6個(gè)不同群體鱖基于SSR的遺傳多樣性初步研究
發(fā)布時(shí)間:2022-01-21 09:53
旨在了解不同群體鱖遺傳多樣性及種質(zhì)資源現(xiàn)狀,采用微衛(wèi)星標(biāo)記技術(shù),對(duì)采自6個(gè)不同群體鱖96尾個(gè)體的遺傳多樣性進(jìn)行了初步分析。結(jié)果表明,經(jīng)篩選的10對(duì)引物在6個(gè)鱖群體中的平均等位基因數(shù)(Na)為2.2000~2.5000,期望雜合度(He)為0.6489~0.7289,多態(tài)信息含量(PIC)為0.5614~0.6409(PIC>0.5);群體遺傳分化系數(shù)(Fst)為0.0606(0.05<Fst<0.15),平均基因流(Nm)為4.0151;檢驗(yàn)表明,除高郵和靖江群體外,其他4個(gè)群體均不同程度地偏離Hardy-Weinberg平衡,主要表現(xiàn)為雜合子缺失。構(gòu)建的UPGMA聚類(lèi)圖顯示,銅陵、安慶、太湖、高郵和靖江群體聚為一類(lèi),當(dāng)涂群體聚為另一類(lèi)。本研究表明6個(gè)鱖群體的遺傳多樣性較高,群體間遺傳分化水平中等,群體間存在著一定的基因交流。
【文章來(lái)源】:中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2020,36(26)
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【部分圖文】:
圖1 位點(diǎn)G13在6個(gè)鱖群體的擴(kuò)增電泳圖
多態(tài)信息含量(PIC)常用來(lái)衡量位點(diǎn)的多態(tài)性。Botstein等認(rèn)為,PIC>0.5時(shí),為高度多態(tài)位點(diǎn);0.25<PIC<0.5時(shí),為中度多態(tài)位點(diǎn);PIC<0.25時(shí),為低度多態(tài)位點(diǎn)[14]。在本課題研究的10個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)中,除位點(diǎn)G09和G12(PIC值分別為0.5982和0.5238)屬于高度多態(tài)位點(diǎn)(PIC>0.5)外,其余8個(gè)位點(diǎn)均屬于中度多態(tài)位點(diǎn)(0.25<PIC<0.5),平均多態(tài)信息含量(PIC)值為0.4317,說(shuō)明本研究選取的10個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)多態(tài)性較高,適合用于鱖群體的遺傳多樣性分析。雜合度(H)能反映各個(gè)群體在多個(gè)位點(diǎn)上的遺傳變異,期望雜合度(He)是衡量群體遺傳變異程度的一個(gè)重要參數(shù)[15],期望雜合度(He)越高,說(shuō)明遺傳多樣性越豐富。本課題研究的6個(gè)群體的平均期望雜合度(He)為0.6489-0.7289,趙程等[16]對(duì)5種鱖屬魚(yú)類(lèi)進(jìn)行微衛(wèi)星遺傳多樣性分析,得出來(lái)自湖南的翹嘴鱖野生群體的期望雜合度(He)為0.6900,田華[17]用22個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn),對(duì)長(zhǎng)江鰱、鳙的野生和養(yǎng)殖群體進(jìn)行分析,得到的期望雜合度(He)分別為鰱0.5810~0.6120和鳙0.5400~0.5500,劉朋朋[18]用13對(duì)微衛(wèi)星引物,對(duì)巢湖、滆湖、洪澤湖、鄱陽(yáng)湖和太湖的5個(gè)黃顙魚(yú)種群進(jìn)行SSR分析,其平均期望雜合度(He)為0.5096~0.6098,由此可見(jiàn),相比于其他的鱖種群以及長(zhǎng)江流域的其他魚(yú)類(lèi)種群,本課題6個(gè)鱖群體的遺傳多樣性較為豐富的,當(dāng)環(huán)境發(fā)生變化時(shí),鱖群體能有較高的適應(yīng)能力。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]鱖屬5種魚(yú)類(lèi)微衛(wèi)星遺傳多樣性分析[J]. 趙程,梁旭方,田昌緒,楊敏,竇亞琪,郭穩(wěn)杰,宋易. 華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2015(05)
[2]2個(gè)鱖魚(yú)選育群體遺傳多樣性分析[J]. 張進(jìn),梁旭方,楊敏,陳敦學(xué),劉燦洪,巫紹明,李永鋒. 水產(chǎn)科學(xué). 2014(07)
[3]翹嘴鱖養(yǎng)殖與野生群體及其家系的遺傳多樣性分析[J]. 楊凱,高銀愛(ài),丹成,曾可為,王青云,朱思華,夏儒龍,鄭翠華,羅峰,程穎紅,王輝,李波. 淡水漁業(yè). 2013(03)
[4]瓦氏雅羅魚(yú)達(dá)里湖群體和烏蘇里江群體的遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)分析[J]. 池炳杰,常玉梅,閆學(xué)春,曹頂臣,高玉奎,柳玉海,李勇,梁利群. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2010(02)
[5]利用微衛(wèi)星標(biāo)記分析長(zhǎng)鰭鯉、錦鯉和龍鳳鯉的遺傳多樣性[J]. 孫莉,楊國(guó)梁,王軍毅,吳婷婷,張海波,吳添文,陳國(guó)宏. 揚(yáng)州大學(xué)學(xué)報(bào)(農(nóng)業(yè)與生命科學(xué)版). 2009(03)
[6]牙鲆5個(gè)養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性分析[J]. 劉海金,朱曉琛,孫效文,楊立更,薛玲玲,毛連菊. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2008(01)
[7]FIASCO法篩選鱖魚(yú)微衛(wèi)星標(biāo)記[J]. 匡剛橋,劉臻,魯雙慶,劉紅玉,張建社,唐建洲. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2007(04)
[8]應(yīng)用微衛(wèi)星多態(tài)分析四個(gè)鯉魚(yú)群體的遺傳多樣性[J]. 全迎春,孫效文,梁利群. 動(dòng)物學(xué)研究. 2005(06)
[9]鱖野生群體與養(yǎng)殖群體的RAPD分析[J]. 方展強(qiáng),陳軍,鄭文彪,伍育源,肖智. 大連水產(chǎn)學(xué)院學(xué)報(bào). 2005(01)
[10]鱖魚(yú)遺傳多樣性的RAPD指紋分析[J]. 楊受保,祖國(guó)掌,程久發(fā). 水產(chǎn)養(yǎng)殖. 2003(04)
碩士論文
[1]翹嘴鱖微衛(wèi)星標(biāo)記的開(kāi)發(fā)以及三個(gè)群體遺傳多態(tài)性分析[D]. 彭敏燕.暨南大學(xué) 2013
[2]長(zhǎng)江中下游五個(gè)地理種群黃顙魚(yú)遺傳多樣性的分析以及MSTN多態(tài)性的研究[D]. 劉朋朋.南京師范大學(xué) 2013
[3]鰱鳙長(zhǎng)江野生群體和養(yǎng)殖群體微衛(wèi)星的遺傳多樣性分析[D]. 田華.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
本文編號(hào):3600044
【文章來(lái)源】:中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2020,36(26)
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【部分圖文】:
圖1 位點(diǎn)G13在6個(gè)鱖群體的擴(kuò)增電泳圖
多態(tài)信息含量(PIC)常用來(lái)衡量位點(diǎn)的多態(tài)性。Botstein等認(rèn)為,PIC>0.5時(shí),為高度多態(tài)位點(diǎn);0.25<PIC<0.5時(shí),為中度多態(tài)位點(diǎn);PIC<0.25時(shí),為低度多態(tài)位點(diǎn)[14]。在本課題研究的10個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)中,除位點(diǎn)G09和G12(PIC值分別為0.5982和0.5238)屬于高度多態(tài)位點(diǎn)(PIC>0.5)外,其余8個(gè)位點(diǎn)均屬于中度多態(tài)位點(diǎn)(0.25<PIC<0.5),平均多態(tài)信息含量(PIC)值為0.4317,說(shuō)明本研究選取的10個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)多態(tài)性較高,適合用于鱖群體的遺傳多樣性分析。雜合度(H)能反映各個(gè)群體在多個(gè)位點(diǎn)上的遺傳變異,期望雜合度(He)是衡量群體遺傳變異程度的一個(gè)重要參數(shù)[15],期望雜合度(He)越高,說(shuō)明遺傳多樣性越豐富。本課題研究的6個(gè)群體的平均期望雜合度(He)為0.6489-0.7289,趙程等[16]對(duì)5種鱖屬魚(yú)類(lèi)進(jìn)行微衛(wèi)星遺傳多樣性分析,得出來(lái)自湖南的翹嘴鱖野生群體的期望雜合度(He)為0.6900,田華[17]用22個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn),對(duì)長(zhǎng)江鰱、鳙的野生和養(yǎng)殖群體進(jìn)行分析,得到的期望雜合度(He)分別為鰱0.5810~0.6120和鳙0.5400~0.5500,劉朋朋[18]用13對(duì)微衛(wèi)星引物,對(duì)巢湖、滆湖、洪澤湖、鄱陽(yáng)湖和太湖的5個(gè)黃顙魚(yú)種群進(jìn)行SSR分析,其平均期望雜合度(He)為0.5096~0.6098,由此可見(jiàn),相比于其他的鱖種群以及長(zhǎng)江流域的其他魚(yú)類(lèi)種群,本課題6個(gè)鱖群體的遺傳多樣性較為豐富的,當(dāng)環(huán)境發(fā)生變化時(shí),鱖群體能有較高的適應(yīng)能力。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]鱖屬5種魚(yú)類(lèi)微衛(wèi)星遺傳多樣性分析[J]. 趙程,梁旭方,田昌緒,楊敏,竇亞琪,郭穩(wěn)杰,宋易. 華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2015(05)
[2]2個(gè)鱖魚(yú)選育群體遺傳多樣性分析[J]. 張進(jìn),梁旭方,楊敏,陳敦學(xué),劉燦洪,巫紹明,李永鋒. 水產(chǎn)科學(xué). 2014(07)
[3]翹嘴鱖養(yǎng)殖與野生群體及其家系的遺傳多樣性分析[J]. 楊凱,高銀愛(ài),丹成,曾可為,王青云,朱思華,夏儒龍,鄭翠華,羅峰,程穎紅,王輝,李波. 淡水漁業(yè). 2013(03)
[4]瓦氏雅羅魚(yú)達(dá)里湖群體和烏蘇里江群體的遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)分析[J]. 池炳杰,常玉梅,閆學(xué)春,曹頂臣,高玉奎,柳玉海,李勇,梁利群. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2010(02)
[5]利用微衛(wèi)星標(biāo)記分析長(zhǎng)鰭鯉、錦鯉和龍鳳鯉的遺傳多樣性[J]. 孫莉,楊國(guó)梁,王軍毅,吳婷婷,張海波,吳添文,陳國(guó)宏. 揚(yáng)州大學(xué)學(xué)報(bào)(農(nóng)業(yè)與生命科學(xué)版). 2009(03)
[6]牙鲆5個(gè)養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性分析[J]. 劉海金,朱曉琛,孫效文,楊立更,薛玲玲,毛連菊. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2008(01)
[7]FIASCO法篩選鱖魚(yú)微衛(wèi)星標(biāo)記[J]. 匡剛橋,劉臻,魯雙慶,劉紅玉,張建社,唐建洲. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2007(04)
[8]應(yīng)用微衛(wèi)星多態(tài)分析四個(gè)鯉魚(yú)群體的遺傳多樣性[J]. 全迎春,孫效文,梁利群. 動(dòng)物學(xué)研究. 2005(06)
[9]鱖野生群體與養(yǎng)殖群體的RAPD分析[J]. 方展強(qiáng),陳軍,鄭文彪,伍育源,肖智. 大連水產(chǎn)學(xué)院學(xué)報(bào). 2005(01)
[10]鱖魚(yú)遺傳多樣性的RAPD指紋分析[J]. 楊受保,祖國(guó)掌,程久發(fā). 水產(chǎn)養(yǎng)殖. 2003(04)
碩士論文
[1]翹嘴鱖微衛(wèi)星標(biāo)記的開(kāi)發(fā)以及三個(gè)群體遺傳多態(tài)性分析[D]. 彭敏燕.暨南大學(xué) 2013
[2]長(zhǎng)江中下游五個(gè)地理種群黃顙魚(yú)遺傳多樣性的分析以及MSTN多態(tài)性的研究[D]. 劉朋朋.南京師范大學(xué) 2013
[3]鰱鳙長(zhǎng)江野生群體和養(yǎng)殖群體微衛(wèi)星的遺傳多樣性分析[D]. 田華.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
本文編號(hào):3600044
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