基于線粒體COⅠ的南海北部長(zhǎng)棘銀鱸遺傳多樣性分析
發(fā)布時(shí)間：2021-11-13 05:14
為了解中國(guó)長(zhǎng)棘銀鱸（Gerres filamentosus）的遺傳背景以更好地保護(hù)與開(kāi)發(fā)利用種質(zhì)資源,測(cè)定了南海北部7個(gè)群體線粒體COⅠ基因5′端序列,以分析其遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)。結(jié)果發(fā)現(xiàn),176尾長(zhǎng)棘銀鱸652 bp序列中有25個(gè)單倍型,155個(gè)變異位點(diǎn)。7個(gè)群體整體呈現(xiàn)較高的單倍型多樣性（Hd=0.767±0.018）與較低的核苷酸多樣性（π=0.055 0±0.003 7）。就遺傳多樣性指數(shù)而言,碣石群體（Hd=0.606±0.092,π=0.059 2±0.006 6）最高,次高為陽(yáng)江群體（Hd=0.323±0.102,π=0.027 0±0.010 7）;瓊海群體（Hd=0.560±0.125,π=0.001 0±0.000 3）最低,次低為陵水群體（Hd=0.685±0.077,π=0.001 5±0.000 3）。群體遺傳分化系數(shù)Fst顯示,碣石、陽(yáng)江群體與其他群體間存在高度（極顯著）的遺傳分化(Fst=0.517 1...
【文章來(lái)源】：海洋漁業(yè). 2020,42(03)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】：9 頁(yè)
【部分圖文】：
長(zhǎng)棘銀鱸單倍型網(wǎng)絡(luò)圖
表4 長(zhǎng)棘銀鱸中性檢驗(yàn)和不對(duì)稱分析Tab.4 Neutrality tests and mismatch analysisof G. filamentosus 群體Population Tajima’s D Fu’s Fs test SSD Rg JS 3.281 3 21.930 0.464 1*** 0.179 0 YJ -0.442 5 19.719 0.046 5* 0.476 1 QH -0.010 9 -0.072 1 0.024 4 0.191 0 LS -1.518 6* -3.293 6** 0.010 7 0.120 9 DF -2.590 6*** 9.479 7 0.025 0 0.162 1 XY -2.650 4*** 2.255 5 0.006 9 0.078 2 DX -1.429 9 -2.075 5 0.010 1 0.069 3 總體Total -0.765 9 6.849 1 0.084 0 0.182 4 注:JS:碣石;YJ:陽(yáng)江;QH:瓊海;LS:陵水;DF:東方;XY:新盈;DX:東興。*:0.01<P<0.05;**:0.001<P<0.01; ***:P<0.001Note:JS:Jieshi;YJ:Yangjiang;QH:Qionghai;LS:Lingshui;DF:Dongfang;XY:Xinying;DX:Dongxing.*:0.01<P<0.05;**:0.001<P<0.01;***:P<0.0013 討論
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]基于COI基因和D-loop區(qū)部分序列比較雷州半島東、西岸湖棲鰭蝦虎魚(yú)群體的遺傳多樣性[J]. 廖健,龍水生,賀亮,郭昱嵩,劉楚吾,劉麗,王中鐸. 海洋科學(xué). 2017(02)
[2]淺地層剖面揭示瓊州海峽的形成時(shí)代[J]. 倪玉根,夏真,馬勝中. 海洋地質(zhì)與第四紀(jì)地質(zhì). 2014(04)
[3]北部灣秋季底層魚(yú)類多樣性和優(yōu)勢(shì)種數(shù)量的變動(dòng)趨勢(shì)[J]. 王雪輝,邱永松,杜飛雁,林昭進(jìn),孫典榮,黃碩琳. 生態(tài)學(xué)報(bào). 2012(02)
[4]一種高效快速的魚(yú)類標(biāo)本基因組DNA提取方法[J]. 樂(lè)小亮,章群,趙爽,范鳳娟. 生物技術(shù)通報(bào). 2010(02)
[5]瓊州海峽成因與時(shí)代[J]. 趙煥庭,王麗榮,袁家義. 海洋地質(zhì)與第四紀(jì)地質(zhì). 2007(02)
[6]北部灣主要經(jīng)濟(jì)魚(yú)類資源變動(dòng)分析及保護(hù)對(duì)策探討[J]. 孫典榮,林昭進(jìn). 熱帶海洋學(xué)報(bào). 2004(02)
[7]海南島海岸環(huán)境特征[J]. 王穎. 海洋地質(zhì)動(dòng)態(tài). 2002(03)
[8]數(shù)值分類法在中國(guó)銀鱸屬魚(yú)種分類研究中的應(yīng)用[J]. 劉靜,田明誠(chéng). 海洋科學(xué). 1997(01)
本文編號(hào)：3492392
【文章來(lái)源】：海洋漁業(yè). 2020,42(03)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】：9 頁(yè)
【部分圖文】：
長(zhǎng)棘銀鱸單倍型網(wǎng)絡(luò)圖
表4 長(zhǎng)棘銀鱸中性檢驗(yàn)和不對(duì)稱分析Tab.4 Neutrality tests and mismatch analysisof G. filamentosus 群體Population Tajima’s D Fu’s Fs test SSD Rg JS 3.281 3 21.930 0.464 1*** 0.179 0 YJ -0.442 5 19.719 0.046 5* 0.476 1 QH -0.010 9 -0.072 1 0.024 4 0.191 0 LS -1.518 6* -3.293 6** 0.010 7 0.120 9 DF -2.590 6*** 9.479 7 0.025 0 0.162 1 XY -2.650 4*** 2.255 5 0.006 9 0.078 2 DX -1.429 9 -2.075 5 0.010 1 0.069 3 總體Total -0.765 9 6.849 1 0.084 0 0.182 4 注:JS:碣石;YJ:陽(yáng)江;QH:瓊海;LS:陵水;DF:東方;XY:新盈;DX:東興。*:0.01<P<0.05;**:0.001<P<0.01; ***:P<0.001Note:JS:Jieshi;YJ:Yangjiang;QH:Qionghai;LS:Lingshui;DF:Dongfang;XY:Xinying;DX:Dongxing.*:0.01<P<0.05;**:0.001<P<0.01;***:P<0.0013 討論
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]基于COI基因和D-loop區(qū)部分序列比較雷州半島東、西岸湖棲鰭蝦虎魚(yú)群體的遺傳多樣性[J]. 廖健,龍水生,賀亮,郭昱嵩,劉楚吾,劉麗,王中鐸. 海洋科學(xué). 2017(02)
[2]淺地層剖面揭示瓊州海峽的形成時(shí)代[J]. 倪玉根,夏真,馬勝中. 海洋地質(zhì)與第四紀(jì)地質(zhì). 2014(04)
[3]北部灣秋季底層魚(yú)類多樣性和優(yōu)勢(shì)種數(shù)量的變動(dòng)趨勢(shì)[J]. 王雪輝,邱永松,杜飛雁,林昭進(jìn),孫典榮,黃碩琳. 生態(tài)學(xué)報(bào). 2012(02)
[4]一種高效快速的魚(yú)類標(biāo)本基因組DNA提取方法[J]. 樂(lè)小亮,章群,趙爽,范鳳娟. 生物技術(shù)通報(bào). 2010(02)
[5]瓊州海峽成因與時(shí)代[J]. 趙煥庭,王麗榮,袁家義. 海洋地質(zhì)與第四紀(jì)地質(zhì). 2007(02)
[6]北部灣主要經(jīng)濟(jì)魚(yú)類資源變動(dòng)分析及保護(hù)對(duì)策探討[J]. 孫典榮,林昭進(jìn). 熱帶海洋學(xué)報(bào). 2004(02)
[7]海南島海岸環(huán)境特征[J]. 王穎. 海洋地質(zhì)動(dòng)態(tài). 2002(03)
[8]數(shù)值分類法在中國(guó)銀鱸屬魚(yú)種分類研究中的應(yīng)用[J]. 劉靜,田明誠(chéng). 海洋科學(xué). 1997(01)
本文編號(hào)：3492392
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