南海短尾大眼鯛(Priacanthus macracanthus)種群判別分析
發(fā)布時(shí)間:2021-10-16 04:37
魚(yú)類種群是魚(yú)類分類學(xué)的基本單位,魚(yú)類資源變動(dòng)研究也是以種群為單位,是魚(yú)類生物學(xué)研究的基礎(chǔ)。近年來(lái),由于全球漁業(yè)捕撈能力過(guò)剩,海洋生態(tài)破壞和環(huán)境污染,很多魚(yú)類都面臨資源威脅,作為南海重要經(jīng)濟(jì)魚(yú)種之一的短尾大眼鯛的資源量也正在下降,迫切需要加強(qiáng)資源的合理開(kāi)發(fā)和與國(guó)內(nèi)外的共同管理。本文以南海短尾大眼鯛(Priacanthus macracanthus)為研究對(duì)象,利用線粒體DNA序列分析方法判別南海北部和南部不同地理位點(diǎn)的短尾大眼鯛群體歸屬,為保護(hù)南海短尾大眼鯛資源及今后周邊各國(guó)的共同開(kāi)發(fā)和捕撈配額管理提供基本依據(jù)。主要研究?jī)?nèi)容如下:1.利用在南海北部陸架和南沙西南陸架采集的224尾短尾大眼鯛樣品,采用線粒體控制區(qū)(mt DNA D-loop區(qū))序列對(duì)其進(jìn)行種群遺傳結(jié)構(gòu)分析,并探討6個(gè)采樣位點(diǎn)之間短尾大眼鯛種群歸屬關(guān)系。所得224條同源序列D-loop片段(729 bp)中堿基A、C、T、G的含量分別是31.8%、19.1%、34.1%和15.0%,A+T含量為65.9%,C+G含量為34.1%,顯示明顯的AT偏好和反G偏倚。檢測(cè)到了101個(gè)突變位點(diǎn)和94個(gè)核苷酸多態(tài)位點(diǎn),定義了172種單倍...
【文章來(lái)源】:上海海洋大學(xué)上海市
【文章頁(yè)數(shù)】:54 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
短尾大眼鯛PriacanthusmacracanthusFig.1-1Priacanthusmacracanthus
14圖 2-1 短尾大眼鯛標(biāo)本采集地點(diǎn)圖Fig.2-1 Map showing sample localities for Priacanthus macracanth2.1.2 DNA 提取與檢測(cè)每個(gè)樣品取背部肌肉 25 mg 左右,置于 1.5 mL 離心管內(nèi),使用工程股份有限公司的海洋動(dòng)物組織 DNA 提取試劑盒提取總基因組 D驟如下:1.稱取肌肉樣品約 25mg 加入離心管中,加 200 μL GA 緩沖液,液呈渾濁,目測(cè)無(wú)成塊肌肉組織;2.加入 20 μL 蛋白酶 K,渦旋混勻,簡(jiǎn)短離心后置于 55℃恒溫水
Network 軟件分析構(gòu)建的南海海域短尾大眼鯛群體的單倍型網(wǎng)絡(luò)(MJ)圖(圖 3)與其 NJ 系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)揭示了相似的結(jié)果,譜系發(fā)現(xiàn)大量的單倍型顯示為明顯的星狀分布, Hap 10、Hap 29、Hap 39 是高頻分布的優(yōu)勢(shì)單倍型。特有單倍型分散地分布在網(wǎng)絡(luò)圖中,未形成特有的進(jìn)化枝。6 個(gè)短尾大眼鯛群體沒(méi)有表現(xiàn)出明顯的地理分布特征。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于mtDNA COⅠ和Cytb基因序列對(duì)南中國(guó)海不同海域波紋唇魚(yú)群體遺傳多樣性的研究[J]. 胡靜,侯新遠(yuǎn),尹紹武,祝斐,賈一何,王小軍. 水生生物學(xué)報(bào). 2014(06)
[2]內(nèi)蒙古達(dá)里湖及崗更湖東北雅羅魚(yú)D-loop基因序列及多樣性研究[J]. 羅旭光,齊景偉,安曉萍,烏蘭,姚珺,李蓓. 南方水產(chǎn)科學(xué). 2014(02)
[3]基于線粒體Cyt b基因的黃鰭?cǎi)R面鲀種群分析[J]. 李玉芳,李永振,陳國(guó)寶,孫典榮,于杰,崔科. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2014(01)
[4]基于線粒體控制區(qū)全序列的鄱陽(yáng)湖水系鰱增殖放流群體與野生群體的遺傳多樣性分析[J]. 陳文靜,張燕萍,段辛斌,徐先棟,汪澄強(qiáng). 中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2013(35)
[5]長(zhǎng)吻養(yǎng)殖群體與野生群體遺傳多樣性分析[J]. 肖明松,崔峰,康健,馬玉涵. 水生生物學(xué)報(bào). 2013(01)
[6]二長(zhǎng)棘犁齒鯛線粒體DNA控制區(qū)結(jié)構(gòu)和進(jìn)化[J]. 蘇天鳳,江世貴,馬之明,李夏. 南方水產(chǎn)科學(xué). 2012(06)
[7]福建近海藍(lán)圓鲹群體遺傳結(jié)構(gòu)分析[J]. 牛素芳,蘇永全,王軍,張麗艷. 廈門大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2012(04)
[8]基于COI部分序列探討南海鯧屬魚(yú)類系統(tǒng)進(jìn)化與種群遺傳結(jié)構(gòu)[J]. 孫鵬,尹飛,施兆鴻,彭士明. 海洋科學(xué). 2012(06)
[9]南海金線魚(yú)屬Nemipterus魚(yú)類COⅠ和Cytb基因片段的比較分析[J]. 董麗娜,黃梓榮,李永振,陳國(guó)寶. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2012(02)
[10]北部灣3種金線魚(yú)屬魚(yú)類COI基因序列的比較分析[J]. 董麗娜,黃梓榮,艾紅,盧偉華,李希國(guó),李娜娜,李夏,李永振. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2011(03)
碩士論文
[1]南海黃鰭?cǎi)R面鲀(Thamnaconus hypargyreus)種群分析[D]. 李玉芳.上海海洋大學(xué) 2014
[2]太平洋中部黃鰭金槍魚(yú)種群遺傳多樣性研究[D]. 李偉文.上海海洋大學(xué) 2014
[3]棘頭梅童魚(yú)的遺傳多樣性與種群遺傳結(jié)構(gòu)研究[D]. 殷麗娜.中國(guó)海洋大學(xué) 2013
[4]中國(guó)野生烏鱧(Channa argus)遺傳多樣性分析[D]. 高志遠(yuǎn).暨南大學(xué) 2013
[5]南海北部陸架區(qū)金線魚(yú)(Nemipterus virgatus)種群分子分析[D]. 董麗娜.上海海洋大學(xué) 2011
本文編號(hào):3439161
【文章來(lái)源】:上海海洋大學(xué)上海市
【文章頁(yè)數(shù)】:54 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
短尾大眼鯛PriacanthusmacracanthusFig.1-1Priacanthusmacracanthus
14圖 2-1 短尾大眼鯛標(biāo)本采集地點(diǎn)圖Fig.2-1 Map showing sample localities for Priacanthus macracanth2.1.2 DNA 提取與檢測(cè)每個(gè)樣品取背部肌肉 25 mg 左右,置于 1.5 mL 離心管內(nèi),使用工程股份有限公司的海洋動(dòng)物組織 DNA 提取試劑盒提取總基因組 D驟如下:1.稱取肌肉樣品約 25mg 加入離心管中,加 200 μL GA 緩沖液,液呈渾濁,目測(cè)無(wú)成塊肌肉組織;2.加入 20 μL 蛋白酶 K,渦旋混勻,簡(jiǎn)短離心后置于 55℃恒溫水
Network 軟件分析構(gòu)建的南海海域短尾大眼鯛群體的單倍型網(wǎng)絡(luò)(MJ)圖(圖 3)與其 NJ 系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)揭示了相似的結(jié)果,譜系發(fā)現(xiàn)大量的單倍型顯示為明顯的星狀分布, Hap 10、Hap 29、Hap 39 是高頻分布的優(yōu)勢(shì)單倍型。特有單倍型分散地分布在網(wǎng)絡(luò)圖中,未形成特有的進(jìn)化枝。6 個(gè)短尾大眼鯛群體沒(méi)有表現(xiàn)出明顯的地理分布特征。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于mtDNA COⅠ和Cytb基因序列對(duì)南中國(guó)海不同海域波紋唇魚(yú)群體遺傳多樣性的研究[J]. 胡靜,侯新遠(yuǎn),尹紹武,祝斐,賈一何,王小軍. 水生生物學(xué)報(bào). 2014(06)
[2]內(nèi)蒙古達(dá)里湖及崗更湖東北雅羅魚(yú)D-loop基因序列及多樣性研究[J]. 羅旭光,齊景偉,安曉萍,烏蘭,姚珺,李蓓. 南方水產(chǎn)科學(xué). 2014(02)
[3]基于線粒體Cyt b基因的黃鰭?cǎi)R面鲀種群分析[J]. 李玉芳,李永振,陳國(guó)寶,孫典榮,于杰,崔科. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2014(01)
[4]基于線粒體控制區(qū)全序列的鄱陽(yáng)湖水系鰱增殖放流群體與野生群體的遺傳多樣性分析[J]. 陳文靜,張燕萍,段辛斌,徐先棟,汪澄強(qiáng). 中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2013(35)
[5]長(zhǎng)吻養(yǎng)殖群體與野生群體遺傳多樣性分析[J]. 肖明松,崔峰,康健,馬玉涵. 水生生物學(xué)報(bào). 2013(01)
[6]二長(zhǎng)棘犁齒鯛線粒體DNA控制區(qū)結(jié)構(gòu)和進(jìn)化[J]. 蘇天鳳,江世貴,馬之明,李夏. 南方水產(chǎn)科學(xué). 2012(06)
[7]福建近海藍(lán)圓鲹群體遺傳結(jié)構(gòu)分析[J]. 牛素芳,蘇永全,王軍,張麗艷. 廈門大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2012(04)
[8]基于COI部分序列探討南海鯧屬魚(yú)類系統(tǒng)進(jìn)化與種群遺傳結(jié)構(gòu)[J]. 孫鵬,尹飛,施兆鴻,彭士明. 海洋科學(xué). 2012(06)
[9]南海金線魚(yú)屬Nemipterus魚(yú)類COⅠ和Cytb基因片段的比較分析[J]. 董麗娜,黃梓榮,李永振,陳國(guó)寶. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2012(02)
[10]北部灣3種金線魚(yú)屬魚(yú)類COI基因序列的比較分析[J]. 董麗娜,黃梓榮,艾紅,盧偉華,李希國(guó),李娜娜,李夏,李永振. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2011(03)
碩士論文
[1]南海黃鰭?cǎi)R面鲀(Thamnaconus hypargyreus)種群分析[D]. 李玉芳.上海海洋大學(xué) 2014
[2]太平洋中部黃鰭金槍魚(yú)種群遺傳多樣性研究[D]. 李偉文.上海海洋大學(xué) 2014
[3]棘頭梅童魚(yú)的遺傳多樣性與種群遺傳結(jié)構(gòu)研究[D]. 殷麗娜.中國(guó)海洋大學(xué) 2013
[4]中國(guó)野生烏鱧(Channa argus)遺傳多樣性分析[D]. 高志遠(yuǎn).暨南大學(xué) 2013
[5]南海北部陸架區(qū)金線魚(yú)(Nemipterus virgatus)種群分子分析[D]. 董麗娜.上海海洋大學(xué) 2011
本文編號(hào):3439161
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