異育銀鯽可量性狀相關(guān)性以及MSTN基因的多態(tài)性與生長性狀的關(guān)聯(lián)分析
發(fā)布時(shí)間:2022-01-25 07:18
鯽魚是我國主要的淡水養(yǎng)殖經(jīng)濟(jì)魚類,其肉鮮質(zhì)嫩,營養(yǎng)全面,含蛋白質(zhì)豐富,具有很大的市場前景。目前自繁異育銀鯽和最新種“中科三號”是主要的養(yǎng)殖品系。本研究對兩種異育銀鯽進(jìn)行了生長對比實(shí)驗(yàn),分析并比較了兩種異育銀鯽的生長性能、營養(yǎng)價(jià)值,對各生長性狀與體質(zhì)量的相關(guān)性進(jìn)行了分析,并篩選了MMSTN基因的SNP標(biāo)記,旨在為異育銀鯽選育測量指標(biāo)提供理論依據(jù),以及為分子標(biāo)記輔助育種奠定基礎(chǔ)。具體研究內(nèi)容如下:1.對異育銀鯽(自繁)與異育銀鯽(中科三號)兩個品系鯽魚標(biāo)記時(shí)和收貨時(shí)體重、體長、體高、體寬等性狀以及絕對增重率AGRw、絕對增長率AGRBL、絕對增寬率AGRBW、絕對增高率AGRBH、空殼率、肥滿度這6個生長參數(shù)進(jìn)行了比較及分析,結(jié)果表明自繁的異育銀鯽的生長要快于中科三號。在對兩個品系鯽魚體重、體長、體寬、體厚進(jìn)行簡單的相關(guān)分析后,結(jié)果顯示體長與體重相關(guān)系數(shù)最大。對兩個品系鯽魚進(jìn)行營養(yǎng)成分比較后發(fā)現(xiàn),氨基酸總量、必須氨基酸含量和鮮味氨基酸含量均是自繁的異育銀鯽優(yōu)于中科三號。脂肪酸種類及含量比較結(jié)果證明,中科三號在脂肪酸含量上優(yōu)于自繁的異育銀鯽。2.本文采用分子克隆技術(shù)得到了異育銀鯽“中科三號”...
【文章來源】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:75 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 綜述
1 前言
2 MSTN基因概述
3 形態(tài)性狀相關(guān)性研究
4 分子遺傳標(biāo)記概述
5 分子遺傳標(biāo)記技術(shù)在魚類遺傳研究中的應(yīng)用
5.1 RFLP標(biāo)記技術(shù)(Restriction fragment length polymorphhism)
5.2 RAPD標(biāo)記技術(shù)(Randomamplified polymorphic DNA)
5.3 SSR標(biāo)記技術(shù)(Simple sequence repeat,SSR)
5.4 AFLP標(biāo)記技術(shù)(Amplified fragment length polymorphicm)
5.5 SSCP標(biāo)記技術(shù)(single strand conformation polymorphism)
5.6 SCAR標(biāo)記技術(shù)(Sequence Characterized Ampl-ified Region)
5.7 SRAP標(biāo)記技術(shù)(Sequence-related AmplifiedPolymorphism)
5.8 TRAP標(biāo)記技術(shù)(Target Region Amplified Poly-morphism)
5.9 SNPs標(biāo)記技術(shù)(Single Nucleotide Polymorphism)
5.9.1 SNPs技術(shù)概述
5.9.2 SNPs技術(shù)在水產(chǎn)動物遺傳育種中的應(yīng)用
6 本文研究的目的與意義
第二章 兩個品系異育銀鯽可量性狀及營養(yǎng)成分比較
1. 引言
2 材料與方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.2 標(biāo)記方法
2.3 數(shù)據(jù)測量
2.4 肌肉營養(yǎng)成分的測定
2.5 數(shù)據(jù)處理
2.5.1 生長參數(shù)計(jì)算
2.5.2 數(shù)據(jù)分析
3. 結(jié)果分析
3.1 各形態(tài)性狀的表型參數(shù)
3.2 生長參數(shù)比較分析
3.3 性狀間相關(guān)性分析
3.4 肌肉營養(yǎng)價(jià)值分析
3.4.1 蛋白質(zhì)與灰分含量
3.4.2 氨基酸
3.4.3 脂肪酸
4. 討論
4.1 兩個品系鯽魚體重與其他性狀的比較及相關(guān)性分析特點(diǎn)
4.2 營養(yǎng)價(jià)值比較在品系比較中的參考價(jià)值
第三章 兩個品系異育銀鯽MSTN基因的克隆及序列分析比較
1. 前言
2. 材料與方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.2 實(shí)驗(yàn)試劑
2.3 實(shí)驗(yàn)方法
2.3.1 總RNA的提取
2.3.2 基因組DNA的提取
2.3.3 cDNA模板的制備
2.3.4 MSTN基因cDNA序列擴(kuò)增
2.3.5 RACE擴(kuò)增銀鯽MSTN mRNA的5’端和3’端序列
2.3.6 基因組DNA擴(kuò)增
2.3.7 半定量RT-PCR檢測
2.3.8 MSTN序列分析
3 結(jié)果與分析
3.1 結(jié)果
3.1.1 兩種異育銀鯽MSTN部分編碼序列的擴(kuò)增
3.1.2 兩種異育銀鯽MSTN5'-RACE和3’-RACE擴(kuò)增
3.1.3 兩種異育銀鯽MSTN內(nèi)含子擴(kuò)增
3.2 分析
3.2.1 MSTN基因序列和氨基酸組成及特征位點(diǎn)分析
3.2.2 MSTN序列同源性與系統(tǒng)發(fā)育分析
3.2.3 異育銀鯽MSTN基因組織表達(dá)分析
3.3 討論
第四章 兩個品系異育銀鯽MSTN基因多態(tài)位點(diǎn)的查找及生長性狀相關(guān)位點(diǎn)的篩選
1. 引言
2. 材料與方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.2 實(shí)驗(yàn)試劑
2.3 實(shí)驗(yàn)方法
2.3.1 基因組DNA的提取
2.3.2 兩種魚MSTN基因外顯子2和3多態(tài)位點(diǎn)的查找
2.3.3 采用Snapshot法進(jìn)行基因分型
2.2.3 數(shù)據(jù)處理
3. 結(jié)果
3.1 兩種異育銀鯽MSTN外顯子2和外顯子3擴(kuò)增及多態(tài)位點(diǎn)查找
3.2 中科三號外顯子2和外顯子3多態(tài)位點(diǎn)與生長性狀關(guān)聯(lián)分析
3.2.1 分型結(jié)果
3.2.2 與生長性狀相關(guān)性分析
3.3 自繁異育銀鯽外顯子2多態(tài)性與生長性狀關(guān)聯(lián)分析
3.3.1 分型結(jié)果
3.3.2 與生長性狀相關(guān)性分析
4. 討論
全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
致謝
科研情況
攻讀學(xué)位期間參加的科研項(xiàng)目
攻讀學(xué)位期間參加的學(xué)術(shù)會議
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的文章
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]SRAP分子標(biāo)記及其在水生動物中的應(yīng)用[J]. 周劍虹,鄭金娟,楊受保,吳建鑫,俞琴琴,魏敏,胡鋒. 湖北農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(17)
[2]微衛(wèi)星分子標(biāo)記技術(shù)及其在水產(chǎn)動物研究中的應(yīng)用[J]. 黎玉元,姚一彬,孫念. 湖南飼料. 2013(02)
[3]SCAR分子標(biāo)記技術(shù)及其在水產(chǎn)動物研究中的應(yīng)用[J]. 羅方興,毛盼,姚一彬. 吉林農(nóng)業(yè). 2013(02)
[4]“黃海1號”中國對蝦抗白斑病的SRAP分子標(biāo)記[J]. 張鐸,李夢陽,楊凱,趙宇亮,趙寶華. 河北師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2013(01)
[5]高郵鴨生長抑制素基因外顯子3多態(tài)性與腹脂率的關(guān)聯(lián)分析[J]. 劉倩,陳永華,蔡鳳仙,朱文奇,王志躍,張湯杰. 中國家禽. 2012(23)
[6]不同鵝種肌肉生長抑制素基因表達(dá)差異研究[J]. 湯青萍,章雙杰,宋遲,趙東偉,鄒劍敏. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2012(23)
[7]鹽城市異育銀鯽池塘高效養(yǎng)殖模式[J]. 李冰,查曉宗,戈賢平. 科學(xué)養(yǎng)魚. 2012(10)
[8]黃河裸裂尻魚肌肉生長抑制素基因克隆及表達(dá)分析[J]. 晁燕,趙蘭英,李長忠,謝保勝,申志新,王國杰,王振剛,李超,拜彬強(qiáng),張輝,祁得林. 動物學(xué)研究. 2012(05)
[9]SNP及其在魚類養(yǎng)殖中的應(yīng)用[J]. 鄒剛剛,陳永久,吳常文. 浙江海洋學(xué)院學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2012(05)
[10]鯪微衛(wèi)星DNA分子標(biāo)記的篩選與遺傳多樣性分析[J]. 劉佳瑤,趙建,鄭光明,朱新平. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2012(04)
本文編號:3608119
【文章來源】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:75 頁
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摘要
ABSTRACT
第一章 綜述
1 前言
2 MSTN基因概述
3 形態(tài)性狀相關(guān)性研究
4 分子遺傳標(biāo)記概述
5 分子遺傳標(biāo)記技術(shù)在魚類遺傳研究中的應(yīng)用
5.1 RFLP標(biāo)記技術(shù)(Restriction fragment length polymorphhism)
5.2 RAPD標(biāo)記技術(shù)(Randomamplified polymorphic DNA)
5.3 SSR標(biāo)記技術(shù)(Simple sequence repeat,SSR)
5.4 AFLP標(biāo)記技術(shù)(Amplified fragment length polymorphicm)
5.5 SSCP標(biāo)記技術(shù)(single strand conformation polymorphism)
5.6 SCAR標(biāo)記技術(shù)(Sequence Characterized Ampl-ified Region)
5.7 SRAP標(biāo)記技術(shù)(Sequence-related AmplifiedPolymorphism)
5.8 TRAP標(biāo)記技術(shù)(Target Region Amplified Poly-morphism)
5.9 SNPs標(biāo)記技術(shù)(Single Nucleotide Polymorphism)
5.9.1 SNPs技術(shù)概述
5.9.2 SNPs技術(shù)在水產(chǎn)動物遺傳育種中的應(yīng)用
6 本文研究的目的與意義
第二章 兩個品系異育銀鯽可量性狀及營養(yǎng)成分比較
1. 引言
2 材料與方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.2 標(biāo)記方法
2.3 數(shù)據(jù)測量
2.4 肌肉營養(yǎng)成分的測定
2.5 數(shù)據(jù)處理
2.5.1 生長參數(shù)計(jì)算
2.5.2 數(shù)據(jù)分析
3. 結(jié)果分析
3.1 各形態(tài)性狀的表型參數(shù)
3.2 生長參數(shù)比較分析
3.3 性狀間相關(guān)性分析
3.4 肌肉營養(yǎng)價(jià)值分析
3.4.1 蛋白質(zhì)與灰分含量
3.4.2 氨基酸
3.4.3 脂肪酸
4. 討論
4.1 兩個品系鯽魚體重與其他性狀的比較及相關(guān)性分析特點(diǎn)
4.2 營養(yǎng)價(jià)值比較在品系比較中的參考價(jià)值
第三章 兩個品系異育銀鯽MSTN基因的克隆及序列分析比較
1. 前言
2. 材料與方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.2 實(shí)驗(yàn)試劑
2.3 實(shí)驗(yàn)方法
2.3.1 總RNA的提取
2.3.2 基因組DNA的提取
2.3.3 cDNA模板的制備
2.3.4 MSTN基因cDNA序列擴(kuò)增
2.3.5 RACE擴(kuò)增銀鯽MSTN mRNA的5’端和3’端序列
2.3.6 基因組DNA擴(kuò)增
2.3.7 半定量RT-PCR檢測
2.3.8 MSTN序列分析
3 結(jié)果與分析
3.1 結(jié)果
3.1.1 兩種異育銀鯽MSTN部分編碼序列的擴(kuò)增
3.1.2 兩種異育銀鯽MSTN5'-RACE和3’-RACE擴(kuò)增
3.1.3 兩種異育銀鯽MSTN內(nèi)含子擴(kuò)增
3.2 分析
3.2.1 MSTN基因序列和氨基酸組成及特征位點(diǎn)分析
3.2.2 MSTN序列同源性與系統(tǒng)發(fā)育分析
3.2.3 異育銀鯽MSTN基因組織表達(dá)分析
3.3 討論
第四章 兩個品系異育銀鯽MSTN基因多態(tài)位點(diǎn)的查找及生長性狀相關(guān)位點(diǎn)的篩選
1. 引言
2. 材料與方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.2 實(shí)驗(yàn)試劑
2.3 實(shí)驗(yàn)方法
2.3.1 基因組DNA的提取
2.3.2 兩種魚MSTN基因外顯子2和3多態(tài)位點(diǎn)的查找
2.3.3 采用Snapshot法進(jìn)行基因分型
2.2.3 數(shù)據(jù)處理
3. 結(jié)果
3.1 兩種異育銀鯽MSTN外顯子2和外顯子3擴(kuò)增及多態(tài)位點(diǎn)查找
3.2 中科三號外顯子2和外顯子3多態(tài)位點(diǎn)與生長性狀關(guān)聯(lián)分析
3.2.1 分型結(jié)果
3.2.2 與生長性狀相關(guān)性分析
3.3 自繁異育銀鯽外顯子2多態(tài)性與生長性狀關(guān)聯(lián)分析
3.3.1 分型結(jié)果
3.3.2 與生長性狀相關(guān)性分析
4. 討論
全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
致謝
科研情況
攻讀學(xué)位期間參加的科研項(xiàng)目
攻讀學(xué)位期間參加的學(xué)術(shù)會議
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的文章
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]SRAP分子標(biāo)記及其在水生動物中的應(yīng)用[J]. 周劍虹,鄭金娟,楊受保,吳建鑫,俞琴琴,魏敏,胡鋒. 湖北農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(17)
[2]微衛(wèi)星分子標(biāo)記技術(shù)及其在水產(chǎn)動物研究中的應(yīng)用[J]. 黎玉元,姚一彬,孫念. 湖南飼料. 2013(02)
[3]SCAR分子標(biāo)記技術(shù)及其在水產(chǎn)動物研究中的應(yīng)用[J]. 羅方興,毛盼,姚一彬. 吉林農(nóng)業(yè). 2013(02)
[4]“黃海1號”中國對蝦抗白斑病的SRAP分子標(biāo)記[J]. 張鐸,李夢陽,楊凱,趙宇亮,趙寶華. 河北師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2013(01)
[5]高郵鴨生長抑制素基因外顯子3多態(tài)性與腹脂率的關(guān)聯(lián)分析[J]. 劉倩,陳永華,蔡鳳仙,朱文奇,王志躍,張湯杰. 中國家禽. 2012(23)
[6]不同鵝種肌肉生長抑制素基因表達(dá)差異研究[J]. 湯青萍,章雙杰,宋遲,趙東偉,鄒劍敏. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2012(23)
[7]鹽城市異育銀鯽池塘高效養(yǎng)殖模式[J]. 李冰,查曉宗,戈賢平. 科學(xué)養(yǎng)魚. 2012(10)
[8]黃河裸裂尻魚肌肉生長抑制素基因克隆及表達(dá)分析[J]. 晁燕,趙蘭英,李長忠,謝保勝,申志新,王國杰,王振剛,李超,拜彬強(qiáng),張輝,祁得林. 動物學(xué)研究. 2012(05)
[9]SNP及其在魚類養(yǎng)殖中的應(yīng)用[J]. 鄒剛剛,陳永久,吳常文. 浙江海洋學(xué)院學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2012(05)
[10]鯪微衛(wèi)星DNA分子標(biāo)記的篩選與遺傳多樣性分析[J]. 劉佳瑤,趙建,鄭光明,朱新平. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2012(04)
本文編號:3608119
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