)的環(huán)境及生物學調(diào)查,并且通過轉錄組獲取脅迫響應的基因集,對其分子機制進行初步研究,結果如下:1.本研究對乳山長牡蠣養(yǎng)殖區(qū)高溫季節(jié)水文條件(溫度、溶解氧、p H值、鹽度)指標進行了較為詳細的檢測,統(tǒng)計了對應各時間點養(yǎng)殖水...

【文章頁數(shù)】：91 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻綜述
    1.1 牡蠣養(yǎng)殖現(xiàn)狀
    1.2 長牡蠣度夏死亡問題的相關研究
        1.2.1 長牡蠣度夏死亡問題概述
        1.2.2 長牡蠣高溫脅迫研究現(xiàn)狀
        1.2.3 長牡蠣病原體脅迫研究現(xiàn)狀
    1.3 轉錄組及雙殼貝類轉錄組研究進展
    1.4 本研究目的及意義
        1.4.1 本研究目的
        1.4.2 本研究意義
第二章 長牡蠣養(yǎng)殖環(huán)境以及抗性相關基因的季節(jié)性差異
    2.1 引言
    2.2 材料與方法
        2.2.1 主要儀器和試劑
        2.2.2 長牡蠣樣品來源及環(huán)境數(shù)據(jù)監(jiān)測
        2.2.3 RNA提取和樣品混合
        2.2.4 RNA反轉錄
        2.2.5 實驗用基因及引物信息
        2.2.6 實時熒光定量PCR(qRT-PCR)
        2.2.7 長牡蠣生存地點環(huán)境參數(shù)的統(tǒng)計及樣品肥滿度的差異
    2.3 結果與分析
        2.3.1 RNA提取結果
        2.3.2 目的基因在各月的表達結果
        2.3.3 環(huán)境參數(shù)檢測結果
        2.3.4 各取樣點藻類分析
        2.3.5 不同取樣點長牡蠣在各月份的表型數(shù)據(jù)
    2.4 討論
        2.4.1 西黃島水環(huán)境指標
        2.4.2 抗性基因的表達
    2.5 小結
第三章 長牡蠣產(chǎn)卵前后的表型差異
    3.1 引言
    3.2 材料與方法
        3.2.1 樣品采集與處理
        3.2.2 人工催熟獲得產(chǎn)卵后群體
        3.2.3 群體數(shù)據(jù)測定
        3.2.4 糖原含量測定
        3.2.5 條件指數(shù)測定
        3.2.6 呼吸率測定
    3.3 結果與分析
        3.3.1 長牡蠣群體數(shù)據(jù)結果
        3.3.2 糖原含量
        3.3.3 條件指數(shù)
        3.3.4 呼吸率
    3.4 討論
        3.4.1 表觀測量
        3.4.2 生理指標分析
    3.5 小結
第四章 長牡蠣產(chǎn)卵前后熱激脅迫下的轉錄組分析
    4.1 引言
    4.2 材料與方法
        4.2.1 樣品處理
        4.2.2 總RNA提取
        4.2.5 轉錄組文庫的制備
        4.2.6 測序數(shù)據(jù)的獲得與過濾
        4.2.7 測序結果與參考基因組序列比對
        4.2.8 差異基因的獲取及相關分析
    4.3 結果與分析
        4.3.1 總RNA提取
        4.3.2 RNA-Seq測序結果
        4.3.3 差異表達基因篩選結果
        4.3.4 轉錄組基本統(tǒng)計分析
    4.4 討論
        4.4.1 差異基因篩選
        4.4.2 富集分析
    4.5 小結
第五章 長牡蠣產(chǎn)卵前后溶藻弧菌感染后的轉錄組分析
    5.1 引言
    5.2 材料與方法
        5.2.1 長牡蠣開孔
        5.2.2 菌株的獲得以及濃度的確定
    5.3 結果與分析
        5.3.1 總RNA提取
        5.3.2 RNA-Seq測序結果
        5.3.3 差異表達基因篩選結果
        5.3.4 轉錄組基本統(tǒng)計分析
    5.4 討論
        5.4.1 差異基因篩選
        5.4.2 富集分析
    5.5 小結
第六章 總結
參考文獻
致謝
攻讀碩士學位期間發(fā)表論文情況



本文編號：3754888