為探究雜交鲀（紅鰭東方鲀×菊黃東方鲀）與紅鰭東方鲀差異的分子調(diào)節(jié)機(jī)制,利用Illumina高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)紅鰭東方鲀及雜交鲀的腦、腎臟樣本組織進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,篩選差異表達(dá)基因。結(jié)果表明:通過(guò)RNA-seq技術(shù)共篩選到2 207個(gè)DEGs （腦）和1 823個(gè)DEGs （腎臟）。其中在腦組織樣本中有1 068個(gè)DEGs表達(dá)上調(diào),1 139個(gè)DEGs表達(dá)下調(diào),腎臟組織樣本中有851個(gè)DEGs表達(dá)上調(diào),972個(gè)DEGs表達(dá)下調(diào);通過(guò)GO功能分類與KEGG富集分析,將腦組織的差異基因區(qū)分為60個(gè)功能類別及137個(gè)代謝途徑,包括G蛋白偶聯(lián)受體信號(hào)通路、跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)、分子功能調(diào)節(jié)劑、鈣離子結(jié)合等;腎臟組織的差異基因被區(qū)分為31個(gè)功能分類及142個(gè)代謝途徑,包括氧化還原酶活性、肽酶活性、蛋白水解、細(xì)胞外區(qū)域等。該研究探討了雜交鲀與紅鰭東方鲀生長(zhǎng)發(fā)育差異過(guò)程的相關(guān)分子調(diào)控機(jī)制,可為后續(xù)相關(guān)研究提供初步理論參考與依據(jù)。 

【文章來(lái)源】：安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(08)

【文章頁(yè)數(shù)】：5 頁(yè)

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 供試材料
    1.2 總RNA提取 cDNA文庫(kù)構(gòu)建和測(cè)序
    1.3 差異表達(dá)基因GO與KEGG富集分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)質(zhì)控分析
    2.2 差異基因的篩選
    2.3 差異基因GO分析
    2.4 KEGG代謝途徑分析
3 討論與結(jié)論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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