克氏原螯蝦兩種SOD基因克隆與功能研究
發(fā)布時(shí)間:2021-06-09 04:22
克氏原螯蝦(Procambarus clarkii)已發(fā)展成為最具特色、最具潛力的水產(chǎn)養(yǎng)殖新品種之一。但近些年暴發(fā)的螺原體疫病給克氏原螯蝦這一正處于高速發(fā)展期的養(yǎng)殖品種帶來了重大損失。中華絨螯蟹螺原體(Spiroplasma eriocheiris)作為一種新型的水產(chǎn)病原,除了引起中華絨螯蟹“顫抖病”外,還引起克氏原螯蝦的嚴(yán)重病害,已成為嚴(yán)重危害我國克氏原螯蝦等淡水蝦蟹養(yǎng)殖的重要病原,此外,嗜水氣單胞菌(Aeromonas hydrophila)是水產(chǎn)常見病菌,開展此類病原微生物的研究不僅具有理論價(jià)值,而且可以為生產(chǎn)實(shí)際中的病害防治提供理論依據(jù)和實(shí)用技術(shù),對(duì)我國水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)的可持續(xù)發(fā)展具有重要意義。SOD(Superoxide Dismutase)的中文名稱超氧化物歧化酶,是生物體內(nèi)重要的抗氧化物酶,廣泛分布于各種生物體內(nèi)。本文從克氏原螯蝦血細(xì)胞中分別克隆得到的胞外型銅鋅超氧化物歧化酶和線粒體型錳超氧化物歧化酶兩種基因,并研究克氏原螯蝦在不同病原菌(中華絨螯蟹螺原體和嗜水氣單胞菌)刺激下這兩種SOD的mRNA轉(zhuǎn)錄水平上和蛋白水平上的變化,從而揭示克氏原螯蝦體內(nèi)的SOD參與抗病菌的作用。1...
【文章來源】:南京師范大學(xué)江蘇省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:66 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
ecCuZnSOD的氨基酸序列分析及同源比對(duì)
第三章克氏原整奸mtMnSOD的克隆及序列分析 3.2intMnSOD的氨基酸序列的同源對(duì)比和系統(tǒng)發(fā)育分析將獲得的基因的氨基酸序列與己知的其他物種的相對(duì)應(yīng)的蛋白序列進(jìn)行比對(duì),發(fā)現(xiàn)克氏原螯奸的mtMnSOD與其余的已知物種的相似度很高。mtMnSOD具有典型的猛超氧化物歧化酶結(jié)構(gòu)域(DVWEHAYY)和四個(gè)保守的氨基酸構(gòu)成的猛離子結(jié)合位點(diǎn)(His 48, His 96,Asp 180 和 His 184)(圖 3-2)?耸显閙tMnSOD的氨基酸序列與紅鰲螯奸、岸蟹、羅氏沼奸、鋸緣青蟹和中國明對(duì)好的mtMnSOD的蛋白序列相似度依次為87%,85%, 84%,83%和82%。系統(tǒng)發(fā)育分析表明MnSODs也可以分為兩個(gè)不同的群:mtMnSOD和cytMnSOD?耸显閙tMnSOD與其他的甲殼類動(dòng)物的mtMnSOD是有點(diǎn)接近的,但與甲殼動(dòng)物的cytMnSODs的親緣性比較遠(yuǎn)。(圖3-3)
突光定量PCR分別檢測兩種SOD基因在克氏原螯奸心、肝胰腺、神經(jīng)、腸、肌肉、鰓和胃7個(gè)組織中的基因轉(zhuǎn)錄水平的變化,P-actin作為內(nèi)參。如圖4.1示,兩種基因在七個(gè)組織中均有廣泛的表達(dá),ecCuZnSOD在不同組織中表達(dá)趨勢與mtMnSOD是類似的。ecCuZnSOD和mtMnSOD的mRNA在觸、血細(xì)胞和肝胰腺中高表達(dá),而在肌肉、心、胃、腸和神經(jīng)組織中表達(dá)水平相對(duì)較低。33
本文編號(hào):3219918
【文章來源】:南京師范大學(xué)江蘇省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:66 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
ecCuZnSOD的氨基酸序列分析及同源比對(duì)
第三章克氏原整奸mtMnSOD的克隆及序列分析 3.2intMnSOD的氨基酸序列的同源對(duì)比和系統(tǒng)發(fā)育分析將獲得的基因的氨基酸序列與己知的其他物種的相對(duì)應(yīng)的蛋白序列進(jìn)行比對(duì),發(fā)現(xiàn)克氏原螯奸的mtMnSOD與其余的已知物種的相似度很高。mtMnSOD具有典型的猛超氧化物歧化酶結(jié)構(gòu)域(DVWEHAYY)和四個(gè)保守的氨基酸構(gòu)成的猛離子結(jié)合位點(diǎn)(His 48, His 96,Asp 180 和 His 184)(圖 3-2)?耸显閙tMnSOD的氨基酸序列與紅鰲螯奸、岸蟹、羅氏沼奸、鋸緣青蟹和中國明對(duì)好的mtMnSOD的蛋白序列相似度依次為87%,85%, 84%,83%和82%。系統(tǒng)發(fā)育分析表明MnSODs也可以分為兩個(gè)不同的群:mtMnSOD和cytMnSOD?耸显閙tMnSOD與其他的甲殼類動(dòng)物的mtMnSOD是有點(diǎn)接近的,但與甲殼動(dòng)物的cytMnSODs的親緣性比較遠(yuǎn)。(圖3-3)
突光定量PCR分別檢測兩種SOD基因在克氏原螯奸心、肝胰腺、神經(jīng)、腸、肌肉、鰓和胃7個(gè)組織中的基因轉(zhuǎn)錄水平的變化,P-actin作為內(nèi)參。如圖4.1示,兩種基因在七個(gè)組織中均有廣泛的表達(dá),ecCuZnSOD在不同組織中表達(dá)趨勢與mtMnSOD是類似的。ecCuZnSOD和mtMnSOD的mRNA在觸、血細(xì)胞和肝胰腺中高表達(dá),而在肌肉、心、胃、腸和神經(jīng)組織中表達(dá)水平相對(duì)較低。33
本文編號(hào):3219918
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