5個羅氏沼蝦群體微衛(wèi)星遺傳多樣性分析
發(fā)布時間:2021-04-21 15:21
選用9對微衛(wèi)星引物,利用毛細管電泳熒光檢測技術(shù)對收集和引進的羅氏沼蝦以色列群體、緬甸群體、孟加拉群體、核心群體和泰國群體共計127個個體的遺傳多樣性進行分析,進一步明確了4個地方群體與核心群體之間的遺傳差異和親緣關(guān)系,可為優(yōu)良種質(zhì)的創(chuàng)制和新品種選育提供參考。研究表明,9對引物在127個樣品DNA中共擴增出70個等位位點,平均每對引物為7.777 8個。5個群體遺傳相似系數(shù)為0.367 4~0.796 5,平均遺傳相似系數(shù)為0.554 1;其中孟加拉群體和核心親緣關(guān)系最近(相似系數(shù)為0.796 5),孟加拉群體和以色列親緣關(guān)系最遠(相似系數(shù)為0.367 4)。研究結(jié)果表明,這5個地理種群總體遺傳多樣性較高,各群體之間的親緣關(guān)系為后續(xù)雜交育種提供理論依據(jù)。
【文章來源】:浙江農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,61(11)
【文章頁數(shù)】:5 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 樣品采集
1.2 基因組DNA提取
1.3 微衛(wèi)星引物設(shè)計與合成
1.4 PCR擴增
1.5 數(shù)據(jù)處理與分析
2 結(jié)果與分析
2.1 9個微衛(wèi)星座位遺傳多態(tài)性
2.2 群體內(nèi)遺傳多態(tài)性
2.3 微衛(wèi)星座位遺傳分化
2.4 群體間遺傳距離
2.5 群體遺傳結(jié)構(gòu)
3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]楸樹SSR標(biāo)記在滇楸中的可轉(zhuǎn)移性與應(yīng)用[J]. 彭嬋,陳慧玲,張新葉,樊孝萍,麻文俊. 東北林業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2019(02)
[2]寬體金線蛭基因組SSR序列特征分析及其分子標(biāo)記開發(fā)[J]. 熊良偉,王帥兵,岳麗佳,王建國,陶桂慶,徐亮,王權(quán). 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2018(11)
[3]羅氏沼蝦轉(zhuǎn)錄組SSR標(biāo)記信息分析[J]. 王傳聰,唐修陽,項杰,歐江濤. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(22)
[4]基于SSR分子標(biāo)記的高丹草遺傳圖譜構(gòu)建及相關(guān)性狀QTL定位[J]. 于肖夏,南志標(biāo),于卓,楊東升,謝銳,石悅,吳國芳. 分子植物育種. 2018(16)
[5]辣椒種質(zhì)表型性狀與SSR分子標(biāo)記的遺傳多樣性分析[J]. 傅鴻妃,呂曉菡,陳建瑛,李國景. 核農(nóng)學(xué)報. 2018(07)
[6]重金屬對羅氏沼蝦血細胞活性和酯酶活力的影響[J]. 郭慧,張秀霞,鄭佩華,魯耀鵬,冼健安. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2017(05)
[7]遼寧地區(qū)綠豆品種SSR指紋圖譜構(gòu)建及品種鑒定[J]. 趙雅楠,王穎,張東杰. 食品科學(xué). 2018(06)
[8]羅氏沼蝦種群SSR分析中樣本量及標(biāo)記量對遺傳多樣性指標(biāo)的影響[J]. 戴習(xí)林,劉潔,李晶晶,江宗冰,明磊,蔣飛. 水產(chǎn)學(xué)報. 2017(07)
[9]基于遺傳連鎖圖譜篩選蝦夷扇貝性別相關(guān)AFLP分子標(biāo)記的方法[J]. 周麗青,楊愛國,劉志鴻,王清印,吳彪,孫秀俊,鄭利兵,鄭言鑫. 漁業(yè)科學(xué)進展. 2014(06)
[10]羅氏沼蝦5個專門化品系選擇系生長比較及其遺傳結(jié)構(gòu)分析[J]. 蔣飛,戴習(xí)林,朱其建,過正乾,蘇建,鞠波,丁福江. 上海海洋大學(xué)學(xué)報. 2014(03)
碩士論文
[1]凡納濱對蝦群體親緣關(guān)系鑒定及生長性狀遺傳標(biāo)記篩選、優(yōu)化和驗證[D]. 李鵬.上海海洋大學(xué) 2017
[2]日本沼蝦4個野生群體形態(tài)學(xué)(體征)分析及遺傳多樣性研究[D]. 武小斌.河北大學(xué) 2017
[3]三個不同地理野生群體日本沼蝦遺傳多樣性的SSR分析[D]. 夏建海.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[4]青蝦高多態(tài)性EST-SSR標(biāo)記的篩選及遺傳多樣性的研究[D]. 周巧.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[5]不同地理種群羅氏沼蝦雜交效應(yīng)及遺傳多樣性分析[D]. 周勁松.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006
本文編號:3152005
【文章來源】:浙江農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,61(11)
【文章頁數(shù)】:5 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 樣品采集
1.2 基因組DNA提取
1.3 微衛(wèi)星引物設(shè)計與合成
1.4 PCR擴增
1.5 數(shù)據(jù)處理與分析
2 結(jié)果與分析
2.1 9個微衛(wèi)星座位遺傳多態(tài)性
2.2 群體內(nèi)遺傳多態(tài)性
2.3 微衛(wèi)星座位遺傳分化
2.4 群體間遺傳距離
2.5 群體遺傳結(jié)構(gòu)
3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]楸樹SSR標(biāo)記在滇楸中的可轉(zhuǎn)移性與應(yīng)用[J]. 彭嬋,陳慧玲,張新葉,樊孝萍,麻文俊. 東北林業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2019(02)
[2]寬體金線蛭基因組SSR序列特征分析及其分子標(biāo)記開發(fā)[J]. 熊良偉,王帥兵,岳麗佳,王建國,陶桂慶,徐亮,王權(quán). 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2018(11)
[3]羅氏沼蝦轉(zhuǎn)錄組SSR標(biāo)記信息分析[J]. 王傳聰,唐修陽,項杰,歐江濤. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(22)
[4]基于SSR分子標(biāo)記的高丹草遺傳圖譜構(gòu)建及相關(guān)性狀QTL定位[J]. 于肖夏,南志標(biāo),于卓,楊東升,謝銳,石悅,吳國芳. 分子植物育種. 2018(16)
[5]辣椒種質(zhì)表型性狀與SSR分子標(biāo)記的遺傳多樣性分析[J]. 傅鴻妃,呂曉菡,陳建瑛,李國景. 核農(nóng)學(xué)報. 2018(07)
[6]重金屬對羅氏沼蝦血細胞活性和酯酶活力的影響[J]. 郭慧,張秀霞,鄭佩華,魯耀鵬,冼健安. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2017(05)
[7]遼寧地區(qū)綠豆品種SSR指紋圖譜構(gòu)建及品種鑒定[J]. 趙雅楠,王穎,張東杰. 食品科學(xué). 2018(06)
[8]羅氏沼蝦種群SSR分析中樣本量及標(biāo)記量對遺傳多樣性指標(biāo)的影響[J]. 戴習(xí)林,劉潔,李晶晶,江宗冰,明磊,蔣飛. 水產(chǎn)學(xué)報. 2017(07)
[9]基于遺傳連鎖圖譜篩選蝦夷扇貝性別相關(guān)AFLP分子標(biāo)記的方法[J]. 周麗青,楊愛國,劉志鴻,王清印,吳彪,孫秀俊,鄭利兵,鄭言鑫. 漁業(yè)科學(xué)進展. 2014(06)
[10]羅氏沼蝦5個專門化品系選擇系生長比較及其遺傳結(jié)構(gòu)分析[J]. 蔣飛,戴習(xí)林,朱其建,過正乾,蘇建,鞠波,丁福江. 上海海洋大學(xué)學(xué)報. 2014(03)
碩士論文
[1]凡納濱對蝦群體親緣關(guān)系鑒定及生長性狀遺傳標(biāo)記篩選、優(yōu)化和驗證[D]. 李鵬.上海海洋大學(xué) 2017
[2]日本沼蝦4個野生群體形態(tài)學(xué)(體征)分析及遺傳多樣性研究[D]. 武小斌.河北大學(xué) 2017
[3]三個不同地理野生群體日本沼蝦遺傳多樣性的SSR分析[D]. 夏建海.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[4]青蝦高多態(tài)性EST-SSR標(biāo)記的篩選及遺傳多樣性的研究[D]. 周巧.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[5]不同地理種群羅氏沼蝦雜交效應(yīng)及遺傳多樣性分析[D]. 周勁松.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006
本文編號:3152005
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