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基于SSR的中華鱘親子鑒定和遺傳特性研究

發(fā)布時(shí)間:2021-09-05 20:54
  中華鱘(Acipenser sinensis)為典型的大型溯河產(chǎn)卵洄游性魚(yú)類(lèi),是我國(guó)國(guó)家一級(jí)重點(diǎn)保護(hù)野生動(dòng)物。建立中華鱘人工養(yǎng)殖群體,實(shí)現(xiàn)全人工繁殖是人工保存中華鱘物種、實(shí)施遷地保護(hù)不可或缺的途徑。盡管中華鱘已具有一定的養(yǎng)殖規(guī)模并且人工繁殖已獲得成功,然而在中華鱘資源管理和種群保護(hù)中,種群遺傳多樣性、遺傳結(jié)構(gòu)以及系譜關(guān)系等遺傳學(xué)研究一直未受到足夠的重視,人工養(yǎng)殖的中華鱘遺傳管理方面還相當(dāng)薄弱。本項(xiàng)目將以中華鱘為研究對(duì)象,篩選適用種群遺傳研究的微衛(wèi)星分子標(biāo)記;通過(guò)微衛(wèi)星標(biāo)記的進(jìn)一步篩選建立了親子鑒定體系,為研究中華鱘養(yǎng)殖群體的系譜結(jié)構(gòu)奠定基礎(chǔ);通過(guò)分析中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院長(zhǎng)江水產(chǎn)研究所荊州太湖中華鱘試驗(yàn)場(chǎng)(TH)、湖北恒升中華鱘馴養(yǎng)繁殖試驗(yàn)場(chǎng)(HS)和荊州鳳凰山中華鱘養(yǎng)殖場(chǎng)(FHS)3個(gè)中華鱘養(yǎng)殖群體的遺傳結(jié)構(gòu),評(píng)價(jià)中華鱘人工養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性水平,為中華鱘科學(xué)有效的人工保護(hù)提供理論基礎(chǔ)。本研究將為中華鱘人工養(yǎng)殖群體的譜系建立和種群遺傳管理策略的制定提供理論依據(jù),也為其它鱘魚(yú)的親子鑒定及遺傳結(jié)構(gòu)分析給予借鑒。主要研究結(jié)果如下:(1)通過(guò)性腺轉(zhuǎn)錄組Illumina測(cè)序獲得2838個(gè)含有微衛(wèi)... 

【文章來(lái)源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:83 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

基于SSR的中華鱘親子鑒定和遺傳特性研究


圖2.1中華i尋基因組DNA瓊脂糖凝膠電泳圖譜??M:?DL2000?bp?DNA?Maker;?1-4:不同中華If?個(gè)體?DNA??

微衛(wèi)星標(biāo)記,圖譜,微衛(wèi)星引物,多態(tài)性


tctctccagtgcccgctctgtcccaggacaatcacactggagtcgttcgctcggagaacgtgcacgctcacgatcctcaccga??ccggaactgggcctcgcggtagaagtcatcgtggactctcctgccgacccggatctgcactgcttggttccgctg??圖2.2典型微衛(wèi)星序列??Fig.2.2?Ahpical?inicrosatellile?sequences??2.3.3多態(tài)微衛(wèi)星引物蹄選及微衛(wèi)星標(biāo)記特征??隨機(jī)挑選湖北省宜昌市5個(gè)野生巾華鮮基因組DNA作為模板,用設(shè)計(jì)的165??對(duì)微衛(wèi)星引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,驗(yàn)證微衛(wèi)星引物的多態(tài)性。PCR產(chǎn)物經(jīng)12%非變性??聚丙稀酰胺凝膠電泳和銀染法染色后,結(jié)果顯示有24個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)擴(kuò)增條帶清晰??且具有明顯多態(tài)性,擴(kuò)增條帶大小與預(yù)期結(jié)果一致。為進(jìn)一步確定蹄選的微衛(wèi)星??引物的穩(wěn)定性及各微衛(wèi)星標(biāo)記的特征,將初步蹄選的微衛(wèi)星引物在24個(gè)野生中華??鍀個(gè)體基因組中進(jìn)行PCR擴(kuò)增,經(jīng)聚丙烯酰胺凝膠電泳儀進(jìn)行多態(tài)性蹄選。實(shí)驗(yàn)??結(jié)果得

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]江蘇8個(gè)克氏原螯蝦群體遺傳多樣性微衛(wèi)星分析[J]. 邢智珺,姜虎成,陸偉,錢(qián)照君,于宏偉,李家樂(lè).  上海海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2014(05)
[2]厚頜魴兩個(gè)野生群體遺傳多樣性分析[J]. 王瑾瑾,童金茍,張耀光,彭作剛.  水生生物學(xué)報(bào). 2014(05)
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[4]基于微衛(wèi)星標(biāo)記對(duì)長(zhǎng)江中上游胭脂魚(yú)增殖放流效果的評(píng)估[J]. 成為為,汪登強(qiáng),危起偉,王成友,杜浩,吳金明,李雷.  中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2014(03)
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博士論文
[1]鹽度對(duì)中華鱘生長(zhǎng)的影響機(jī)制及中華鱘的等滲點(diǎn)分析[D]. 李偉.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014

碩士論文
[1]達(dá)氏鱘微衛(wèi)星分離及其親子鑒定研究[D]. 駱慧.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[2]基于微衛(wèi)星標(biāo)記和線(xiàn)粒體cytb基因序列的鲇遺傳多樣性研究[D]. 徐丹丹.西南大學(xué) 2013
[3]5個(gè)鯽魚(yú)群體遺傳多樣性的微衛(wèi)星研究[D]. 孫建幫.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006



本文編號(hào):3386071

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