溶藻弧菌屬于革蘭氏陰性菌,是一種海生生物重要的條件性致病菌,并且往往與許多包括魚類、蝦類、珊瑚類和甲殼類等在內(nèi)的海水養(yǎng)殖動物流行性病害有關(guān)。溶藻弧菌也是一種人類的致病性細菌,尤其容易通過海產(chǎn)品的感染導致耳炎和傷口感染。在近些年,溶藻弧菌由于引起水產(chǎn)養(yǎng)殖魚類發(fā)病并且造成了重大的經(jīng)濟損失而受到廣泛的研究。細菌對魚類組織表面的粘附是細菌感染致病初始階段的重要步驟。腸和受傷的表皮是弧菌入侵魚體的重要門戶。由于魚體表面布滿了粘液且細菌對粘液的粘附作用是多種致病菌感染的先決條件,因此,細菌的粘附能力是一種重要的毒力因子。細菌對宿主的粘附能力受到細菌本身、粘附底物和環(huán)境因子等諸多的影響。細菌的粘附受到多種基因的調(diào)控。盡管已經(jīng)證實一些基因與細菌粘附有關(guān),但是這種針對粘附的調(diào)控機制仍未可知。雖然最近已經(jīng)獲得了溶藻弧菌全基因組,但是其轉(zhuǎn)錄組情況仍未可知。本研究通過在脅迫條件下長期培養(yǎng)溶藻弧菌并測定其粘附能力,對獲得的粘附弱化菌株進行轉(zhuǎn)錄測序和分析,以期望能夠更好地理解溶藻弧菌粘附的基因調(diào)控機制。通過利用影響粘附能力的理化因子對溶藻弧菌進行脅迫誘導和粘附篩選,我們獲得了三種重金屬和一種低pH誘導下的粘附顯著... 

【文章來源】：集美大學福建省

【文章頁數(shù)】：55 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
abstract
第1章 引言
    1.1 轉(zhuǎn)錄組測序的發(fā)展與應(yīng)用
        1.1.1 轉(zhuǎn)錄組與轉(zhuǎn)錄組學
        1.1.2 測序技術(shù)的發(fā)展
        1.1.3 轉(zhuǎn)錄組測序的應(yīng)用
    1.2 溶藻弧菌粘附作用相關(guān)研究現(xiàn)狀及分析
        1.2.1 溶藻弧菌的生物學特性和流行病學
        1.2.2 粘附研究進展
        1.2.3 細菌粘附研究方法
    1.3 本研究的目的與意義
    1.4 主要研究內(nèi)容
第2章 脅迫培養(yǎng)條件下致病性溶藻弧菌粘附弱化菌株的篩選
    2.1 實驗材料與方法
        2.1.1 實驗用菌和魚
        2.1.2 主要試劑和儀器
    2.2 實驗方法與步驟
        2.2.1 大黃魚表皮粘液的制備和蛋白含量測定
        2.2.2 溶藻弧菌毒力檢測
        2.2.3 致病性溶藻弧菌脅迫培養(yǎng)處理
        2.2.4 溶藻弧菌對大黃魚粘液的粘附作用測定
        2.2.5 數(shù)據(jù)處理
    2.3 結(jié)果與分析
        2.3.1 粘液蛋白含量測定
        2.3.2 溶藻弧菌對大黃魚的半致死濃度LD50
        2.3.3 初次脅迫培養(yǎng)后溶藻弧菌對大黃魚粘液粘附作用的影響
        2.3.4 二次和三次脅迫培養(yǎng)后溶藻弧菌對大黃魚粘液粘附作用的影響
    2.4 討論
第3章 基于鏈特異性測序的溶藻弧菌粘附作用轉(zhuǎn)錄組學分析
    3.1 實驗材料
        3.1.1 測序菌株
        3.1.2 主要試劑和儀器
    3.2 實驗方法
        3.2.1 樣品準備與文庫構(gòu)建
        3.2.2 Illumina測序和數(shù)據(jù)處理
        3.2.3 功能注釋和DEGs的富集性分析
        3.2.4 實驗流程和信息分析流程圖
    3.3 結(jié)果與分析
        3.3.1 測序質(zhì)量評估
        3.3.2 Reads的比對參考和差異表達基因的統(tǒng)計檢驗
        3.3.3 差異基因的基因本體論（Gene ontology，GO）劃分
        3.3.4 差異基因的直系同源基因聚簇
        3.3.5 KEGG通路注釋
        3.3.6 ABC轉(zhuǎn)運子家族基因與粘附分析
    3.4 討論
第4章 結(jié)論與展望
    4.1 結(jié)論
    4.2 展望
致謝
參考文獻


【參考文獻】：
期刊論文
[1]重金屬脅迫對日本對蝦（Penaeus japonicas）胚胎發(fā)育的影響[J]. 姜會超,劉愛英,宋秀凱,孫國華,劉麗娟.  生態(tài)毒理學報. 2013(06)
[2]Disruption of chemotaxis-related genes affects multiple cellular processes and the virulence of pathogenic Vibrio harveyi[J]. QIN Yingxue,YAN Qingpi,SU Yongquan,LI Haiping,ZOU Wenzheng.  Acta Oceanologica Sinica. 2013(08)
[3]重金屬脅迫培養(yǎng)對2種細菌生長曲線的影響[J]. 李淑英,蘇亞麗,周元清,史云東,別金蓉.  安徽農(nóng)業(yè)科學. 2011(01)
[4]下一代測序技術(shù):技術(shù)回顧與展望[J]. 周曉光,任魯風,李運濤,張猛,俞育德,于軍.  中國科學:生命科學. 2010(01)
[5]環(huán)境因子對溶藻弧菌（Vibrio alginolyticus）粘附大黃魚（Pseudosciaena crocea）表皮粘液影響的研究[J]. 陳強,鄢慶枇,鄒文政,馬甡,莊峙廈,王小如.  海洋與湖沼. 2007(04)
[6]溶藻弧菌對大黃魚表皮黏液的黏附特性研究[J]. 鄢慶枇,陳強,馬甡,莊峙廈,王小如.  海洋學報(中文版). 2006(06)
[7]非編碼蛋白RNA的遺傳調(diào)控[J]. 齊力旺,Xinmin Li,張守攻,安道昌.  中國科學C輯:生命科學. 2006(03)
[8]焦磷酸測序技術(shù)及其應(yīng)用進展[J]. 倪紅兵,王惠民.  醫(yī)學檢驗與臨床. 2006(02)
[9]花鱸弧菌病病原菌(哈維氏弧菌)的分離與鑒定[J]. 王保坤,余俊紅,李筠,紀偉尚,徐懷恕.  中國水產(chǎn)科學. 2002(01)
[10]網(wǎng)箱養(yǎng)殖大黃魚弧菌病研究[J]. 鄢慶枇,王軍,蘇永全,張蕉南.  集美大學學報(自然科學版). 2001(03)

碩士論文
[1]擬南芥種子發(fā)育過程小RNA深度測序數(shù)據(jù)的分析[D]. 陳冬菊.福建農(nóng)林大學 2011



本文編號：3350276