通過(guò)對(duì)基因組、轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組的分析,顯示不同生物中存在數(shù)百至數(shù)千個(gè)翻譯但未注釋的短開(kāi)放閱讀框（sORF）或稱(chēng)小開(kāi)放閱讀框（smORF）。短開(kāi)放閱讀框（sORF）是指編碼少于100個(gè)密碼子多肽的核苷酸序列。研究發(fā)現(xiàn),許多sORF在機(jī)體的生命過(guò)程中發(fā)揮重要作用,例如生長(zhǎng)發(fā)育,細(xì)胞凋亡和先天免疫等。我們?cè)诓《敬碳さ娜毡灸覍?duì)蝦(Marsupenaeus japonicus蝦的血細(xì)胞和消化道等轉(zhuǎn)錄組中發(fā)現(xiàn)了多種不同的sORFs,通過(guò)對(duì)這些sORFs進(jìn)行的生物信息學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)有多種sORFs屬于核糖體蛋白的組成成分。越來(lái)越多的研究表明,許多種核糖體蛋白除組成核糖體,參與蛋白質(zhì)的生物合成之外,還具有獨(dú)立于蛋白質(zhì)生物合成的作用,例如參與DNA修復(fù)、細(xì)胞發(fā)育調(diào)控和細(xì)胞分化等核糖體外功能;并且在胃癌、結(jié)直腸癌、食管癌和肝癌等腫瘤組織中一些核糖體蛋白基因高表達(dá)。這些sORFs及其編碼的多肽在對(duì)蝦免疫防御中有什么功能?為了回答這個(gè)問(wèn)題,本論文開(kāi)展了 sORFs在對(duì)蝦免疫反應(yīng)中的功能研究。首先,我們通過(guò)組織分布以及表達(dá)模式對(duì)篩選的sORF進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)它們?cè)谒鶛z測(cè)的各種對(duì)蝦組織中均有分布,并在WSSV刺激后呈... 

【文章來(lái)源】：山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】：70 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖１．?１對(duì)蝦和果蠅Ｔｏｌｌ通路的比較（Ｌｉ?＆?Ｘｉａｎｇ，２０１３）

２．?３抗菌肽??在對(duì)蝦中，ＡＭＰ作為免疫反應(yīng)的產(chǎn)物，在直接殺死或清除感染的病原面發(fā)揮重要作用（Ｂａｃｈｅｒｅｅｔａｌ．，２００４）。自從在凡納濱對(duì)蝦中發(fā)現(xiàn)了對(duì)革蘭性細(xì)菌和真菌具有抗菌活性的對(duì)４下素（ｐｅｎａｅｉｄｉｎｓ）以來(lái)（Ｄｅｓｔｏｕｍｉｅｕｘ?ｅｔ１９９７），到目前為止，對(duì)蝦中已有不同類(lèi)型的抗微生物肽或蛋白質(zhì)被報(bào)道。ｐｅｎａｅｉｄｉｎｓ?之外，還有?Ｃｒｕｓｔｉｎｓ?和抗脂多糖因子（Ａｎｔｉｌｉｐｏｐｏｌｙｓａｃｃｈａｒｉｄｅ?ｆａｃｔｏＡＬＦ）等。研究發(fā)現(xiàn)，來(lái)自中國(guó)對(duì)蝦的重組Ｃｒｕｓｔｉｎｓ可以在體外抑制革蘭氏菌的生長(zhǎng)（Ｓｕｎｅｔａｌ．，?２０１０）。??２．４酚氣化酶原級(jí)聯(lián)反應(yīng)??黑化作用是無(wú)脊椎動(dòng)物中宿主防御的重要方面，其由響應(yīng)于病原性感染氧化酶活化系統(tǒng)控制。在對(duì)蝦中，黑化作用在防御多種包括鰻弧菌??

３．?３七種ｓＯＲＦ的表達(dá)模式分析??為了檢測(cè)這七種ｓＯＲＦ是否會(huì)在ＷＳＳＶ感染日本囊對(duì)蝦的過(guò)程中發(fā)揮作用，??我們用ｑＰＣＲ檢測(cè)了這七種基因在ＷＳＳＶ刺激的不同時(shí)間點(diǎn)的表達(dá)情況。圖２．３??表示的是這七種基因在血細(xì)胞中表達(dá)模式。由圖中可以看出，婦ＳＵＭＯ－１，??婦ＳＵＭＯ－３，邱＇ＲＰＳ２８，均ＲＰＳ２７，功ＴＩＰＬ３８，姆ＡＣＢＤ６?在?ＷＳＳＶ?刺激后有明??顯的上調(diào)表現(xiàn)，表明這幾個(gè)基因?qū)τ冢祝樱樱指腥救毡灸覍?duì)蝦都有不同程度的響??應(yīng)。而ｉｌ＾ＲＰＳ２７在ＷＳＳＶ刺激時(shí)，有明顯的上調(diào)表達(dá)及顯著性差異，因此我們??選定邱ＲＰＳ２７作為進(jìn)一步研究的基因。??２０??


本文編號(hào)：3271552