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尼羅羅非魚MHC Iα和β 2 m基因cDNA的克

發(fā)布時間:2022-01-04 07:46
  主要組織相容性復(fù)合體(Major Histocompatibility Complex,MHC)是存在于所有已知脊椎動物體內(nèi)、與免疫功能密切相關(guān)的基因家族,由它編碼的一類細(xì)胞表面轉(zhuǎn)膜蛋白,能結(jié)合并呈遞內(nèi)源抗原和外源抗原給T淋巴細(xì)胞,激發(fā)機體免疫反應(yīng)。本文以尼羅羅非魚為研究對象,采用同源克隆、RACE-PCR、qPCR等技術(shù),克隆了尼羅羅非魚MHC α和β2m基因的cDNA,分析了MHC α和β2mcDNA的多態(tài)性,以及MHC α和β2m基因在健康尼羅羅非魚各組織(腦、鰓、肝臟、腸、胃、腎臟、心臟、脾臟、皮膚和肌肉)中的分布以及感染無乳鏈球菌后基因在鰓、腎臟、心臟和脾臟中表達量的變化。結(jié)果如下:一、尼羅羅非魚MHC α全長cDNA的克隆、多態(tài)性及組織表達分析獲得的尼羅羅非魚MHC α cDNA全長為1533bp,其開放閱讀框(Open Reading Frame, ORF)為1053bp。編碼的蛋白質(zhì)分子包含信號肽、MHC結(jié)構(gòu)域、IGc1結(jié)構(gòu)域和跨膜區(qū),并存在豐富的磷酸化位點。對氨基酸序列進行功能結(jié)構(gòu)域分析的結(jié)果顯示,1-18位為信號肽,209-283位為功能區(qū)(IGc1區(qū)),303-3... 

【文章來源】:上海海洋大學(xué)上海市

【文章頁數(shù)】:66 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

尼羅羅非魚MHC Iα和β 2 m基因cDNA的克


尼羅羅非魚鰓組織總RNA,M:DL2000核酸分子量標(biāo)準(zhǔn);1-3為不同個體的尼羅羅非M123

序列,蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測,尼羅羅非魚


基酸序列進行功能結(jié)構(gòu)域分析的結(jié)果顯示,1-18 位為信號肽,209-283 位為功能區(qū)(IGc1 區(qū)),303-325 位為蛋白質(zhì)的跨膜螺旋區(qū)(圖 1-2)。圖.1-2 尼羅羅非魚 MHC α 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測注:紅色區(qū)域表示信號肽,黑灰色方框表示 MHC-I 結(jié)構(gòu)域,綠色圓形區(qū)域表示 IGc1 結(jié)構(gòu)域,藍(lán)色表示跨膜螺旋區(qū)。Fig. 1-2 Nile tilapia MHC α protein structure prediction.Note: Red area indicates the signal peptide, black and gray box represents MHC-I domains, green circular2000 bp1000 bp18SSS28SM 1 2 3

標(biāo)準(zhǔn)曲線,內(nèi)參,標(biāo)準(zhǔn)曲線


圖 1-6 目的基因和內(nèi)參基因的標(biāo)準(zhǔn)曲線a:為目的基因的標(biāo)準(zhǔn)曲線,b:內(nèi)參基因的標(biāo)準(zhǔn)曲線。Fig.1-6The standard curve of target gene and reference gene.a: the standard curve of the target gene, b: the standard curve of the reference gene.2.5 目的基因和內(nèi)參基因的擴增曲線采用 qPCR 技術(shù),分別檢測目的基因和內(nèi)參基因在不同樣本中的表達豐度通過 ABI PRISM 7300 熒光定量 PCR 儀(美國 Applied Biosystems)分析得到環(huán)數(shù)與熒光強度的關(guān)系,結(jié)果見圖 1-7。a.

【參考文獻】:
期刊論文
[1]尼羅羅非魚主要組織相容性復(fù)合體IA基因克隆與多態(tài)分析[J]. 李同明,周芬娜,崔志峰,季相山,王慧.  山東大學(xué)學(xué)報(理學(xué)版). 2013(11)
[2]羅非魚鏈球菌病綜合治療方法初探[J]. 唐群,曾桂中,陸之澤.  廣西畜牧獸醫(yī). 2013(03)
[3]赤點石斑魚MHC IA基因的克隆與表達多態(tài)性分析[J]. 沈銘輝,鄭樂云,杜佳瑩,王軍.  廈門大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2013(01)
[4]紅笛鯛主要組織相容性復(fù)合物Ⅰα抗原基因的克隆與表達分析[J]. 張新中,魯義善,吳灶和,簡紀(jì)常.  水產(chǎn)學(xué)報. 2012(10)
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[6]軍曹魚MHC-Ⅰα基因全長cDNA的克隆及其組織表達分析[J]. 張鶴,茅莉娜,馮娟,管越強,許海東,蘇友祿.  南方水產(chǎn)科學(xué). 2011(01)
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[8]團頭魴主要組織相容性復(fù)合體Ⅰ類基因全長cDNA的克隆及組織表達分析[J]. 馬曉茜,劉至治,李思發(fā),唐文喬,楊金權(quán).  上海海洋大學(xué)學(xué)報. 2011(01)
[9]廣東與海南養(yǎng)殖羅非魚無乳鏈球菌的分離、鑒定與特性分析[J]. 盧邁新,黎炯,葉星,鄧國成,江小燕,田園園,賴翠玲.  微生物學(xué)通報. 2010(05)
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碩士論文
[1]赤點石斑魚MHC基因的克隆與多態(tài)性分析[D]. 杜佳瑩.廈門大學(xué) 2008
[2]大菱鲆受哈維氏弧菌感染后的基因差異表達研究[D]. 王傳娟.中國海洋大學(xué) 2007
[3]草魚β2m基因的分子克隆與MHC class Ⅰ多態(tài)性分析及其重組蛋白的鑒定[D]. 楊天耀.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005



本文編號:3567974

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