刺參不同群體遺傳多樣性分析
發(fā)布時間:2021-11-04 07:39
刺參(Apostichopus japonicus)隸屬于棘皮動物門、游走亞門、海參綱、楯手目、刺參科,自然分布在西太平洋的中國、韓國、日本沿海,深受這些國家人民的喜愛。利用分子標(biāo)記的方法研究刺參的遺傳多樣性是近些年發(fā)展起來的。本文利用SSR與COⅠ兩種分子標(biāo)記方法對大連自然刺參群體與養(yǎng)殖刺參群體進行遺傳多樣性研究和遺傳結(jié)構(gòu)比對分析。結(jié)果表明,SSR標(biāo)記揭示了自然群體具有高度的遺傳多樣性。篩選獲得33對引物,目的片段大小為67-306bp之間;每個引物檢測出等位基因數(shù)3-8不等;有效等位基因平均為4.736個;期望雜合度He和觀測雜合度Ho分別為0.270-0.8446和0.598-0.875;大連海域自然群體的多態(tài)信息含量平均數(shù)為0.732,說明遺傳多樣性豐富;共有23對引物符合哈迪溫伯格平衡,被檢測位點偏離Hardy–Weinberg平衡的現(xiàn)象普遍存在,我們認(rèn)為這可能是由實驗所采用的樣本數(shù)量和規(guī)格大小有限或者是由于無效等位基因的存在。COⅠ序列對野生和養(yǎng)殖群體測序、比對和對位排列后的結(jié)果表明,有654個堿基具有同源序列,共四個群體選取49個體,40個個體發(fā)現(xiàn)變異位點(YSA9個、Y...
【文章來源】:大連海洋大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:59 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
普通方法提取刺參DNA1%瓊脂糖電泳圖(M=DL2000)
改進方法提取刺參DNA1%瓊脂糖電泳圖(M=DL2000)
退火溫度60℃全部引物同一基因組PCR檢測電泳圖
【參考文獻】:
期刊論文
[1]利用DNA條形碼技術(shù)鑒定一批鱷魚產(chǎn)品[J]. 郭鳳娟,陽建春,胡詩佳,李詠施. 生物技術(shù)通報. 2013(08)
[2]基于COI基因序列的太湖新銀魚遺傳多樣性[J]. 張迪,雷光春,龔成,王忠鎖. 湖泊科學(xué). 2012(02)
[3]亞洲黑熊COI序列變異及其DNA條碼的應(yīng)用[J]. 魯再豐,蔣國紅,白素英. 東北林業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2010(10)
[4]福建近海藍(lán)圓鲹種群遺傳多樣性的AFLP分析[J]. 張麗艷,蘇永全,丁少雄,牛素芳,劉東騰,王軍. 水產(chǎn)學(xué)報. 2010(05)
[5]基于線粒體CO1基因的DNA條形碼在石首魚科(Sciaenidae)魚類系統(tǒng)分類中的應(yīng)用[J]. 柳淑芳,陳亮亮,戴芳群,莊志猛. 海洋與湖沼. 2010(02)
[6]舟山鮸魚群體遺傳多樣性的AFLP研究[J]. 彭志蘭,柳敏海,傅榮兵,羅海忠,夏楓峰,徐志進. 上海海洋大學(xué)學(xué)報. 2010(02)
[7]中國東海日本鰻鱺種群遺傳結(jié)構(gòu)的AFLP分析[J]. 張辛,許璞,許廣平,劉培庭,仲霞銘,李旭光,徐健榮,丁亞平,許曉風(fēng). 水生態(tài)學(xué)雜志. 2010(01)
[8]三種蟶的遺傳多樣性分析[J]. 邵艷卿,陸榮茂,董迎輝,柴雪良,肖國強,林志華. 海洋科學(xué). 2009(10)
[9]4種海參16S rRNA和COI基因片段序列比較及系統(tǒng)學(xué)研究[J]. 陳麗梅,李琪,李赟. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2008(06)
[10]單核苷酸多態(tài)性及其在水產(chǎn)動物遺傳育種中的應(yīng)用[J]. 劉福平,白俊杰. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2008(04)
博士論文
[1]仿刺參(Apostichopus japonicus)分子標(biāo)記開發(fā)及應(yīng)用[D]. 鄢婧婧.中國海洋大學(xué) 2013
碩士論文
[1]威海仿刺參野生種群遺傳多樣性分析[D]. 陶翠花.山東大學(xué) 2009
本文編號:3475297
【文章來源】:大連海洋大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:59 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
普通方法提取刺參DNA1%瓊脂糖電泳圖(M=DL2000)
改進方法提取刺參DNA1%瓊脂糖電泳圖(M=DL2000)
退火溫度60℃全部引物同一基因組PCR檢測電泳圖
【參考文獻】:
期刊論文
[1]利用DNA條形碼技術(shù)鑒定一批鱷魚產(chǎn)品[J]. 郭鳳娟,陽建春,胡詩佳,李詠施. 生物技術(shù)通報. 2013(08)
[2]基于COI基因序列的太湖新銀魚遺傳多樣性[J]. 張迪,雷光春,龔成,王忠鎖. 湖泊科學(xué). 2012(02)
[3]亞洲黑熊COI序列變異及其DNA條碼的應(yīng)用[J]. 魯再豐,蔣國紅,白素英. 東北林業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2010(10)
[4]福建近海藍(lán)圓鲹種群遺傳多樣性的AFLP分析[J]. 張麗艷,蘇永全,丁少雄,牛素芳,劉東騰,王軍. 水產(chǎn)學(xué)報. 2010(05)
[5]基于線粒體CO1基因的DNA條形碼在石首魚科(Sciaenidae)魚類系統(tǒng)分類中的應(yīng)用[J]. 柳淑芳,陳亮亮,戴芳群,莊志猛. 海洋與湖沼. 2010(02)
[6]舟山鮸魚群體遺傳多樣性的AFLP研究[J]. 彭志蘭,柳敏海,傅榮兵,羅海忠,夏楓峰,徐志進. 上海海洋大學(xué)學(xué)報. 2010(02)
[7]中國東海日本鰻鱺種群遺傳結(jié)構(gòu)的AFLP分析[J]. 張辛,許璞,許廣平,劉培庭,仲霞銘,李旭光,徐健榮,丁亞平,許曉風(fēng). 水生態(tài)學(xué)雜志. 2010(01)
[8]三種蟶的遺傳多樣性分析[J]. 邵艷卿,陸榮茂,董迎輝,柴雪良,肖國強,林志華. 海洋科學(xué). 2009(10)
[9]4種海參16S rRNA和COI基因片段序列比較及系統(tǒng)學(xué)研究[J]. 陳麗梅,李琪,李赟. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2008(06)
[10]單核苷酸多態(tài)性及其在水產(chǎn)動物遺傳育種中的應(yīng)用[J]. 劉福平,白俊杰. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2008(04)
博士論文
[1]仿刺參(Apostichopus japonicus)分子標(biāo)記開發(fā)及應(yīng)用[D]. 鄢婧婧.中國海洋大學(xué) 2013
碩士論文
[1]威海仿刺參野生種群遺傳多樣性分析[D]. 陶翠花.山東大學(xué) 2009
本文編號:3475297
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