大鱗副泥鰍MSTN和MyoD基因的cDNA克隆及地塞米松應(yīng)激對(duì)其表達(dá)的影響
發(fā)布時(shí)間:2021-08-08 19:58
肌肉生長(zhǎng)發(fā)育及分化有關(guān)的基因主要是作為負(fù)向調(diào)控因子的肌肉生長(zhǎng)抑制素基因(myostatin,MSTN)和作為正向調(diào)控因子的生肌調(diào)節(jié)因子(MRFs)。MSTN基因?qū)儆谵D(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子β(TGF—β)超家族,其功能是抑制成肌細(xì)胞的過(guò)度增殖,是肌肉發(fā)育的負(fù)調(diào)控基因;生肌調(diào)節(jié)因子家族主要包括Myf5,MyoD,MyoG和MRF4等4個(gè)家族成員,其中MyoD基因是脊椎動(dòng)物肌肉發(fā)育的主導(dǎo)調(diào)控基因之一,對(duì)骨骼肌的形成和分化起主要作用,缺失可導(dǎo)致成肌細(xì)胞的增殖和分化無(wú)法進(jìn)行。魚(yú)類應(yīng)激會(huì)影響肌肉生長(zhǎng),為了解應(yīng)激影響魚(yú)類生長(zhǎng)的機(jī)理,本文以大鱗副泥鰍為研究對(duì)象,分別克隆了大鱗副泥鰍的MSTN基因和MyoD基因的cDNA序列,并對(duì)其進(jìn)行序列分析;運(yùn)用實(shí)時(shí)熒光光定量PCR技術(shù)分析兩個(gè)基因的組織表達(dá)特異性;檢測(cè)地塞米松應(yīng)激處理后的肌肉組織中MSTN和MyoD基因表達(dá)的劑量和時(shí)間效應(yīng)。主要研究結(jié)果如下:(1)大鱗副泥鰍MSTN基因的cDNA序列長(zhǎng)度為1229bp(GeneBank序列號(hào):KY676785),編碼375個(gè)氨基酸,預(yù)測(cè)其蛋白質(zhì)分子量為42072.23Da,理論等電點(diǎn)pI=6.82,其氨基酸序列中存在9個(gè)保守...
【文章來(lái)源】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:62 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1-1:?MSTN前體蛋白的結(jié)構(gòu)模式圖(Jean-CharlesGabinard等,2013)??--
含有9個(gè)保守的半胱氨酸殘基來(lái)形成“半胱氨酸節(jié)點(diǎn)”結(jié)構(gòu),9個(gè)半胱氨酸之間可以??在分子內(nèi)和分子間形成二硫鍵,從而連接形成二聚體,“半胱氨酸節(jié)點(diǎn)”結(jié)構(gòu)在肌肉生??長(zhǎng)抑制素活性功能的形成方面發(fā)揮著重要的作用。MSTN前體蛋白的結(jié)構(gòu)如圖1-1所??示:??Prep?ro-Myosta?tin?RSRR??NH2|Sp|?Pro-peptide?domain?||?Mature?domain?ICOOH??圖1-1:?MSTN前體蛋白的結(jié)構(gòu)模式圖(Jean-CharlesGabinard等,2013)??Figl-1?:?Structural?pattern?of?MSTN?precursor?protein?(Jean-Charles?Gabillard?etc.,?2013)??由MSTN基因編碼合成的肌肉生長(zhǎng)抑制素前體蛋白是沒(méi)有生物活性的,它必須??經(jīng)過(guò)兩次蛋白酶水解剪切過(guò)程之后冰能形成具有生物活性的成熟MSTN蛋白[%。第??一次蛋白酶水解加工的位點(diǎn)在前肽區(qū)和信號(hào)肽之間,在細(xì)胞內(nèi)由MSTN基因編碼形??成的前體蛋白由于信號(hào)肽的作用會(huì)被轉(zhuǎn)膜分泌到細(xì)胞外,但是在轉(zhuǎn)膜分泌到細(xì)胞外之??前會(huì)發(fā)生第一次蛋白酶水解加工而把信號(hào)肽剪切掉。被剪切掉信號(hào)肽的MSTN前體??蛋白,在細(xì)胞外由于前肽區(qū)與成熟肽區(qū)有由4個(gè)氨基酸(RSRR)組成的蛋白酶加工??位點(diǎn)存在,會(huì)第二次被蛋白酶水解加工。MSTN前體蛋白經(jīng)過(guò)兩次蛋白酶水解加工后,??剩下氣基端的前肽(Latency?associated?peptide;?LAP)和竣基端由同源二聚體組成的??潛伏態(tài)成熟MSTN蛋白(Active?myostatin?dimer)
3.1總RNA質(zhì)量??本實(shí)驗(yàn)利用寶生物公司的RNAiso?Plus結(jié)合氯仿等試劑對(duì)大鱗副泥鰍肌肉組織進(jìn)??行總RNA提取。圖3-1表示瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)結(jié)果:能清晰地看見(jiàn)28S和18S兩??條帶,且28S條帶明顯比18S條帶亮,而5S條帶基本看不見(jiàn),說(shuō)明本次所提取的總??RNA的降解程度很低,完整性較好;利用核酸蛋白分析儀測(cè)定所提取的總RNA,結(jié)??果顯示其OD260/280平均值為2.07,說(shuō)明總RNA的純度較高。總的來(lái)說(shuō)大鱗副泥鰍??肌肉的總RNA純度高,完整性好,用來(lái)作為克。停樱裕位蚝停停铮幕驎r(shí)的反轉(zhuǎn)??錄模板具有較好的效果。??■一??_?18S??一??圖3-1大鱗副泥鰍肌肉組織總RNA?1.5%瓊脂糖凝膠電泳??Fig.3-1?The?total?RNA?electrophoresis?of?P.?dabryanus?in?1.5%?agarous??3.2大鱗副泥鰍MSTN和MyoD基因的cDNA序列??3.2.1?MSTN基因的cDNA序歹lj??本實(shí)驗(yàn)通過(guò)一對(duì)特異性引物PdMSTN-Fl和PdMSTN-Rl結(jié)合RT-PCR擴(kuò)增獲得??了一條700bp左右的核苷酸序列,將該序列在NCBI中進(jìn)行BLAST比對(duì)后發(fā)現(xiàn)它與??稀有鮑鯽的MSTN基因相似度高達(dá)91%,與斑馬魚(yú)的MSTN基因相似度也達(dá)到了?88%,??由此可以確認(rèn)此序列為大鱗副泥鰍MSTN基因的中間片段。由所獲得的中間片段的??核苷酸序列結(jié)合其他幾種鯉形目魚(yú)類MSTN基因的Y端和5'端的保守序列,設(shè)計(jì)兩??26??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]黃河裸裂尻魚(yú)肌肉生長(zhǎng)抑制素基因克隆及表達(dá)分析[J]. 晁燕,趙蘭英,李長(zhǎng)忠,謝保勝,申志新,王國(guó)杰,王振剛,李超,拜彬強(qiáng),張輝,祁得林. 動(dòng)物學(xué)研究. 2012(05)
[2]黃顙魚(yú)MyoD基因的克隆及其表達(dá)[J]. 梁宏偉,李忠,鄒桂偉,劉小林. 武漢大學(xué)學(xué)報(bào)(理學(xué)版). 2012(04)
[3]草魚(yú)兩個(gè)肌肉生長(zhǎng)抑制素cDNA克隆、表達(dá)及過(guò)量表達(dá)對(duì)胚胎發(fā)育的影響[J]. 濮劍威,孫成飛,蔣霞云,鄒曙明. 生物技術(shù)通報(bào). 2011(08)
[4]魚(yú)類應(yīng)激生物學(xué)研究與應(yīng)用[J]. 趙建華,楊德國(guó),陳建武,朱永久,李茜,馮憲斌,何勇鳳,吳興兵. 生命科學(xué). 2011(04)
[5]鳡肌肉生長(zhǎng)抑制素(MSTN)基因的克隆及其組織特異性表達(dá)分析[J]. 郁建鋒,張營(yíng),王星果,徐建榮,盧祥云,李建林,顧志良. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2010(10)
[6]奧利亞羅非魚(yú)、尼羅羅非魚(yú)MyoD1和MyoD2基因特征及差異[J]. 盧中華,俞菊華,李紅霞,李建林,唐永凱,阮瑞霞,楊光. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2010(05)
[7]蛋白質(zhì)磷酸化修飾的研究進(jìn)展[J]. 姜錚,王芳,何湘,劉大偉,陳宣男,趙紅慶,黃留玉,袁靜. 生物技術(shù)通訊. 2009(02)
[8]牙鲆肌肉生長(zhǎng)抑制素(MSTN)基因克隆[J]. 徐建勇,陳松林. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2008(04)
[9]眼斑擬石首魚(yú)肌肉生長(zhǎng)抑制素基因克隆及組織表達(dá)分析[J]. 薛良義,李婷,楊巧一,肖章奎. 海洋學(xué)報(bào)(中文版). 2008(03)
[10]擁擠脅迫對(duì)魚(yú)類影響研究進(jìn)展[J]. 于淼. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2008(03)
博士論文
[1]草魚(yú)MyoD基因cDNA克隆和表達(dá)研究[D]. 王立新.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2005
碩士論文
[1]斑鱖myostatin基因克隆及其表達(dá)分析[D]. 孫科軍.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[2]草魚(yú)肌肉生長(zhǎng)抑制素(MSTN)的cDNA克隆及地塞米松對(duì)其表達(dá)的影響[D]. 黃利.西南大學(xué) 2009
[3]豬Smad3、MyoD及GDF-8基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的研究[D]. 阮井玲.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[4]MyoD、MyoG基因的多態(tài)性及其與雞屠宰性狀和肉質(zhì)性狀的相關(guān)性研究[D]. 王瓊.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[5]MyoD和DGAT1基因?qū)εk伢w性狀影響的分析[D]. 田璐.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005
本文編號(hào):3330586
【文章來(lái)源】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:62 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1-1:?MSTN前體蛋白的結(jié)構(gòu)模式圖(Jean-CharlesGabinard等,2013)??--
含有9個(gè)保守的半胱氨酸殘基來(lái)形成“半胱氨酸節(jié)點(diǎn)”結(jié)構(gòu),9個(gè)半胱氨酸之間可以??在分子內(nèi)和分子間形成二硫鍵,從而連接形成二聚體,“半胱氨酸節(jié)點(diǎn)”結(jié)構(gòu)在肌肉生??長(zhǎng)抑制素活性功能的形成方面發(fā)揮著重要的作用。MSTN前體蛋白的結(jié)構(gòu)如圖1-1所??示:??Prep?ro-Myosta?tin?RSRR??NH2|Sp|?Pro-peptide?domain?||?Mature?domain?ICOOH??圖1-1:?MSTN前體蛋白的結(jié)構(gòu)模式圖(Jean-CharlesGabinard等,2013)??Figl-1?:?Structural?pattern?of?MSTN?precursor?protein?(Jean-Charles?Gabillard?etc.,?2013)??由MSTN基因編碼合成的肌肉生長(zhǎng)抑制素前體蛋白是沒(méi)有生物活性的,它必須??經(jīng)過(guò)兩次蛋白酶水解剪切過(guò)程之后冰能形成具有生物活性的成熟MSTN蛋白[%。第??一次蛋白酶水解加工的位點(diǎn)在前肽區(qū)和信號(hào)肽之間,在細(xì)胞內(nèi)由MSTN基因編碼形??成的前體蛋白由于信號(hào)肽的作用會(huì)被轉(zhuǎn)膜分泌到細(xì)胞外,但是在轉(zhuǎn)膜分泌到細(xì)胞外之??前會(huì)發(fā)生第一次蛋白酶水解加工而把信號(hào)肽剪切掉。被剪切掉信號(hào)肽的MSTN前體??蛋白,在細(xì)胞外由于前肽區(qū)與成熟肽區(qū)有由4個(gè)氨基酸(RSRR)組成的蛋白酶加工??位點(diǎn)存在,會(huì)第二次被蛋白酶水解加工。MSTN前體蛋白經(jīng)過(guò)兩次蛋白酶水解加工后,??剩下氣基端的前肽(Latency?associated?peptide;?LAP)和竣基端由同源二聚體組成的??潛伏態(tài)成熟MSTN蛋白(Active?myostatin?dimer)
3.1總RNA質(zhì)量??本實(shí)驗(yàn)利用寶生物公司的RNAiso?Plus結(jié)合氯仿等試劑對(duì)大鱗副泥鰍肌肉組織進(jìn)??行總RNA提取。圖3-1表示瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)結(jié)果:能清晰地看見(jiàn)28S和18S兩??條帶,且28S條帶明顯比18S條帶亮,而5S條帶基本看不見(jiàn),說(shuō)明本次所提取的總??RNA的降解程度很低,完整性較好;利用核酸蛋白分析儀測(cè)定所提取的總RNA,結(jié)??果顯示其OD260/280平均值為2.07,說(shuō)明總RNA的純度較高。總的來(lái)說(shuō)大鱗副泥鰍??肌肉的總RNA純度高,完整性好,用來(lái)作為克。停樱裕位蚝停停铮幕驎r(shí)的反轉(zhuǎn)??錄模板具有較好的效果。??■一??_?18S??一??圖3-1大鱗副泥鰍肌肉組織總RNA?1.5%瓊脂糖凝膠電泳??Fig.3-1?The?total?RNA?electrophoresis?of?P.?dabryanus?in?1.5%?agarous??3.2大鱗副泥鰍MSTN和MyoD基因的cDNA序列??3.2.1?MSTN基因的cDNA序歹lj??本實(shí)驗(yàn)通過(guò)一對(duì)特異性引物PdMSTN-Fl和PdMSTN-Rl結(jié)合RT-PCR擴(kuò)增獲得??了一條700bp左右的核苷酸序列,將該序列在NCBI中進(jìn)行BLAST比對(duì)后發(fā)現(xiàn)它與??稀有鮑鯽的MSTN基因相似度高達(dá)91%,與斑馬魚(yú)的MSTN基因相似度也達(dá)到了?88%,??由此可以確認(rèn)此序列為大鱗副泥鰍MSTN基因的中間片段。由所獲得的中間片段的??核苷酸序列結(jié)合其他幾種鯉形目魚(yú)類MSTN基因的Y端和5'端的保守序列,設(shè)計(jì)兩??26??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]黃河裸裂尻魚(yú)肌肉生長(zhǎng)抑制素基因克隆及表達(dá)分析[J]. 晁燕,趙蘭英,李長(zhǎng)忠,謝保勝,申志新,王國(guó)杰,王振剛,李超,拜彬強(qiáng),張輝,祁得林. 動(dòng)物學(xué)研究. 2012(05)
[2]黃顙魚(yú)MyoD基因的克隆及其表達(dá)[J]. 梁宏偉,李忠,鄒桂偉,劉小林. 武漢大學(xué)學(xué)報(bào)(理學(xué)版). 2012(04)
[3]草魚(yú)兩個(gè)肌肉生長(zhǎng)抑制素cDNA克隆、表達(dá)及過(guò)量表達(dá)對(duì)胚胎發(fā)育的影響[J]. 濮劍威,孫成飛,蔣霞云,鄒曙明. 生物技術(shù)通報(bào). 2011(08)
[4]魚(yú)類應(yīng)激生物學(xué)研究與應(yīng)用[J]. 趙建華,楊德國(guó),陳建武,朱永久,李茜,馮憲斌,何勇鳳,吳興兵. 生命科學(xué). 2011(04)
[5]鳡肌肉生長(zhǎng)抑制素(MSTN)基因的克隆及其組織特異性表達(dá)分析[J]. 郁建鋒,張營(yíng),王星果,徐建榮,盧祥云,李建林,顧志良. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2010(10)
[6]奧利亞羅非魚(yú)、尼羅羅非魚(yú)MyoD1和MyoD2基因特征及差異[J]. 盧中華,俞菊華,李紅霞,李建林,唐永凱,阮瑞霞,楊光. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2010(05)
[7]蛋白質(zhì)磷酸化修飾的研究進(jìn)展[J]. 姜錚,王芳,何湘,劉大偉,陳宣男,趙紅慶,黃留玉,袁靜. 生物技術(shù)通訊. 2009(02)
[8]牙鲆肌肉生長(zhǎng)抑制素(MSTN)基因克隆[J]. 徐建勇,陳松林. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2008(04)
[9]眼斑擬石首魚(yú)肌肉生長(zhǎng)抑制素基因克隆及組織表達(dá)分析[J]. 薛良義,李婷,楊巧一,肖章奎. 海洋學(xué)報(bào)(中文版). 2008(03)
[10]擁擠脅迫對(duì)魚(yú)類影響研究進(jìn)展[J]. 于淼. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2008(03)
博士論文
[1]草魚(yú)MyoD基因cDNA克隆和表達(dá)研究[D]. 王立新.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2005
碩士論文
[1]斑鱖myostatin基因克隆及其表達(dá)分析[D]. 孫科軍.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[2]草魚(yú)肌肉生長(zhǎng)抑制素(MSTN)的cDNA克隆及地塞米松對(duì)其表達(dá)的影響[D]. 黃利.西南大學(xué) 2009
[3]豬Smad3、MyoD及GDF-8基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的研究[D]. 阮井玲.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[4]MyoD、MyoG基因的多態(tài)性及其與雞屠宰性狀和肉質(zhì)性狀的相關(guān)性研究[D]. 王瓊.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[5]MyoD和DGAT1基因?qū)εk伢w性狀影響的分析[D]. 田璐.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005
本文編號(hào):3330586
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