為探究牛磺酸對(duì)紅鰭東方鲀的熱應(yīng)激調(diào)控的影響,以初始體重為（32.28±0.20）g的紅鰭東方鲀（Takifugurubripes）作為研究對(duì)象,實(shí)驗(yàn)隨機(jī)分為3組,每組設(shè)置3個(gè)重復(fù),通過(guò)在低魚(yú)粉飼料中分別添加3個(gè)水平的�；撬醄0%（T1,對(duì)照）、1.0%（T2）和5.0%（T3）],配制3組實(shí)驗(yàn)飼料。養(yǎng)殖56 d后,水溫（28±0.3）℃,急性熱應(yīng)激30 min,取肝臟。使用RNA-Seq測(cè)序技術(shù)對(duì)3組紅鰭東方鲀肝臟轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行分析,并分別對(duì)3個(gè)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序文庫(kù)進(jìn)行兩兩比較,設(shè)置顯著差異基因篩選條件為P<0.05,共獲得167個(gè)差異表達(dá)基因,其中上調(diào)基因111個(gè),下調(diào)基因56個(gè)。GO功能分析發(fā)現(xiàn),在T3vs T1組中,差異表達(dá)基因（DEGs）顯著富集在蛋白質(zhì)分解過(guò)程、絲氨酸型內(nèi)肽酶活性、絲氨酸型肽酶活性、絲氨酸水解酶活性、內(nèi)肽酶活性、L-氨基酸肽的肽酶活性和肽酶活性。KEGG富集分析發(fā)現(xiàn),T2vs T1組中,這些DEGs主要參與細(xì)胞黏附分子、神經(jīng)活性配體-受體相互作用通路;而T3vs T1組中,這些DEGs主要參與神經(jīng)活性配體受體相互作用和代謝途徑。選取3個(gè)顯著差異表達(dá)基因進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光... 

【文章來(lái)源】：中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2020,27(10)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：11 頁(yè)

【部分圖文】：

RT-q PCR與RNA-seq檢測(cè)基因差異倍數(shù)比較圖

如圖1所示,在急性熱應(yīng)激后,T2 vs T1組共得到13個(gè)差異表達(dá)基因,其中包括11個(gè)上調(diào)表達(dá)基因,2個(gè)下調(diào)表達(dá)基因;T3 vs T1組共得到154個(gè)差異表達(dá)基因,其中包括100個(gè)上調(diào)表達(dá)基因,54個(gè)下調(diào)表達(dá)基因。對(duì)所有基因進(jìn)行FPKM層次聚類(lèi)分析,得到結(jié)果如圖2所示。以log2(ratios)值進(jìn)行聚類(lèi),圖中紅色代表基因高表達(dá),藍(lán)色代表基因低表達(dá),從紅到藍(lán)表明log2(ratios)值從大到小,即基因表達(dá)量從高到低。圖2 差異表達(dá)基因聚類(lèi)圖

差異表達(dá)基因聚類(lèi)圖

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]飼料中添加牛磺酸對(duì)不同養(yǎng)殖密度下青魚(yú)幼魚(yú)生長(zhǎng)、免疫及抗脅迫能力的影響[J]. 石勇,胡毅,田芊芊,劉艷莉,鐘蕾,謝駿,周建成.  動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)學(xué)報(bào). 2019(09)
[2]紅白錦鯉皮膚轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析[J]. 史東杰,胡金有,王賽賽,朱華,張欣,朱莉飛,孫硯勝.  大連海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2019(04)
[3]魚(yú)類(lèi)的熱應(yīng)激損傷與消化道免疫研究[J]. 馬志洲,姜志勇,董宏標(biāo),高煥云.  海洋與漁業(yè). 2019(07)
[4]ERR-dsRNA對(duì)羅氏沼蝦卵巢中ERR及生殖相關(guān)基因表達(dá)的影響[J]. 劉金磊,鄧思平,江東能,陳華譜,李廣麗,吳天利,田昌緒,朱春華.  廣東海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2018(03)
[5]低魚(yú)粉飼料中添加�；撬釋�(duì)青魚(yú)幼魚(yú)生長(zhǎng)、腸道修復(fù)及抗急性擁擠脅迫的影響[J]. 田芊芊,胡毅,毛盼,謝俊,方波,彭慧珍.  水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2016(09)
[6]魚(yú)類(lèi)應(yīng)激生物學(xué)研究進(jìn)展[J]. 孔淑碧,江德中,祖學(xué)勤,靳濤.  現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2015(16)
[7]轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)在水產(chǎn)動(dòng)物研究中的運(yùn)用[J]. 羅輝,葉華,肖世俊,鄭曙明,王曉清,王志勇.  水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2015(04)
[8]淺水應(yīng)激后黃斑藍(lán)子魚(yú)生理指標(biāo)變化及牛磺酸的抗應(yīng)激作用[J]. 盧玉標(biāo),游翠紅,王樹(shù)啟,李遠(yuǎn)友.  水生生物學(xué)報(bào). 2014(01)
[9]�；撬嵩隰~(yú)類(lèi)營(yíng)養(yǎng)中的作用及其在魚(yú)類(lèi)飼料中的應(yīng)用[J]. 王和偉,葉繼丹,陳建春.  動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)學(xué)報(bào). 2013(07)
[10]�；撬嵩隰~(yú)類(lèi)營(yíng)養(yǎng)上的研究進(jìn)展[J]. 董曉慶,張東鳴,葛晨霞.  中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2012(06)

博士論文
[1]暗紋東方鲀（Takifugu fasciatus）應(yīng)對(duì)低溫脅迫的生理響應(yīng)和分子機(jī)制研究[D]. 文鑫.南京師范大學(xué) 2019
[2]饑餓提高斑馬魚(yú)（Danio rerio）冷應(yīng)激耐受的機(jī)制探究[D]. 魯棟梁.華東師范大學(xué) 2019
[3]基于RNA-seq的熱應(yīng)激條件下虹鱒肝臟和頭腎轉(zhuǎn)錄組分析[D]. 李永娟.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[4]暗紋東方鲀耐受鹽度能力的環(huán)境因子效應(yīng)及其在轉(zhuǎn)錄組學(xué)水平上的差異[D]. 王駿.南京師范大學(xué) 2018

碩士論文
[1]大菱鲆熱脅迫相關(guān)功能基因分析及耐高溫性狀QTL區(qū)間內(nèi)共享標(biāo)記篩選[D]. 楊凱.上海海洋大學(xué) 2019
[2]花斑裸鯉低氧脅迫轉(zhuǎn)錄組學(xué)及其主要差異基因表達(dá)調(diào)控研究[D]. 趙永麗.青海大學(xué) 2018
[3]基于轉(zhuǎn)錄組技術(shù)揭示紅鰭東方鲀的滲透壓調(diào)節(jié)機(jī)制[D]. 孫夢(mèng)蕾.大連海洋大學(xué) 2017
[4]大黃魚(yú)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析及密集脅迫前后皮膚轉(zhuǎn)錄組變化[D]. 韓兆方.集美大學(xué) 2016



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