動物的先天免疫中TLR（Toll-like receptor）信號通路在機體中起著舉足輕重的作用。文昌魚因擁有繁瑣有序的先天免疫系統(tǒng),同時兼有特異性免疫的雛形,逐漸成為研究動物免疫系統(tǒng)的模型。Micro RNA（mi RNA）是生物體內的一類具有調控功能的非編碼小RNA,已有的報道顯示mi R-92家族的多個成員均參與免疫調節(jié)。白氏文昌魚mi RNA的研究主要尚處于通過高通量測序的方法篩選免疫相關的mi RNA階段,亟待深入開展功能研究。結合文昌魚特殊的進化地位,本論文圍繞mi R-92家族參與文昌魚TLR通路先天免疫調控開展研究,并進一步對mi R-92家族的進化進行分析,獲得了以下的結果:1.本研究對mi R-92家族的系統(tǒng)進化進行了分析,以白氏文昌魚的mi R-92家族為例,預測可能編碼的前體mi RNA莖環(huán)結構的穩(wěn)定性。對不同物種mi R-92家族序列比對發(fā)現(xiàn),mi R-92a和mi R-92b在大部分物種中存在。海膽中存在的該家族成員最多,文昌魚的bbe-mi R-92b與其它物種的保守性相比較要高于bbe-mi R-92b與物種內其他成員（bbe-mi R-92a、bbe-... 

【文章來源】：南京師范大學江蘇省 211工程院校

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【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

白氏文昌魚拍攝于實驗室Fig1.1Branchiostomabelcheriphotographedinthelaboratory

第一章緒論7等）和轉錄因子（如AP-1、NF-κB等）。TLR通路通過級聯(lián)反應激活轉錄因子最終促進下游細胞因子的表達，進而參與機體抵御病原體的免疫反應[40,41]。圖1.3人類TLR信號通路的示意圖Fig1.3SchematicdiagramofthehumanTLRsignalingpathway[42]1.5.2IKK基因的功能作用機制IKK（InhibitorOfNuclearFactorKappa-BKinase）是經典免疫調控通路TLR通路里的關鍵基因。轉錄因子NF-κB通常由促炎信號因子激活來調節(jié)體內的炎癥反應。NF-κB未被激活前，穩(wěn)定的存在于細胞質中與I-κB形成復合物；當細胞受到刺激時，I-κB會被IKK復合物磷酸化而降解，從而暴露出NF-κB的核定位序列，進而進入細胞核內行使轉錄因子的調控作用。IKK復合物包含多個亞基，主要作用是使I-κB磷酸化，IKKα和IKKβ是兩個序列高度相似的蛋白激酶，是NF-κB激活的大多數(shù)信號通路的匯聚點[43]。細胞內大部分IKKα和IKKβ分子都是IKK復合物的一部分，IKK復合物還包含一個名為IKKγ或NEMO（NF-κBessentialmodulator）的調節(jié)亞基。盡管有廣泛的序列相似性，IKKα和IKKβ由于其不同的底物特性和調控模式，在很大程度上具有不同的功能。IKKβ(和IKKγ)是通過觸發(fā)促炎反應(如TNFα或脂多糖(LPS))來快速激活NF-κB的關鍵。相比之下，IKKα在TNF家族成員的亞群中激活特定形式的NF-κB，也可能減弱IKKβ

第二章miR-92家族的生物信息學分析13圖2.1白氏文昌魚miR-92家族二級結構預測圖Fig.2.1SecondarystructurepredictionofmiR-92familyinamphioxus.2.2.2miR-92家族在不同物種的分布基于物種的進化地位，選擇了包括白氏文昌魚（Branchiostomabelcheri）、斑馬魚（Daniorerio）、牛（Bostaurus）、大鼠（Rattusnorvegicus）、人（Homosapiens）、非洲爪蟾蜍（Xenopuslaevis）、佛羅里達文昌魚（Branchiostomafloridae）、海七鰓鰻（Petromyzonmarinus）、玻璃海鞘（Cionaintestinalis）、豬（Susscrofa）、家犬（Canisfamiliaris）、馬（Equuscaballus）和紫海膽（Strongylocentrotuspurpuratus）在內的13個物種（圖2.2），對各物種中miR-92家族成員的分布情況進行了分析，結果如圖2.3所示，發(fā)現(xiàn)miR-92家族成員在從棘皮動物到脊椎動物miR-92a中均有分布，其中miR-92a和miR-92b在除了七鰓鰻外的所有物種中均有分布；而miR-92c、miR-92d和miR-92e則只分布在無脊椎動物中，其中miR-92c存在于海膽、文昌魚及海鞘中，而miR-92d和miR-92e僅在海膽和海鞘中存在。

【參考文獻】：
期刊論文
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