大眼鱖（Siniperca kneri）,隸屬鱸形目（Perciformes）、鮨科（Serranidae）、鱖亞科（Sinipercinae）。大眼鱖是東亞地區(qū)特有的名貴魚類,具有很高的經(jīng)濟(jì)價值。但是,近年來,由于過度捕撈、人工放流、環(huán)境污染以及水壩的修建等因素的影響,野生大眼鱖的遺傳多樣性面臨下降的趨勢。本論文采用線粒體細(xì)胞色素（Cytochrome,Cytb）基因及控制區(qū)序列,對長江水系大眼鱖的4個群體（赤水河群體—CS、南京群體—NJ、岳陽群體—YC、宜昌群體—YY）共計79尾個體進(jìn)行分析,探討其遺傳多樣性、遺傳分化、以及種群演化歷史,從而為有效、合理開發(fā)利用大眼鱖資源提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)支撐。主要內(nèi)容如下:1.大眼鱖的遺傳多樣性研究:Cytb分析采用PCR擴(kuò)增、直接測序法,獲得4個大眼鱖群體共計79尾魚的Cytb基因全序列（長度為1141bp）,共檢測到26種單倍型。單倍型多樣性（Haplotype diversity,Hd）指數(shù)為 0.685（CS）-0.924（YY）,核昔酸多樣性（nucleotide diversity,TT）指數(shù)為0.00176（CS）-0.00285（YC... 

【文章頁數(shù)】：68 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1 大眼鱖的生物學(xué)特性
        1.1 形態(tài)特征
        1.2 生活習(xí)性
        1.3 繁殖習(xí)性
        1.4 感官、攝食、消化器官
    2 大眼鱖的人工養(yǎng)殖和經(jīng)濟(jì)價值
    3 魚類多樣性研究
        3.1 遺傳多樣性
        3.2 分子系統(tǒng)樹的構(gòu)建
    4 魚類線粒體DNA分子標(biāo)記
        4.1 魚類線粒體基因組的特點
        4.2 線粒體分子標(biāo)記在魚類遺傳學(xué)中的應(yīng)用
    5 研究現(xiàn)狀
    6 研究的目的和意義
第二章 大眼鱖的遺傳多樣性研究:CYTB分析
    1 材料與方法
        1.1 實驗試劑和儀器
        1.2 研究的樣本
        1.3 DNA的提取
        1.4 線粒體Cytb基因擴(kuò)增、純化和測序
        1.5 實驗數(shù)據(jù)的處理和分析
    2 實驗結(jié)果
        2.1 總DNA的提取
        2.2 Cytb基因序列特征
        2.3 Cytb遺傳多樣性分析
            2.3.1 單倍型分布
            2.3.2 遺傳多樣性指數(shù)
        2.4 Cytb的遺傳結(jié)構(gòu)分析
            2.4.1 遺傳距離
            2.4.2 系統(tǒng)進(jìn)化樹
            2.4.3 遺傳分化系數(shù)和基因流
        2.5 分子方差分析
        2.6 大眼鱖的種群歷史動態(tài)
            2.6.1 中性檢驗
            2.6.2 歧點分布
    3 討論
        3.1 大眼鱖的遺傳多樣性分析
        3.2 大眼鱖群體間的遺傳分化
        3.3 大眼鱖的種群歷史動態(tài)
第三章 大眼鱖的遺傳多樣性研究:D-LOOP分析
    1 材料與方法
        1.1 所需實驗材料
        1.2 所需實驗樣本
        1.3 DNA的提取
        1.4 線粒體Cytb基因擴(kuò)增、純化和測序
        1.5 實驗數(shù)據(jù)分析
    2 實驗結(jié)果
        2.1 總DNA的提取
        2.2 D-loop序列特征
        2.3 D-loop遺傳多樣性分析
            2.3.1 單倍型分布
            2.3.2 遺傳多樣性指數(shù)
        2.4 D-loop區(qū)的遺傳結(jié)構(gòu)分析
            2.4.1 遺傳距離
            2.4.2 系統(tǒng)進(jìn)化樹
            2.4.3 遺傳分化系數(shù)和基因流
        2.5 分子方差分析
        2.6 大眼鱖的種群歷史動態(tài)
            2.6.1 中性檢驗
            2.6.2 核苷酸不配對分布圖
    3 討論
        3.1 大眼鱖的遺傳多樣性分析
        3.2 大眼鱖群體間的遺傳分化
        3.3 大眼鱖的遺傳多樣性保護(hù)
全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀碩士學(xué)位期間參加的學(xué)術(shù)會議及發(fā)表的學(xué)術(shù)論文



本文編號：3658125