大菱鲆（Scophthalmus maximus）屬于鰈形目、鲆科、菱鲆屬,二十世紀(jì)九十年―跨洋引種‖引入我國(guó),大菱鲆對(duì)夏季高溫耐受能力較差。因受水溫條件限制,我國(guó)北方主要采用―養(yǎng)殖大棚+深井海水‖模式進(jìn)行養(yǎng)殖,但近年來(lái),隨著地下海水的匱乏、南北接力養(yǎng)殖模式的出現(xiàn),養(yǎng)殖生產(chǎn)中對(duì)大菱鲆耐高溫新品種的需求日益增加。另外,隨著分子技術(shù)的發(fā)展,應(yīng)用分子生物學(xué)手段,加快開展大菱鲆耐熱性狀的分子機(jī)制研究,對(duì)于培育耐高溫的養(yǎng)殖品種具有較大的研究意義。本研究論文通過(guò)高通量測(cè)序手段,建立了大菱鲆熱應(yīng)激條件下腎臟轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù),其中泛素蛋白酶體系相關(guān)的差異基因被顯著富集,對(duì)關(guān)鍵基因開展分子克隆及功能驗(yàn)證,對(duì)于熱應(yīng)激分子機(jī)制研究提供數(shù)據(jù)參考及理論支持;同時(shí)在本實(shí)驗(yàn)室獲得的耐高溫QTL基礎(chǔ)上,開展共享QTL標(biāo)記挖掘,為分子標(biāo)記育種研究提供可靠的標(biāo)記基礎(chǔ)。具體研究結(jié)果如下:1.為探索大菱鲆耐高溫的分子機(jī)制,篩選耐高溫相關(guān)基因,采用高通量測(cè)序平臺(tái)（IlluminaHiSeq-2500）分別對(duì)5個(gè)不同高溫處理組的大菱鲆腎臟進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,進(jìn)行生物信息學(xué)分析,包括GO（基因功能注釋）、SSR（簡(jiǎn)單重復(fù)序列）分析等。獲得... 

【文章來(lái)源】：上海海洋大學(xué)上海市

【文章頁(yè)數(shù)】：62 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

Unigene長(zhǎng)度分布圖

Unigenes的GO功能分類圖

圖 2-5 Unigenes 的 KOG 功能分類Fig 2-5 KOG function classification of unigenes2.2.6 Unigenes 的 KEGG 分析結(jié)合 KEGG 數(shù)據(jù)庫(kù)注釋信息，進(jìn)一步將大菱鲆腎臟 Unigenes 進(jìn)行 pathway注釋，其中有 15488 個(gè) unigenes 獲得對(duì)應(yīng)的 Ko 編號(hào)，歸屬于 218 條代謝通路，分類為 5 類 KEGG 途徑：代謝途徑、遺傳信息處理、細(xì)胞過(guò)程、環(huán)境信息和生物系統(tǒng)。其中，代謝途徑主要包括碳水化合物代謝通路、氨基酸代謝通路、能量代謝通路、脂類代謝通路，核苷酸代謝通路等，占據(jù) KO 注釋 unigenes 的 25.4%（3941 條）；遺傳信息處理主要包括翻譯，折疊、分選和相互作用，轉(zhuǎn)錄，復(fù)制和修復(fù)等，共注釋到 1907 條 unigenes，占 12.3%；細(xì)胞過(guò)程主要由轉(zhuǎn)運(yùn)和代謝作用，細(xì)胞生長(zhǎng)與死亡，運(yùn)輸分解代謝，細(xì)胞連接等組成，共注釋到 2927 條unigenes，占 18.9%；環(huán)境信息主要包括信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)，信號(hào)分子與相互作用，共注釋 3230 條 unigenes，占 20.8%；此外 2161 條 unigenes 被注釋到生物系統(tǒng)中�；驍�(shù)量

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號(hào)：3212710