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凡納濱對蝦LvJNK沉默的轉(zhuǎn)錄組比較和3種lvp38亞型的功能分析

發(fā)布時間:2022-01-14 02:08
  凡納濱對蝦是水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)主要的養(yǎng)殖品種,也是水產(chǎn)行業(yè)主要的經(jīng)濟(jì)種類。然而,對蝦的各種病害時刻影響對蝦產(chǎn)業(yè)持續(xù)穩(wěn)定健康的發(fā)展,因此,致力于對蝦抗病基因及其相關(guān)免疫功能基因的研究,能夠為對蝦病害的防治提供重要的理論基礎(chǔ)。轉(zhuǎn)錄組測序可以分析特定生理條件下細(xì)胞內(nèi)所有mRNA的表達(dá)水平,因此可以應(yīng)用于不同實驗條件下特定基因在mRNA表達(dá)水平的比較分析。在哺乳動物研究中JNK信號通路是細(xì)胞內(nèi)重要的信號通路,能夠參與許多細(xì)胞活動。在前期對蝦的研究發(fā)現(xiàn),LvJNK可以被WSSV病毒激活利用。為了深入全面的了解LvJNK在WSSV感染過程中的作用機(jī)制,本研究基于二代測序平臺,通過RNA-seq技術(shù)手段進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組差異比較分析LvJNK在WSSV感染中的關(guān)聯(lián)基因及可能參與的生物學(xué)過程。通過轉(zhuǎn)錄組差異比較分析共篩選得到230條差異基因,其中112條基因表達(dá)上調(diào),118條基因表達(dá)下調(diào)。隨后進(jìn)一步分析了與JNK功能密切相關(guān)且已有相關(guān)研究報道的部分差異基因,同時對差異基因進(jìn)行GO功能分類和KEGG富集分析。以上研究為后續(xù)對蝦JNK通路的深入研究奠定了良好的基礎(chǔ)。p38是MAPK家族中關(guān)鍵的應(yīng)激活化蛋白激酶,可以被多種... 

【文章來源】:自然資源部第三海洋研究所福建省

【文章頁數(shù)】:126 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

凡納濱對蝦LvJNK沉默的轉(zhuǎn)錄組比較和3種lvp38亞型的功能分析


WSSV結(jié)構(gòu)示意圖

基因組結(jié)構(gòu),病毒,囊膜蛋白,蛋白


圖 2 WSSV 中國大陸株基因組結(jié)構(gòu)圖[7]Fig.2 The genomic structure of the WSSV-CN strainsSSV 功能基因研究SSV 基因編碼的蛋白,主要分為結(jié)構(gòu)蛋白和非結(jié)構(gòu)蛋白。結(jié)構(gòu)蛋白主要蛋白、核衣殼蛋白和被膜蛋白三種,可以維持病毒構(gòu)型,保護(hù)核酸,還病毒對組織及細(xì)胞的識別、吸附和侵入。非結(jié)構(gòu)蛋白主要是與催化、調(diào)酶和蛋白。WSSV 的囊膜蛋白至少由 35 種構(gòu)成,其中最重要的是 VP26 兩種蛋白,其在囊膜蛋白中含量高達(dá) 60%[12]。據(jù)研究報道,VP28 在宿主的最初階段可以與細(xì)胞膜上的 PmRab7 蛋白相互作用,輔助病毒與合,進(jìn)而促進(jìn)病毒入胞[13; 14]。VP26 可以與細(xì)胞的一種骨架蛋白 actin 相來協(xié)助病毒進(jìn)入細(xì)胞后快速接近細(xì)胞核以盡快完成自身復(fù)制[15]。據(jù)相

模型圖,斑節(jié)對蝦,模型,血淋巴


圖 3 斑節(jié)對蝦酚氧化酶原激活系統(tǒng)模型[46]Fig.3 Model of proPO-activating system in P.monodon淋巴凝結(jié)反應(yīng)巴凝結(jié)作用在脊椎動物和無脊椎動物中都發(fā)揮著非常重要的作用口快速的郁結(jié),減少血淋巴流失使傷口愈合,而且在免疫防御方面的作用,可以快速固定病原體并利于清除[51]。凝結(jié)過程主要是血氨酰胺酶調(diào)節(jié),由血漿中的凝結(jié)蛋白通過復(fù)雜的交聯(lián)反應(yīng)形成凝塊谷氨酰胺酶是一種 Ca2+依賴性的蛋白酶,能夠催化某些蛋白(如氨酸和谷氨酰胺之間形成共價鍵。血淋巴凝結(jié)的級聯(lián)反應(yīng)不僅在鱟中都有研究[31],而且在各對蝦中也有所研究。在中國明對蝦中測血細(xì)胞感染 WSSV 后晚期轉(zhuǎn)谷氨酰胺酶轉(zhuǎn)錄水平明顯下降,證

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]LRP-1抑制缺氧/復(fù)氧誘導(dǎo)的腎細(xì)胞損傷[J]. 段斌,職瑾,杜鵬,高妍婷,李振江.  現(xiàn)代醫(yī)學(xué). 2017(12)
[2]中國對蝦養(yǎng)殖業(yè)發(fā)展軌跡及技術(shù)變遷[J]. 周井娟.  中國農(nóng)學(xué)通報. 2016(08)
[3]南美白對蝦養(yǎng)殖技術(shù)[J]. 沈偉林,張鵬.  農(nóng)民致富之友. 2015(12)
[4]溶藻弧菌感染后凡納濱對蝦鰓組織免疫相關(guān)基因的表達(dá)[J]. 羅詞興,黃旭雄,李桑,趙利斌,危立坤,陳春燕,劉林林,曾蓓蓓.  中國水產(chǎn)科學(xué). 2014(01)
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[6]中國明對蝦caspase基因的克隆與表達(dá)分析[J]. 宋光年,金松君,張繼泉,相建海.  海洋科學(xué). 2010(12)
[7]中國明對蝦Rel/NF-κB家族基因在弧菌刺激下的表達(dá)[J]. 閻慧,李富花,王兵,張繼泉,馬洪明,相建海.  海洋與湖沼. 2008(06)
[8]LPS影響p38蛋白在單核細(xì)胞內(nèi)定位[J]. 張琳,劉怒云,姜勇,李慶林,張璐.  中國病理生理雜志. 2007(06)
[9]甲殼動物血細(xì)胞及其在免疫防御中的功能[J]. 姚翠鸞,王志勇,相建海.  動物學(xué)研究. 2006(05)
[10]蝦類免疫機(jī)制的特點及其免疫增強(qiáng)劑的研究進(jìn)展[J]. 李紅權(quán),劉燕.  畜牧獸醫(yī)科技信息. 2006(08)

碩士論文
[1]斑節(jié)對蝦JNK信號通路中的JNK、C-JUN和ATF-2基因的克隆與功能研究[D]. 時恭芳.上海海洋大學(xué) 2017
[2]中國明對蝦Rac1/PI3K/Akt通路相關(guān)基因的克隆和功能關(guān)系的初步研究[D]. 遲艷紅.中國科學(xué)院研究生院(海洋研究所) 2012



本文編號:3587596

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